More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0349 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0467  SMC domain-containing protein  47.33 
 
 		 1280 aa  1017    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0318  condensin subunit Smc  82.38 
 
 		 1307 aa  2145    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0349  SMC protein-like  100 
 
 		 1318 aa  2675    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  43.5 
 
 		 1195 aa  300  2e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  40.63 
 
 		 1164 aa  295  4e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  43.02 
 
 		 1162 aa  293  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  48.81 
 
 		 1162 aa  291  6e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  48.81 
 
 		 1162 aa  290  9e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  55.1 
 
 		 1144 aa  290  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  42.98 
 
 		 1162 aa  289  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  46.76 
 
 		 1162 aa  288  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  46.76 
 
 		 1162 aa  288  5e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  41.71 
 
 		 1142 aa  288  5e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  47.93 
 
 		 1162 aa  288  5e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  46.76 
 
 		 1162 aa  288  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  57.14 
 
 		 1142 aa  287  8e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  57.14 
 
 		 1142 aa  287  9e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  56.25 
 
 		 1133 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  57.14 
 
 		 1145 aa  285  4.0000000000000003e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  56.25 
 
 		 1138 aa  283  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  56.25 
 
 		 1138 aa  283  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  56.7 
 
 		 1145 aa  283  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  39.63 
 
 		 1164 aa  283  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  56.44 
 
 		 1140 aa  283  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  56.25 
 
 		 1138 aa  282  3e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  52.97 
 
 		 1162 aa  282  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  52.97 
 
 		 1162 aa  282  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  56.25 
 
 		 1138 aa  282  3e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  55.66 
 
 		 1169 aa  280  2e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  55.66 
 
 		 1169 aa  279  3e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  52.54 
 
 		 1162 aa  278  6e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  45.05 
 
 		 1170 aa  278  7e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  55.8 
 
 		 1138 aa  277  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  41.16 
 
 		 1164 aa  277  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  55.61 
 
 		 1139 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  56.07 
 
 		 1163 aa  276  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  45.6 
 
 		 1141 aa  275  3e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1735  chromosome segregation protein SMC  48.74 
 
 		 299 aa  275  5.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  53.12 
 
 		 1168 aa  275  6e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  35.71 
 
 		 1164 aa  272  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  37.6 
 
 		 1164 aa  271  5.9999999999999995e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  38.05 
 
 		 1167 aa  267  8.999999999999999e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  39.01 
 
 		 1167 aa  265  3e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  40.3 
 
 		 1168 aa  264  8e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2192  chromosome segregation protein SMC  42.34 
 
 		 1234 aa  260  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  40.92 
 
 		 1175 aa  260  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  43.33 
 
 		 1165 aa  259  3e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  50.89 
 
 		 1167 aa  259  3e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  50.89 
 
 		 1167 aa  259  3e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  39.57 
 
 		 1182 aa  256  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  37.22 
 
 		 1198 aa  257  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  39.94 
 
 		 1170 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  40.84 
 
 		 1170 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  39.47 
 
 		 1181 aa  256  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  41.14 
 
 		 1170 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  39.94 
 
 		 1170 aa  255  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  41.14 
 
 		 1170 aa  256  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  41.14 
 
 		 1170 aa  256  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  40.46 
 
 		 1171 aa  256  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  41.14 
 
 		 1170 aa  256  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  40.23 
 
 		 1198 aa  255  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  39.94 
 
 		 1170 aa  255  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  42.99 
 
 		 1175 aa  254  5.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  39.65 
 
 		 1206 aa  254  8.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  40.23 
 
 		 1170 aa  254  8.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  39.94 
 
 		 1170 aa  254  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  40.84 
 
 		 1200 aa  254  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  53.39 
 
 		 1165 aa  254  1e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  40.84 
 
 		 1268 aa  253  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  43.45 
 
 		 1173 aa  253  1e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  40.84 
 
 		 1202 aa  253  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  51.79 
 
 		 1168 aa  253  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  40.18 
 
 		 1172 aa  252  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  41.62 
 
 		 1170 aa  251  5e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1334  chromosome segregation protein SMC  40.94 
 
 		 1171 aa  251  8e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0218063  normal  0.637516 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  51.34 
 
 		 1171 aa  251  9e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  41.49 
 
 		 1167 aa  251  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1401  condensin subunit Smc  47.89 
 
 		 1168 aa  249  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.934786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  42.9 
 
 		 1204 aa  249  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  40.95 
 
 		 1175 aa  248  4.9999999999999997e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 		 1174 aa  248  6.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  37.65 
 
 		 1171 aa  247  9e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 		 1174 aa  247  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  51.34 
 
 		 1190 aa  241  5e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  50.45 
 
 		 1150 aa  240  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  50.45 
 
 		 1150 aa  239  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1736  chromosome segregation protein SMC  49.78 
 
 		 814 aa  233  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00195971  unclonable  0.00000000014199 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  33.67 
 
 		 1176 aa  232  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  32.27 
 
 		 1191 aa  231  5e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  36.36 
 
 		 1177 aa  227  9e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  30.93 
 
 		 1175 aa  227  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  36.81 
 
 		 1185 aa  223  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  40.38 
 
 		 1152 aa  223  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  38.42 
 
 		 1176 aa  223  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  38.22 
 
 		 1176 aa  223  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2059  chromosome segregation protein SMC  38.73 
 
 		 1142 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365444  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  36.01 
 
 		 1174 aa  221  6e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  39.8 
 
 		 1199 aa  221  7e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  39.49 
 
 		 1176 aa  221  8.999999999999998e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  39.46 
 
 		 1199 aa  219  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>