More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1880 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  46.19 
 
 		 1162 aa  864    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2440  chromosome segregation SMC protein  41.78 
 
 		 1109 aa  638    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129774  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  47.13 
 
 		 1162 aa  872    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  38.49 
 
 		 1195 aa  751    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  38.96 
 
 		 1145 aa  707    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  45.67 
 
 		 1162 aa  890    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  49.07 
 
 		 1168 aa  973    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  39.6 
 
 		 1164 aa  758    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  39.36 
 
 		 1164 aa  754    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  46.01 
 
 		 1162 aa  885    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  39.24 
 
 		 1167 aa  636    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  38.73 
 
 		 1171 aa  672    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  46.91 
 
 		 1162 aa  884    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  41.6 
 
 		 1165 aa  717    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  46.43 
 
 		 1163 aa  892    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  44.17 
 
 		 1170 aa  814    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  47.1 
 
 		 1162 aa  898    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  39.53 
 
 		 1175 aa  644    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  37.53 
 
 		 1173 aa  646    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1165 aa  2251    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  41.96 
 
 		 1169 aa  877    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  45.59 
 
 		 1168 aa  942    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  46.4 
 
 		 1167 aa  903    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  39.05 
 
 		 1198 aa  645    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  38.71 
 
 		 1171 aa  676    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  41.81 
 
 		 1169 aa  874    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  45.9 
 
 		 1164 aa  811    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  46.69 
 
 		 1164 aa  860    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  39.57 
 
 		 1171 aa  686    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  37.05 
 
 		 1140 aa  667    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  38.11 
 
 		 1145 aa  696    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  46.85 
 
 		 1162 aa  909    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  38.07 
 
 		 1138 aa  694    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  38.93 
 
 		 1164 aa  759    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  37.22 
 
 		 1133 aa  662    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  46.44 
 
 		 1162 aa  865    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  46.83 
 
 		 1162 aa  894    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  40.7 
 
 		 1142 aa  733    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  40.58 
 
 		 1142 aa  743    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  58.5 
 
 		 1168 aa  1123    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  46.84 
 
 		 1167 aa  900    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  46.19 
 
 		 1162 aa  865    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  47.07 
 
 		 1162 aa  912    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  45.84 
 
 		 1167 aa  912    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  39.83 
 
 		 1142 aa  730    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  45.93 
 
 		 1167 aa  915    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  38.93 
 
 		 1198 aa  640    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  39.97 
 
 		 1139 aa  683    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  37.28 
 
 		 1172 aa  630  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  39.66 
 
 		 1170 aa  632  1e-179  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  38.63 
 
 		 1175 aa  631  1e-179  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  39.34 
 
 		 1181 aa  630  1e-179  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  37.32 
 
 		 1190 aa  628  1e-178  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  38.74 
 
 		 1170 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  38.67 
 
 		 1170 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  38.82 
 
 		 1170 aa  628  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  38.86 
 
 		 1170 aa  624  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  38.51 
 
 		 1268 aa  624  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  38.28 
 
 		 1170 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  38.77 
 
 		 1170 aa  621  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  38.77 
 
 		 1202 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  39.18 
 
 		 1175 aa  620  1e-176  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  38.77 
 
 		 1200 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  38.77 
 
 		 1170 aa  621  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  38.77 
 
 		 1170 aa  621  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  38.23 
 
 		 1174 aa  619  1e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  36.88 
 
 		 1182 aa  617  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  38.34 
 
 		 1206 aa  617  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  36.6 
 
 		 1171 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  36.69 
 
 		 1171 aa  609  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  38.18 
 
 		 1170 aa  612  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  37.82 
 
 		 1174 aa  609  9.999999999999999e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  37.65 
 
 		 1204 aa  605  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2192  chromosome segregation protein SMC  37.91 
 
 		 1234 aa  595  1e-168  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  35.55 
 
 		 1152 aa  588  1e-166  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2059  chromosome segregation protein SMC  37.66 
 
 		 1142 aa  581  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365444  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  36.15 
 
 		 1177 aa  550  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  35.54 
 
 		 1176 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  34.05 
 
 		 1176 aa  527  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  35.9 
 
 		 1167 aa  528  1e-148  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  34.8 
 
 		 1150 aa  520  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  35.49 
 
 		 1175 aa  522  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  34.8 
 
 		 1150 aa  520  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  34.57 
 
 		 1176 aa  513  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  34.24 
 
 		 1176 aa  513  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  34.69 
 
 		 1173 aa  502  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  31.85 
 
 		 1204 aa  484  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  33.64 
 
 		 1199 aa  446  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  27.72 
 
 		 1191 aa  444  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  29.43 
 
 		 1187 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  33.7 
 
 		 1199 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  28.98 
 
 		 1185 aa  432  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  33.95 
 
 		 1199 aa  432  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  28.54 
 
 		 1190 aa  430  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  29.07 
 
 		 1190 aa  422  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  26.64 
 
 		 1188 aa  421  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  26.64 
 
 		 1188 aa  421  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  27.39 
 
 		 1189 aa  407  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  29.16 
 
 		 1189 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  29.74 
 
 		 1174 aa  404  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>