More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2516 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  47.96 
 
 		 1139 aa  939    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  52.84 
 
 		 1145 aa  1009    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  52.41 
 
 		 1138 aa  1017    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  37.54 
 
 		 1164 aa  658    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  36.88 
 
 		 1164 aa  650    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  39.62 
 
 		 1170 aa  658    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  51.68 
 
 		 1138 aa  1004    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  51.86 
 
 		 1138 aa  1008    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  49.44 
 
 		 1140 aa  947    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  39.52 
 
 		 1168 aa  712    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1138 aa  2292    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  38.73 
 
 		 1164 aa  714    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  50.47 
 
 		 1141 aa  961    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  36.39 
 
 		 1169 aa  649    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  42.42 
 
 		 1164 aa  756    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  36.39 
 
 		 1169 aa  649    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  52.23 
 
 		 1138 aa  1012    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  52.4 
 
 		 1142 aa  1027    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  52.51 
 
 		 1142 aa  1030    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  54.97 
 
 		 1144 aa  1076    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  51.26 
 
 		 1133 aa  1005    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  52.1 
 
 		 1142 aa  1024    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  52.3 
 
 		 1145 aa  1017    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  36.63 
 
 		 1167 aa  630  1e-179  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  37.5 
 
 		 1165 aa  629  1e-179  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  36.26 
 
 		 1175 aa  629  1e-178  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  36.75 
 
 		 1174 aa  616  1e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  36.24 
 
 		 1167 aa  619  1e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  36.17 
 
 		 1174 aa  618  1e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  36.62 
 
 		 1167 aa  612  9.999999999999999e-175  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  36.8 
 
 		 1167 aa  610  1e-173  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  37.35 
 
 		 1167 aa  611  1e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  36.62 
 
 		 1175 aa  612  1e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  36.54 
 
 		 1171 aa  609  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  36.3 
 
 		 1171 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  35.87 
 
 		 1171 aa  607  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  36.94 
 
 		 1181 aa  605  1.0000000000000001e-171  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  34.72 
 
 		 1182 aa  602  1.0000000000000001e-171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  36.3 
 
 		 1198 aa  600  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  36.51 
 
 		 1173 aa  598  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  36.37 
 
 		 1198 aa  595  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  35.58 
 
 		 1171 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1736  chromosome segregation protein SMC  43.57 
 
 		 814 aa  527  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00195971  unclonable  0.00000000014199 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  32.6 
 
 		 1167 aa  484  1e-135  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  30.68 
 
 		 1176 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1735  chromosome segregation protein SMC  76.51 
 
 		 299 aa  469  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  30.67 
 
 		 1176 aa  464  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  41.51 
 
 		 1162 aa  415  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  41.94 
 
 		 1195 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  28.62 
 
 		 1148 aa  405  1e-111  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  59.22 
 
 		 1162 aa  382  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  59.22 
 
 		 1162 aa  382  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  27.82 
 
 		 1185 aa  379  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  56.84 
 
 		 1162 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  59.18 
 
 		 1163 aa  377  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  56.92 
 
 		 1162 aa  376  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  57.23 
 
 		 1162 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  56.6 
 
 		 1162 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  37.86 
 
 		 1164 aa  366  1e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  65.68 
 
 		 1162 aa  358  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  65.38 
 
 		 1162 aa  357  8.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  36.11 
 
 		 1204 aa  356  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  69.8 
 
 		 1162 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  65 
 
 		 1162 aa  352  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  57.93 
 
 		 1168 aa  351  4e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  39.42 
 
 		 1168 aa  350  6e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  33.83 
 
 		 1175 aa  328  3e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1334  chromosome segregation protein SMC  49.4 
 
 		 1171 aa  325  4e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0218063  normal  0.637516 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  67.97 
 
 		 1165 aa  325  4e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2192  chromosome segregation protein SMC  37.46 
 
 		 1234 aa  324  5e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  34.81 
 
 		 1190 aa  323  9.999999999999999e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  49.4 
 
 		 1171 aa  321  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1401  condensin subunit Smc  38.2 
 
 		 1168 aa  317  9e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.934786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  58.14 
 
 		 1170 aa  317  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  57.41 
 
 		 1170 aa  317  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  39.01 
 
 		 1170 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  57.41 
 
 		 1170 aa  316  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  57.41 
 
 		 1170 aa  316  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  57.04 
 
 		 1170 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  57.75 
 
 		 1170 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  57.75 
 
 		 1170 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  49.26 
 
 		 1170 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  37.33 
 
 		 1170 aa  315  2.9999999999999996e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  57.75 
 
 		 1170 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  57.36 
 
 		 1200 aa  313  9e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  57.36 
 
 		 1268 aa  313  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  57.36 
 
 		 1202 aa  313  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  56.67 
 
 		 1206 aa  312  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  47.41 
 
 		 1172 aa  311  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2059  chromosome segregation protein SMC  53.93 
 
 		 1142 aa  302  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365444  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2440  chromosome segregation SMC protein  65.24 
 
 		 1109 aa  300  8e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129774  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  48.06 
 
 		 1152 aa  296  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0318  condensin subunit Smc  41.94 
 
 		 1307 aa  287  7e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0349  SMC protein-like  39.91 
 
 		 1318 aa  285  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0467  SMC domain-containing protein  54.04 
 
 		 1280 aa  281  5e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  37.94 
 
 		 1175 aa  277  7e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  34.19 
 
 		 1150 aa  276  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  34.19 
 
 		 1150 aa  275  4.0000000000000004e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  43 
 
 		 1176 aa  264  8e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  37.73 
 
 		 1177 aa  257  9e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>