More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0696 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  38.09 
 
 
1196 aa  744    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  38.75 
 
 
1189 aa  748    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  39.12 
 
 
1189 aa  739    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  36.94 
 
 
1187 aa  745    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  39.06 
 
 
1189 aa  734    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  38.96 
 
 
1189 aa  736    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  39.14 
 
 
1189 aa  740    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  37.9 
 
 
1185 aa  722    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  38.59 
 
 
1189 aa  750    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  36.53 
 
 
1198 aa  731    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  39.29 
 
 
1189 aa  746    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  34.29 
 
 
1191 aa  671    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  39.06 
 
 
1189 aa  734    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  39.12 
 
 
1189 aa  739    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  64.28 
 
 
1190 aa  1544    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  34.4 
 
 
1185 aa  671    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  35.44 
 
 
1188 aa  666    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  39.04 
 
 
1189 aa  736    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  36.79 
 
 
1186 aa  690    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  37.36 
 
 
1187 aa  782    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  35.44 
 
 
1188 aa  666    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  36.61 
 
 
1185 aa  692    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 
1190 aa  2394    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  37.86 
 
 
1189 aa  739    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  33.82 
 
 
1189 aa  627  1e-178  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  34.14 
 
 
1174 aa  626  1e-178  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  34.14 
 
 
1177 aa  608  9.999999999999999e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  33.31 
 
 
1179 aa  604  1.0000000000000001e-171  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  35.36 
 
 
1184 aa  597  1e-169  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  32.74 
 
 
1185 aa  597  1e-169  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  32.83 
 
 
1175 aa  592  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  32.06 
 
 
1177 aa  592  1e-167  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  32.34 
 
 
1176 aa  581  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  32.2 
 
 
1187 aa  577  1.0000000000000001e-163  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  31.06 
 
 
1187 aa  577  1.0000000000000001e-163  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  32.31 
 
 
1177 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  31.36 
 
 
1199 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  31.31 
 
 
1199 aa  571  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  31.57 
 
 
1199 aa  572  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  32.16 
 
 
1176 aa  571  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  31.61 
 
 
1186 aa  573  1e-161  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  31.04 
 
 
1191 aa  568  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  31.6 
 
 
1176 aa  562  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  31.77 
 
 
1176 aa  553  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  30.33 
 
 
1173 aa  551  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  32.33 
 
 
1176 aa  553  1e-155  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  31 
 
 
1204 aa  523  1e-147  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  32.83 
 
 
1172 aa  524  1e-147  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0765  chromosome segregation protein SMC  30.8 
 
 
1189 aa  519  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.430738 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  29.13 
 
 
1301 aa  496  9.999999999999999e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  28.22 
 
 
1201 aa  482  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  29.81 
 
 
1186 aa  477  1e-133  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  29.94 
 
 
1181 aa  474  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  30.27 
 
 
1185 aa  475  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  31.62 
 
 
1175 aa  472  1.0000000000000001e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  31.19 
 
 
1180 aa  458  1e-127  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  29.55 
 
 
1177 aa  457  1e-127  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  28.86 
 
 
1179 aa  450  1e-125  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  29.98 
 
 
1170 aa  451  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  29.73 
 
 
1178 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  29.76 
 
 
1178 aa  449  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  29.86 
 
 
1174 aa  446  1e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  28.75 
 
 
1179 aa  445  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  29.32 
 
 
1164 aa  440  9.999999999999999e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  29.54 
 
 
1170 aa  434  1e-120  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  28.16 
 
 
1403 aa  425  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  28.65 
 
 
1148 aa  417  9.999999999999999e-116  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  27 
 
 
1167 aa  416  1e-114  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  27.1 
 
 
1167 aa  412  1e-113  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  28.3 
 
 
1190 aa  410  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  28.5 
 
 
1184 aa  412  1e-113  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  27.35 
 
 
1164 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  26.63 
 
 
1167 aa  402  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  27.19 
 
 
1168 aa  399  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  27.14 
 
 
1175 aa  397  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  29.44 
 
 
1164 aa  396  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  27.01 
 
 
1168 aa  395  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  26.63 
 
 
1167 aa  396  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  27.15 
 
 
1142 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  26.38 
 
 
1162 aa  395  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  26.49 
 
 
1175 aa  390  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  27.93 
 
 
1174 aa  387  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  26.69 
 
 
1171 aa  389  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  28.17 
 
 
1175 aa  389  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  26.53 
 
 
1173 aa  389  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  26.45 
 
 
1169 aa  386  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  25.86 
 
 
1181 aa  380  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  26.13 
 
 
1171 aa  381  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  27.18 
 
 
1170 aa  379  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  27.1 
 
 
1170 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  27.46 
 
 
1182 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  27.23 
 
 
1198 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  27.4 
 
 
1164 aa  379  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  28.21 
 
 
1308 aa  380  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  26.62 
 
 
1174 aa  376  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  27.1 
 
 
1170 aa  376  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  26.97 
 
 
1268 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  25.93 
 
 
1174 aa  376  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  27.07 
 
 
1198 aa  372  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  28.33 
 
 
1171 aa  371  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>