More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4276 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  40.7 
 
 		 1200 aa  681    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1162 aa  2298    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  44.54 
 
 		 1169 aa  927    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  41.18 
 
 		 1138 aa  746    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2440  chromosome segregation SMC protein  41.36 
 
 		 1109 aa  670    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129774  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  42.32 
 
 		 1140 aa  755    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  41.98 
 
 		 1145 aa  756    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  80.81 
 
 		 1162 aa  1826    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  41.8 
 
 		 1138 aa  746    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  42.94 
 
 		 1164 aa  759    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  37.62 
 
 		 1204 aa  639    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  40.78 
 
 		 1170 aa  682    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  39.38 
 
 		 1164 aa  744    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  39.15 
 
 		 1164 aa  747    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  80.64 
 
 		 1162 aa  1795    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  38.84 
 
 		 1167 aa  675    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  38.42 
 
 		 1171 aa  696    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  38.03 
 
 		 1181 aa  650    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  40 
 
 		 1165 aa  691    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  39.69 
 
 		 1175 aa  685    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  40.26 
 
 		 1268 aa  686    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  48.87 
 
 		 1170 aa  951    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  80.46 
 
 		 1162 aa  1763    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  39.75 
 
 		 1170 aa  689    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  39.2 
 
 		 1170 aa  666    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  54.06 
 
 		 1163 aa  1096    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  39.38 
 
 		 1170 aa  681    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  80.72 
 
 		 1162 aa  1766    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  40.76 
 
 		 1170 aa  676    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  40.65 
 
 		 1198 aa  698    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  40.87 
 
 		 1170 aa  685    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  38.68 
 
 		 1175 aa  672    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  92.77 
 
 		 1162 aa  2024    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  39.04 
 
 		 1171 aa  656    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  57.89 
 
 		 1168 aa  1254    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  39.21 
 
 		 1172 aa  697    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  37.86 
 
 		 1182 aa  660    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  41.28 
 
 		 1198 aa  706    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  38.18 
 
 		 1175 aa  658    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  37.77 
 
 		 1171 aa  645    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  47.95 
 
 		 1164 aa  900    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  42.15 
 
 		 1145 aa  776    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  47.79 
 
 		 1167 aa  922    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  38.69 
 
 		 1171 aa  711    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  44.62 
 
 		 1169 aa  922    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  41.72 
 
 		 1138 aa  744    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  46.68 
 
 		 1167 aa  927    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  41.3 
 
 		 1141 aa  743    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  39.88 
 
 		 1170 aa  697    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  40.1 
 
 		 1170 aa  697    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  43.8 
 
 		 1164 aa  846    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  96.9 
 
 		 1162 aa  2083    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  38.99 
 
 		 1171 aa  696    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  46.22 
 
 		 1167 aa  910    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  42.62 
 
 		 1142 aa  772    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  42.8 
 
 		 1142 aa  779    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  47.74 
 
 		 1168 aa  867    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  52.01 
 
 		 1168 aa  1052    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  40.87 
 
 		 1170 aa  685    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  38.59 
 
 		 1173 aa  684    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2059  chromosome segregation protein SMC  38.95 
 
 		 1142 aa  643    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365444  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  77.88 
 
 		 1162 aa  1734    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  74.96 
 
 		 1162 aa  1608    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  77.37 
 
 		 1162 aa  1723    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  39.54 
 
 		 1206 aa  672    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  42.57 
 
 		 1133 aa  780    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  39.88 
 
 		 1170 aa  698    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  47.01 
 
 		 1165 aa  813    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  43.23 
 
 		 1142 aa  781    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  99.23 
 
 		 1162 aa  2283    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  40.7 
 
 		 1202 aa  681    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  40.91 
 
 		 1170 aa  684    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  42.39 
 
 		 1139 aa  752    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  46.13 
 
 		 1167 aa  908    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  38.56 
 
 		 1174 aa  635  1e-180  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  38.2 
 
 		 1190 aa  635  1e-180  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  37.72 
 
 		 1152 aa  635  1e-180  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1401  condensin subunit Smc  37.27 
 
 		 1168 aa  635  1e-180  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.934786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  38.51 
 
 		 1174 aa  632  1e-179  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  35.6 
 
 		 1167 aa  543  1e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  35.17 
 
 		 1150 aa  527  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  35.17 
 
 		 1150 aa  527  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  34.14 
 
 		 1176 aa  499  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  32.84 
 
 		 1176 aa  498  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  33.71 
 
 		 1175 aa  490  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  34.51 
 
 		 1177 aa  492  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  33.53 
 
 		 1176 aa  490  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  34.01 
 
 		 1173 aa  491  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  35.03 
 
 		 1176 aa  491  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  33.01 
 
 		 1176 aa  486  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  30.58 
 
 		 1204 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  30.2 
 
 		 1185 aa  452  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  31.16 
 
 		 1187 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  45.77 
 
 		 1195 aa  429  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  28.21 
 
 		 1185 aa  409  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  28.4 
 
 		 1148 aa  408  1.0000000000000001e-112  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  30.1 
 
 		 1174 aa  408  1.0000000000000001e-112  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  31.13 
 
 		 1198 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  29.12 
 
 		 1189 aa  403  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  42.42 
 
 		 1138 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>