More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3702 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  37.47 
 
 
1175 aa  651    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  40.71 
 
 
1199 aa  696    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 
1403 aa  2796    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  40.56 
 
 
1199 aa  695    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  40.71 
 
 
1199 aa  696    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  40.41 
 
 
1198 aa  691    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  37.49 
 
 
1176 aa  630  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  36.33 
 
 
1176 aa  616  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  38.64 
 
 
1176 aa  592  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  35.95 
 
 
1176 aa  587  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  36.86 
 
 
1176 aa  582  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  35.61 
 
 
1173 aa  548  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  35.26 
 
 
1177 aa  548  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  31.89 
 
 
1204 aa  480  1e-134  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  29.93 
 
 
1185 aa  477  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  29.29 
 
 
1196 aa  449  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  30.66 
 
 
1186 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  30.52 
 
 
1187 aa  449  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  30.52 
 
 
1189 aa  434  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  30.61 
 
 
1189 aa  435  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  29.2 
 
 
1190 aa  431  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  31.47 
 
 
1198 aa  433  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  30.11 
 
 
1189 aa  431  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  33.86 
 
 
1185 aa  430  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  30.8 
 
 
1189 aa  429  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  29.86 
 
 
1189 aa  425  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  29.72 
 
 
1189 aa  425  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  29.86 
 
 
1189 aa  424  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  29.72 
 
 
1189 aa  425  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  29.71 
 
 
1189 aa  422  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  29.71 
 
 
1189 aa  422  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  29.79 
 
 
1189 aa  423  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  30.15 
 
 
1185 aa  420  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  28.1 
 
 
1190 aa  415  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  31.43 
 
 
1187 aa  409  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  28.81 
 
 
1188 aa  404  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  28.81 
 
 
1188 aa  404  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  30.62 
 
 
1171 aa  396  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  27.94 
 
 
1185 aa  388  1e-106  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  30.56 
 
 
1171 aa  385  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  29.54 
 
 
1308 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  27.9 
 
 
1186 aa  387  1e-105  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  30.74 
 
 
1169 aa  382  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  29.25 
 
 
1185 aa  383  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  32.48 
 
 
1198 aa  382  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  31.27 
 
 
1169 aa  380  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  32.43 
 
 
1167 aa  383  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  31.81 
 
 
1175 aa  382  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  28.19 
 
 
1189 aa  379  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  31.83 
 
 
1170 aa  379  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  30.93 
 
 
1177 aa  377  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  26.15 
 
 
1191 aa  379  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  30.49 
 
 
1186 aa  378  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  31 
 
 
1162 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  28.64 
 
 
1187 aa  376  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  32.32 
 
 
1168 aa  375  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  31.13 
 
 
1139 aa  375  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  32.16 
 
 
1162 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  31.75 
 
 
1172 aa  373  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  32.78 
 
 
1268 aa  372  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  32.58 
 
 
1162 aa  373  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  31.94 
 
 
1198 aa  373  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  27.43 
 
 
1177 aa  368  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  32.38 
 
 
1170 aa  367  1e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  32.38 
 
 
1170 aa  365  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  30.28 
 
 
1171 aa  363  8e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  28.34 
 
 
1164 aa  362  3e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  33 
 
 
1168 aa  362  3e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  28.19 
 
 
1176 aa  360  9.999999999999999e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  31.69 
 
 
1170 aa  360  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  31.37 
 
 
1175 aa  357  1e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  30.55 
 
 
1174 aa  355  2e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  26.97 
 
 
1178 aa  355  4e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  29.04 
 
 
1164 aa  354  5.9999999999999994e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  29.29 
 
 
1178 aa  353  1e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  31.99 
 
 
1175 aa  352  2e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  28.61 
 
 
1174 aa  353  2e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  31.14 
 
 
1206 aa  352  4e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  29.02 
 
 
1179 aa  352  4e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  30.81 
 
 
1152 aa  350  1e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  30.13 
 
 
1182 aa  348  6e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  31.25 
 
 
1181 aa  347  8.999999999999999e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  28.27 
 
 
1170 aa  345  4e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  30.39 
 
 
1171 aa  344  5.999999999999999e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  30.11 
 
 
1174 aa  344  7e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  29.23 
 
 
1179 aa  342  2e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  28.4 
 
 
1170 aa  343  2e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  29.47 
 
 
1167 aa  340  9.999999999999999e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  29.47 
 
 
1167 aa  339  1.9999999999999998e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  27.77 
 
 
1184 aa  339  1.9999999999999998e-91  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  25.93 
 
 
1148 aa  328  6e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  29.92 
 
 
1190 aa  320  7.999999999999999e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  29.2 
 
 
1150 aa  318  5e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  29.2 
 
 
1150 aa  318  5e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  30.36 
 
 
1167 aa  317  8e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  28.01 
 
 
1177 aa  313  1e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  25.72 
 
 
1164 aa  301  6e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  28.51 
 
 
1179 aa  290  2e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  26.89 
 
 
1185 aa  283  2e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  26.7 
 
 
1185 aa  283  2e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>