More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2440 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  41 
 
 		 1162 aa  664    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2440  chromosome segregation SMC protein  100 
 
 		 1109 aa  2172    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129774  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  41.59 
 
 		 1162 aa  713    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  40.27 
 
 		 1162 aa  697    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  42.84 
 
 		 1162 aa  743    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  36.89 
 
 		 1164 aa  636    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  36.88 
 
 		 1164 aa  642    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  40.23 
 
 		 1163 aa  692    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  40.83 
 
 		 1162 aa  692    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  40.68 
 
 		 1162 aa  656    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  39.91 
 
 		 1167 aa  708    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  39.5 
 
 		 1167 aa  686    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  40.39 
 
 		 1162 aa  673    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  40.73 
 
 		 1162 aa  661    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  39.63 
 
 		 1169 aa  736    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  38.94 
 
 		 1169 aa  731    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  39.59 
 
 		 1167 aa  685    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  40.02 
 
 		 1168 aa  731    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  39.88 
 
 		 1167 aa  682    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  41.49 
 
 		 1164 aa  666    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  42.07 
 
 		 1164 aa  649    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  40.79 
 
 		 1162 aa  665    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  43.38 
 
 		 1162 aa  726    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  43.22 
 
 		 1168 aa  746    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  43.02 
 
 		 1168 aa  649    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  42.56 
 
 		 1162 aa  738    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  36.21 
 
 		 1145 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  35.76 
 
 		 1164 aa  599  1e-170  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  38.14 
 
 		 1142 aa  601  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  34.98 
 
 		 1195 aa  602  1e-170  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  37.54 
 
 		 1142 aa  597  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  36.92 
 
 		 1142 aa  593  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  36.74 
 
 		 1145 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  36.05 
 
 		 1133 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  39.2 
 
 		 1165 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  35.43 
 
 		 1138 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  35.43 
 
 		 1138 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  35.17 
 
 		 1138 aa  572  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  35.16 
 
 		 1138 aa  568  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  36.55 
 
 		 1171 aa  567  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  37.75 
 
 		 1171 aa  558  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  35.79 
 
 		 1138 aa  553  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  38.11 
 
 		 1171 aa  552  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  36.89 
 
 		 1139 aa  552  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1334  chromosome segregation protein SMC  36.83 
 
 		 1171 aa  544  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0218063  normal  0.637516 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  37.3 
 
 		 1206 aa  534  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  37.76 
 
 		 1175 aa  534  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  36.81 
 
 		 1198 aa  529  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  37.1 
 
 		 1268 aa  525  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  36.55 
 
 		 1198 aa  524  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  35.41 
 
 		 1175 aa  521  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  34.86 
 
 		 1173 aa  519  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  36.39 
 
 		 1174 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  34.69 
 
 		 1152 aa  514  1e-144  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  36.39 
 
 		 1174 aa  515  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  35.57 
 
 		 1171 aa  502  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  36.95 
 
 		 1171 aa  497  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2192  chromosome segregation protein SMC  36.68 
 
 		 1234 aa  492  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  36 
 
 		 1190 aa  489  1e-136  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  34.36 
 
 		 1182 aa  485  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  33.8 
 
 		 1176 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  41.07 
 
 		 1170 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  33.42 
 
 		 1175 aa  439  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  32.22 
 
 		 1177 aa  423  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  33.39 
 
 		 1150 aa  420  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  33.39 
 
 		 1150 aa  420  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  33.19 
 
 		 1173 aa  411  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  34.09 
 
 		 1167 aa  413  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  32.89 
 
 		 1199 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  33.45 
 
 		 1199 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 		 1199 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  28.32 
 
 		 1185 aa  385  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  31.59 
 
 		 1403 aa  373  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  29.57 
 
 		 1187 aa  372  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  29.27 
 
 		 1204 aa  368  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  31.56 
 
 		 1187 aa  361  4e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  30.53 
 
 		 1308 aa  358  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  28.97 
 
 		 1189 aa  355  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  26.52 
 
 		 1191 aa  354  5.9999999999999994e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  28.91 
 
 		 1189 aa  349  2e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  29.16 
 
 		 1189 aa  347  5e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  26.2 
 
 		 1196 aa  342  2e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  28.56 
 
 		 1189 aa  342  2e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  27.71 
 
 		 1178 aa  342  2e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  27.86 
 
 		 1186 aa  340  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  28.3 
 
 		 1189 aa  339  1.9999999999999998e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1736  chromosome segregation protein SMC  36.51 
 
 		 814 aa  339  1.9999999999999998e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00195971  unclonable  0.00000000014199 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  35.49 
 
 		 1170 aa  338  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  35.49 
 
 		 1170 aa  338  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  28.33 
 
 		 1189 aa  337  5e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  28.3 
 
 		 1189 aa  337  5e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  28.33 
 
 		 1189 aa  337  5e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  35.54 
 
 		 1170 aa  337  7e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  28.34 
 
 		 1189 aa  337  7e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  28.34 
 
 		 1189 aa  337  7e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  28.13 
 
 		 1189 aa  336  1e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  35.48 
 
 		 1170 aa  336  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  27.15 
 
 		 1190 aa  335  2e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  39.85 
 
 		 1170 aa  336  2e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  54.8 
 
 		 1165 aa  335  3e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>