More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0917 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  43.76 
 
 		 1175 aa  774    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  100 
 
 		 1180 aa  2272    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  29.28 
 
 		 1188 aa  450  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  29.28 
 
 		 1188 aa  450  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  29.77 
 
 		 1187 aa  443  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  31.77 
 
 		 1190 aa  442  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  28.04 
 
 		 1187 aa  431  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  28.79 
 
 		 1187 aa  429  1e-118  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  30.5 
 
 		 1184 aa  417  9.999999999999999e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  29.53 
 
 		 1189 aa  414  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  27.31 
 
 		 1189 aa  412  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  30.56 
 
 		 1196 aa  412  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  29.3 
 
 		 1185 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  30.2 
 
 		 1185 aa  409  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  29.51 
 
 		 1179 aa  404  1e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  30.1 
 
 		 1177 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  28.51 
 
 		 1174 aa  399  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  30.68 
 
 		 1191 aa  400  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  28.43 
 
 		 1177 aa  394  1e-108  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  28.97 
 
 		 1164 aa  382  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  29.49 
 
 		 1170 aa  383  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  26.22 
 
 		 1176 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  27.35 
 
 		 1177 aa  371  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  28.83 
 
 		 1170 aa  373  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  26.9 
 
 		 1176 aa  370  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  26.81 
 
 		 1179 aa  366  2e-99  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  29.87 
 
 		 1174 aa  362  2e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  26.91 
 
 		 1148 aa  352  2e-95  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  29.12 
 
 		 1178 aa  352  3e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  27.24 
 
 		 1181 aa  348  3e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  26.63 
 
 		 1185 aa  348  4e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  26.4 
 
 		 1191 aa  346  1e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  25.47 
 
 		 1199 aa  345  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  25.47 
 
 		 1199 aa  345  4e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  25.35 
 
 		 1199 aa  340  7e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  26.65 
 
 		 1176 aa  332  3e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  26.32 
 
 		 1186 aa  326  2e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  34.74 
 
 		 1190 aa  310  1.0000000000000001e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  27.76 
 
 		 1172 aa  306  1.0000000000000001e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  22.96 
 
 		 1167 aa  297  8e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  23.65 
 
 		 1167 aa  297  8e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  24.3 
 
 		 1190 aa  278  4e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  24.14 
 
 		 1146 aa  275  5.000000000000001e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  24.48 
 
 		 1403 aa  271  4e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  24.67 
 
 		 1149 aa  263  2e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  25.4 
 
 		 1188 aa  261  4e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  25.27 
 
 		 1185 aa  255  3e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  22.61 
 
 		 1134 aa  246  1.9999999999999999e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2440  chromosome segregation SMC protein  21.77 
 
 		 1109 aa  241  5e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129774  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  27.83 
 
 		 1189 aa  239  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  28.65 
 
 		 1189 aa  238  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  27.05 
 
 		 1177 aa  238  4e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  28.8 
 
 		 1189 aa  236  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  28.8 
 
 		 1189 aa  236  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  29.18 
 
 		 1189 aa  234  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  29.18 
 
 		 1189 aa  234  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  23.49 
 
 		 1301 aa  233  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  22.15 
 
 		 1217 aa  231  6e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  24.84 
 
 		 1146 aa  229  3e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  25 
 
 		 1147 aa  229  3e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  22.67 
 
 		 1198 aa  228  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  23.31 
 
 		 1208 aa  226  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  29.32 
 
 		 1153 aa  227  1e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  24.22 
 
 		 1219 aa  227  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  28.21 
 
 		 1179 aa  227  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  46.38 
 
 		 1186 aa  226  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  26.59 
 
 		 1255 aa  226  2e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  51.83 
 
 		 1185 aa  225  4e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  23.05 
 
 		 1226 aa  225  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  27.49 
 
 		 1178 aa  224  6e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  23.2 
 
 		 1226 aa  224  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  49.3 
 
 		 1185 aa  224  8e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  51.38 
 
 		 1185 aa  223  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  45.99 
 
 		 1190 aa  219  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  23.58 
 
 		 1207 aa  218  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  52.2 
 
 		 1172 aa  218  7e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  49.28 
 
 		 1198 aa  216  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  26.16 
 
 		 1176 aa  216  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  23.83 
 
 		 1191 aa  215  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3688  SMC domain protein  43.33 
 
 		 1081 aa  214  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860198 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  24.23 
 
 		 1174 aa  214  9e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  47.44 
 
 		 1189 aa  213  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  47.44 
 
 		 1189 aa  213  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  46.98 
 
 		 1189 aa  212  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  46.98 
 
 		 1189 aa  212  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  24.25 
 
 		 1201 aa  211  6e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  24.61 
 
 		 1225 aa  211  6e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  24.13 
 
 		 1194 aa  207  8e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  48.69 
 
 		 1187 aa  206  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  24.75 
 
 		 1205 aa  204  6e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  34.05 
 
 		 1217 aa  204  6e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  45.75 
 
 		 1183 aa  204  7e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1496  chromosome partition protein SmC, putative  35.87 
 
 		 980 aa  204  9e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  25.75 
 
 		 1196 aa  204  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  25.58 
 
 		 1184 aa  203  9.999999999999999e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  24.7 
 
 		 1194 aa  204  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  45.75 
 
 		 1194 aa  204  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  29.72 
 
 		 1174 aa  204  9.999999999999999e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  23.58 
 
 		 1183 aa  203  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  25.49 
 
 		 1196 aa  203  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>