More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1094 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  58.93 
 
 		 1175 aa  1335    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  49.67 
 
 		 1177 aa  1056    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  43.9 
 
 		 1173 aa  858    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  60.97 
 
 		 1176 aa  1390    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  38.19 
 
 		 1199 aa  712    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  58.32 
 
 		 1176 aa  1281    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1176 aa  2355    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  58.71 
 
 		 1176 aa  1283    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  52.08 
 
 		 1176 aa  1091    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  34.53 
 
 		 1204 aa  616  1e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  36.31 
 
 		 1403 aa  618  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  33.71 
 
 		 1190 aa  605  1.0000000000000001e-171  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  33.98 
 
 		 1187 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  33.83 
 
 		 1189 aa  590  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  34.34 
 
 		 1189 aa  581  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  33.44 
 
 		 1185 aa  571  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  35.39 
 
 		 1187 aa  568  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  32.67 
 
 		 1190 aa  566  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  34.49 
 
 		 1189 aa  566  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  34.3 
 
 		 1189 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  33.88 
 
 		 1189 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  34.13 
 
 		 1189 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  34.16 
 
 		 1189 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  34.3 
 
 		 1189 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  33.88 
 
 		 1189 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  33.69 
 
 		 1189 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  33.85 
 
 		 1189 aa  560  1e-158  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  35.03 
 
 		 1198 aa  562  1e-158  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  32.33 
 
 		 1196 aa  558  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  31.69 
 
 		 1185 aa  530  1e-149  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  32.33 
 
 		 1167 aa  512  1e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  32.81 
 
 		 1186 aa  512  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  30.43 
 
 		 1188 aa  507  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  30.43 
 
 		 1188 aa  507  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  30.99 
 
 		 1189 aa  503  1e-141  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  33.61 
 
 		 1168 aa  503  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  30.95 
 
 		 1185 aa  504  1e-141  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  32.68 
 
 		 1167 aa  501  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  31.14 
 
 		 1168 aa  499  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  30.88 
 
 		 1191 aa  495  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  32.6 
 
 		 1162 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  32.32 
 
 		 1162 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  31.48 
 
 		 1176 aa  492  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  31.49 
 
 		 1162 aa  489  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  31.74 
 
 		 1167 aa  488  1e-136  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  32.29 
 
 		 1162 aa  488  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  32.81 
 
 		 1162 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  32.4 
 
 		 1162 aa  486  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  29.81 
 
 		 1178 aa  483  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  31.74 
 
 		 1167 aa  486  1e-135  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  33.17 
 
 		 1168 aa  478  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  30.1 
 
 		 1177 aa  474  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  32.16 
 
 		 1186 aa  474  1e-132  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  31.41 
 
 		 1178 aa  472  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  30.64 
 
 		 1148 aa  470  1.0000000000000001e-131  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  31.37 
 
 		 1179 aa  472  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  31.35 
 
 		 1185 aa  467  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  30.46 
 
 		 1169 aa  463  1e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  30.55 
 
 		 1169 aa  462  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  31.05 
 
 		 1164 aa  458  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  31.7 
 
 		 1177 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  29.1 
 
 		 1187 aa  453  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  30.68 
 
 		 1174 aa  449  1.0000000000000001e-124  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  29.61 
 
 		 1186 aa  449  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  31.02 
 
 		 1165 aa  446  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  31.13 
 
 		 1179 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  30.3 
 
 		 1173 aa  442  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  30.79 
 
 		 1179 aa  437  1e-121  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  38.59 
 
 		 1199 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  39.6 
 
 		 1198 aa  432  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  30.73 
 
 		 1198 aa  433  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  38.59 
 
 		 1199 aa  433  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  30.27 
 
 		 1190 aa  426  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  29.77 
 
 		 1177 aa  422  1e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  30.46 
 
 		 1175 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  30.01 
 
 		 1182 aa  414  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  30.26 
 
 		 1152 aa  408  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  30.24 
 
 		 1174 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  29.33 
 
 		 1308 aa  404  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  29.85 
 
 		 1170 aa  404  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  29.22 
 
 		 1172 aa  403  9.999999999999999e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  27.86 
 
 		 1191 aa  402  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  29.98 
 
 		 1174 aa  396  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  29.94 
 
 		 1201 aa  387  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  29.8 
 
 		 1150 aa  386  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  29.33 
 
 		 1170 aa  384  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  29.8 
 
 		 1150 aa  386  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  29.21 
 
 		 1170 aa  377  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  28.08 
 
 		 1164 aa  378  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  28.85 
 
 		 1181 aa  367  1e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  25.23 
 
 		 1174 aa  364  4e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  31.5 
 
 		 1185 aa  327  6e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  26.86 
 
 		 1171 aa  322  3e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  32.72 
 
 		 1190 aa  306  2.0000000000000002e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  30.15 
 
 		 1301 aa  300  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  27.7 
 
 		 1153 aa  296  1e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  25.75 
 
 		 1174 aa  278  6e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  30.42 
 
 		 1255 aa  276  2.0000000000000002e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  29.33 
 
 		 1162 aa  272  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  24.92 
 
 		 1189 aa  271  5.9999999999999995e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>