More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3319 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  53.58 
 
 		 1175 aa  1117    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  52.4 
 
 		 1176 aa  1063    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  39.98 
 
 		 1198 aa  671    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  45.74 
 
 		 1173 aa  895    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  54.61 
 
 		 1176 aa  1130    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  52.32 
 
 		 1176 aa  1070    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  40 
 
 		 1199 aa  682    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  39.92 
 
 		 1199 aa  682    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  52.08 
 
 		 1176 aa  1119    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  56.18 
 
 		 1177 aa  1205    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  39.92 
 
 		 1199 aa  683    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1176 aa  2321    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  38.7 
 
 		 1403 aa  623  1e-177  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  33.28 
 
 		 1190 aa  608  9.999999999999999e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  34.32 
 
 		 1204 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  33.41 
 
 		 1187 aa  589  1e-166  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  35.61 
 
 		 1187 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  33.66 
 
 		 1189 aa  567  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  33.96 
 
 		 1189 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  31.95 
 
 		 1190 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  33.04 
 
 		 1189 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  30.84 
 
 		 1196 aa  556  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  34.97 
 
 		 1198 aa  553  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  34.38 
 
 		 1189 aa  555  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  31.21 
 
 		 1191 aa  552  1e-155  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  31.54 
 
 		 1185 aa  538  1e-151  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  29.94 
 
 		 1185 aa  536  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  32.87 
 
 		 1186 aa  531  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  34.82 
 
 		 1162 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  34.58 
 
 		 1162 aa  512  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  34.17 
 
 		 1168 aa  506  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  34.4 
 
 		 1162 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  29.67 
 
 		 1189 aa  502  1e-140  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  32.84 
 
 		 1162 aa  502  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  35.05 
 
 		 1162 aa  502  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  30.26 
 
 		 1188 aa  503  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  30.26 
 
 		 1188 aa  503  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  32.89 
 
 		 1162 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  32.93 
 
 		 1167 aa  494  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  33.6 
 
 		 1167 aa  495  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  32.96 
 
 		 1167 aa  490  1e-137  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  35.53 
 
 		 1162 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  29.77 
 
 		 1185 aa  490  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  34.26 
 
 		 1162 aa  489  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  35.15 
 
 		 1168 aa  487  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  32.74 
 
 		 1167 aa  489  1e-136  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  29.5 
 
 		 1186 aa  488  1e-136  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  33.57 
 
 		 1162 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  29.03 
 
 		 1177 aa  483  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  32.41 
 
 		 1162 aa  483  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  34.35 
 
 		 1162 aa  485  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  32.87 
 
 		 1168 aa  486  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  32.74 
 
 		 1177 aa  482  1e-134  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  32.18 
 
 		 1169 aa  477  1e-133  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  31.91 
 
 		 1169 aa  475  1e-132  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  30.45 
 
 		 1186 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  29.2 
 
 		 1178 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  31.48 
 
 		 1184 aa  473  1.0000000000000001e-131  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  29.64 
 
 		 1187 aa  469  9.999999999999999e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  31.85 
 
 		 1179 aa  469  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  30.75 
 
 		 1185 aa  466  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  33.63 
 
 		 1187 aa  465  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  30.79 
 
 		 1176 aa  460  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  31.54 
 
 		 1173 aa  459  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  31.12 
 
 		 1178 aa  458  1e-127  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  31.7 
 
 		 1179 aa  455  1.0000000000000001e-126  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  30.7 
 
 		 1164 aa  455  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  30.98 
 
 		 1164 aa  454  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  28.69 
 
 		 1148 aa  455  1.0000000000000001e-126  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  31.9 
 
 		 1255 aa  441  9.999999999999999e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  34.05 
 
 		 1164 aa  442  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  30.78 
 
 		 1177 aa  442  9.999999999999999e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  31.3 
 
 		 1182 aa  438  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  30.07 
 
 		 1191 aa  437  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  28.84 
 
 		 1164 aa  434  1e-120  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  31.36 
 
 		 1152 aa  434  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  31.96 
 
 		 1179 aa  431  1e-119  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  31.31 
 
 		 1198 aa  430  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  31.05 
 
 		 1170 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  31.05 
 
 		 1170 aa  423  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  31.66 
 
 		 1190 aa  422  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  31.3 
 
 		 1171 aa  421  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  31.05 
 
 		 1170 aa  423  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  31.8 
 
 		 1175 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  31.4 
 
 		 1198 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  31.26 
 
 		 1171 aa  416  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  32.21 
 
 		 1171 aa  414  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  30.73 
 
 		 1181 aa  409  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  28.65 
 
 		 1170 aa  399  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  28.68 
 
 		 1170 aa  396  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  29.31 
 
 		 1181 aa  395  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  31.33 
 
 		 1308 aa  389  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  30.07 
 
 		 1150 aa  381  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  30.07 
 
 		 1150 aa  380  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  25.06 
 
 		 1174 aa  382  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  27.21 
 
 		 1180 aa  377  1e-102  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  27.1 
 
 		 1175 aa  374  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  30.42 
 
 		 1167 aa  371  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  25.54 
 
 		 1153 aa  328  4.0000000000000003e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  31.79 
 
 		 1189 aa  321  5e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>