More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2068 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  36.83 
 
 		 1189 aa  655    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  36.67 
 
 		 1189 aa  660    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  36.82 
 
 		 1189 aa  668    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  36.58 
 
 		 1189 aa  655    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  36.92 
 
 		 1189 aa  657    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  36.91 
 
 		 1189 aa  659    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  36.61 
 
 		 1189 aa  669    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  37.12 
 
 		 1187 aa  686    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  36.53 
 
 		 1190 aa  674    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  36.58 
 
 		 1189 aa  655    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  36.67 
 
 		 1189 aa  660    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1186 aa  2400    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  38.39 
 
 		 1198 aa  671    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  37.7 
 
 		 1189 aa  671    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  37.42 
 
 		 1189 aa  674    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  36.93 
 
 		 1190 aa  699    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  35.48 
 
 		 1196 aa  665    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  37.75 
 
 		 1187 aa  716    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  34.09 
 
 		 1188 aa  620  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  34.09 
 
 		 1188 aa  620  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  33.96 
 
 		 1191 aa  619  1e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  33.23 
 
 		 1189 aa  612  1e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  35.4 
 
 		 1185 aa  599  1e-169  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  33.61 
 
 		 1185 aa  588  1e-166  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  32.76 
 
 		 1185 aa  579  1e-164  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  33.61 
 
 		 1179 aa  572  1e-161  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  32.06 
 
 		 1177 aa  566  1e-160  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  34.09 
 
 		 1199 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  34.09 
 
 		 1199 aa  562  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  34.09 
 
 		 1199 aa  562  1e-158  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  32.19 
 
 		 1187 aa  557  1e-157  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  33.31 
 
 		 1174 aa  558  1e-157  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  32.64 
 
 		 1186 aa  554  1e-156  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  32.96 
 
 		 1184 aa  540  9.999999999999999e-153  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  33.42 
 
 		 1176 aa  537  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  31.74 
 
 		 1191 aa  539  1e-151  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  33.2 
 
 		 1177 aa  536  1e-151  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  33.09 
 
 		 1176 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  31.94 
 
 		 1175 aa  509  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  32.76 
 
 		 1176 aa  504  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  32.68 
 
 		 1177 aa  491  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  32.79 
 
 		 1173 aa  488  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  30.95 
 
 		 1181 aa  473  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  30.38 
 
 		 1177 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  28.78 
 
 		 1172 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  30.4 
 
 		 1186 aa  466  1e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  30.94 
 
 		 1204 aa  452  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  30.49 
 
 		 1255 aa  452  1e-125  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  30.53 
 
 		 1179 aa  452  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  29.51 
 
 		 1164 aa  444  1e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  30.66 
 
 		 1403 aa  437  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  28.87 
 
 		 1148 aa  438  1e-121  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  30.63 
 
 		 1179 aa  427  1e-118  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  29.84 
 
 		 1178 aa  429  1e-118  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  28.9 
 
 		 1167 aa  425  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  28.45 
 
 		 1170 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  28.41 
 
 		 1174 aa  415  1e-114  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  33.94 
 
 		 1190 aa  412  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  27.76 
 
 		 1176 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  29.98 
 
 		 1133 aa  405  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  29.39 
 
 		 1214 aa  403  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  33.37 
 
 		 1187 aa  398  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  27.5 
 
 		 1167 aa  393  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  28.58 
 
 		 1167 aa  394  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  27.42 
 
 		 1167 aa  391  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  26.64 
 
 		 1178 aa  392  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  29.61 
 
 		 1171 aa  381  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  27.96 
 
 		 1198 aa  379  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  29.09 
 
 		 1175 aa  378  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  28.54 
 
 		 1168 aa  373  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  27.8 
 
 		 1198 aa  372  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  29.44 
 
 		 1165 aa  371  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  27.63 
 
 		 1169 aa  370  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  29.09 
 
 		 1268 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  27.62 
 
 		 1153 aa  372  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  28.45 
 
 		 1181 aa  370  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  28.38 
 
 		 1134 aa  365  3e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  27.77 
 
 		 1164 aa  360  8e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  25.87 
 
 		 1171 aa  351  6e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  25.34 
 
 		 1174 aa  349  2e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  26.53 
 
 		 1184 aa  337  5.999999999999999e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  27.25 
 
 		 1175 aa  337  1e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  27.03 
 
 		 1152 aa  337  1e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  25.59 
 
 		 1174 aa  331  6e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  28.53 
 
 		 1308 aa  327  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  32.37 
 
 		 1185 aa  326  2e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1095  chromosome segregation protein  27.27 
 
 		 1153 aa  320  9e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  27.13 
 
 		 1189 aa  320  1e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  30.47 
 
 		 1175 aa  316  1.9999999999999998e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  25.28 
 
 		 1189 aa  309  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  24.65 
 
 		 1189 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  27.1 
 
 		 1219 aa  306  1.0000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  33.91 
 
 		 1201 aa  305  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  24.84 
 
 		 1189 aa  304  5.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  32.19 
 
 		 1191 aa  303  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  25.71 
 
 		 1189 aa  302  2e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  26.13 
 
 		 1188 aa  301  5e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  26.53 
 
 		 1146 aa  297  6e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  24.82 
 
 		 1193 aa  292  2e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  25.12 
 
 		 1146 aa  292  3e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>