More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0679 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  48.27 
 
 
1162 aa  895    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  37.25 
 
 
1204 aa  642    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  49.83 
 
 
1168 aa  989    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  45.18 
 
 
1167 aa  870    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  43.89 
 
 
1169 aa  889    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  40.54 
 
 
1145 aa  711    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  47.93 
 
 
1162 aa  934    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  40.18 
 
 
1170 aa  669    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  39.83 
 
 
1171 aa  672    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  41.23 
 
 
1170 aa  662    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  40.1 
 
 
1172 aa  658    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  41.01 
 
 
1170 aa  662    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  40.05 
 
 
1164 aa  742    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  39.8 
 
 
1164 aa  738    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  40.54 
 
 
1138 aa  727    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  48.18 
 
 
1162 aa  938    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  40.89 
 
 
1138 aa  722    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  40.45 
 
 
1167 aa  671    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  41.15 
 
 
1202 aa  659    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  40.54 
 
 
1145 aa  740    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  40.18 
 
 
1171 aa  679    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  39.62 
 
 
1175 aa  658    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  41.09 
 
 
1165 aa  706    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  48.99 
 
 
1162 aa  943    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  41.06 
 
 
1200 aa  659    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  41.31 
 
 
1268 aa  662    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  46.49 
 
 
1170 aa  843    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  47.4 
 
 
1162 aa  904    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  40.41 
 
 
1138 aa  721    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  41.14 
 
 
1170 aa  673    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  45.88 
 
 
1163 aa  881    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  48.06 
 
 
1162 aa  897    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  41.23 
 
 
1170 aa  662    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  39.46 
 
 
1175 aa  647    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  38.47 
 
 
1190 aa  666    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  47.59 
 
 
1162 aa  889    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  40.42 
 
 
1206 aa  663    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  40.98 
 
 
1170 aa  652    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  41.06 
 
 
1170 aa  659    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  47.79 
 
 
1162 aa  909    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  39.47 
 
 
1171 aa  642    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  45.58 
 
 
1168 aa  944    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  39.67 
 
 
1133 aa  699    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  41.03 
 
 
1198 aa  674    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  48.34 
 
 
1162 aa  904    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  58.02 
 
 
1165 aa  1098    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  45.99 
 
 
1164 aa  815    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  48.22 
 
 
1162 aa  922    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  46.05 
 
 
1167 aa  866    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  39.68 
 
 
1171 aa  681    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  41.01 
 
 
1170 aa  674    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  43.81 
 
 
1169 aa  887    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  41.09 
 
 
1170 aa  677    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  40.62 
 
 
1138 aa  722    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  40.84 
 
 
1175 aa  666    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  40.99 
 
 
1164 aa  787    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  38.11 
 
 
1195 aa  734    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  39.27 
 
 
1170 aa  647    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  39.01 
 
 
1174 aa  639    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  40.25 
 
 
1142 aa  732    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  40.44 
 
 
1142 aa  740    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 
1168 aa  2268    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  49.19 
 
 
1162 aa  947    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  40.3 
 
 
1198 aa  666    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  44.83 
 
 
1164 aa  788    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  45.35 
 
 
1167 aa  874    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  46.38 
 
 
1167 aa  884    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  41.17 
 
 
1170 aa  677    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  39.98 
 
 
1142 aa  740    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  39.98 
 
 
1140 aa  699    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  40.82 
 
 
1141 aa  696    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  41.57 
 
 
1139 aa  719    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1401  condensin subunit Smc  38.1 
 
 
1168 aa  635  1e-180  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.934786  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  38.89 
 
 
1174 aa  632  1e-180  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  36.66 
 
 
1173 aa  629  1e-179  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  39.06 
 
 
1181 aa  626  1e-178  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  38.01 
 
 
1171 aa  628  1e-178  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  38.01 
 
 
1182 aa  628  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2059  chromosome segregation protein SMC  39.53 
 
 
1142 aa  625  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365444  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  36.3 
 
 
1152 aa  586  1.0000000000000001e-165  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  36.12 
 
 
1176 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  35.78 
 
 
1150 aa  526  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  35.24 
 
 
1175 aa  523  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  35.78 
 
 
1150 aa  526  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  35.09 
 
 
1176 aa  525  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  35.52 
 
 
1176 aa  514  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  36.05 
 
 
1177 aa  515  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  33.77 
 
 
1176 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  35.86 
 
 
1176 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  34.96 
 
 
1173 aa  490  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  35.59 
 
 
1199 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  35.59 
 
 
1199 aa  472  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  35.63 
 
 
1199 aa  469  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  29.12 
 
 
1190 aa  438  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  30.35 
 
 
1187 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  28.66 
 
 
1185 aa  424  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  30.08 
 
 
1174 aa  422  1e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  28.46 
 
 
1191 aa  419  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  27.58 
 
 
1190 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  29.98 
 
 
1189 aa  405  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>