More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0461 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 
1186 aa  2407    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  50.55 
 
 
1177 aa  1096    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0419  chromosome segregation protein SMC  47.88 
 
 
1190 aa  984    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327904  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  50.59 
 
 
1178 aa  1078    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  54.77 
 
 
1185 aa  1258    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  53.02 
 
 
1179 aa  1150    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  33.55 
 
 
1178 aa  631  1e-179  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  31.3 
 
 
1176 aa  546  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  31.42 
 
 
1176 aa  506  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  32.04 
 
 
1187 aa  491  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  30.82 
 
 
1175 aa  485  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  31.52 
 
 
1199 aa  477  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  31.44 
 
 
1199 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  30.59 
 
 
1176 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  31.89 
 
 
1176 aa  472  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  30.89 
 
 
1191 aa  470  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  31.23 
 
 
1187 aa  472  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  31.41 
 
 
1196 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  31.39 
 
 
1199 aa  469  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  30.51 
 
 
1176 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  30.43 
 
 
1189 aa  464  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  30.4 
 
 
1186 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  29.67 
 
 
1190 aa  457  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  30.46 
 
 
1177 aa  458  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  29.18 
 
 
1190 aa  455  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  30.07 
 
 
1198 aa  452  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  30.87 
 
 
1189 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  30.53 
 
 
1189 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  30.47 
 
 
1189 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  30.87 
 
 
1189 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  30.53 
 
 
1189 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  30.94 
 
 
1189 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  30.47 
 
 
1189 aa  446  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  30.03 
 
 
1189 aa  444  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  30.21 
 
 
1177 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  30.34 
 
 
1189 aa  443  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  30.52 
 
 
1189 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  30.9 
 
 
1173 aa  442  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  28.81 
 
 
1148 aa  441  9.999999999999999e-123  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  29.73 
 
 
1185 aa  438  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  29.62 
 
 
1204 aa  435  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  29.85 
 
 
1187 aa  431  1e-119  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  28.65 
 
 
1188 aa  429  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  28.65 
 
 
1188 aa  429  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  29.29 
 
 
1185 aa  411  1e-113  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  37.03 
 
 
1185 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  28.81 
 
 
1187 aa  407  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  29.38 
 
 
1174 aa  409  1.0000000000000001e-112  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  29.85 
 
 
1184 aa  403  1e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  29.26 
 
 
1255 aa  399  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  28.54 
 
 
1189 aa  389  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  28.1 
 
 
1167 aa  378  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  28.75 
 
 
1177 aa  378  1e-103  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  27.49 
 
 
1179 aa  374  1e-102  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  29.99 
 
 
1403 aa  374  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  27.91 
 
 
1167 aa  375  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  28.34 
 
 
1186 aa  370  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  28.06 
 
 
1179 aa  369  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  26.56 
 
 
1167 aa  359  9.999999999999999e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  26.56 
 
 
1167 aa  359  1.9999999999999998e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  27.27 
 
 
1191 aa  352  2e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  26.77 
 
 
1201 aa  352  3e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  27.6 
 
 
1181 aa  337  5.999999999999999e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  27.67 
 
 
1182 aa  337  7.999999999999999e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  25.93 
 
 
1180 aa  325  2e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  26.97 
 
 
1198 aa  326  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  27.89 
 
 
1167 aa  322  1.9999999999999998e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  26.9 
 
 
1164 aa  315  3.9999999999999997e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  27.71 
 
 
1170 aa  310  6.999999999999999e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  27.75 
 
 
1170 aa  310  9e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  26.76 
 
 
1308 aa  302  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  28.32 
 
 
1185 aa  274  8.000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  28.61 
 
 
1301 aa  266  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  24.68 
 
 
1171 aa  264  8e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  25.73 
 
 
1153 aa  264  8.999999999999999e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  24.9 
 
 
1174 aa  255  4.0000000000000004e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  24.46 
 
 
1172 aa  253  1e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  24.12 
 
 
1174 aa  253  2e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  24.86 
 
 
1189 aa  251  5e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  28.49 
 
 
1194 aa  251  8e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1496  chromosome partition protein SmC, putative  37.23 
 
 
980 aa  249  2e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  24.84 
 
 
1189 aa  249  2e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  42.76 
 
 
1176 aa  249  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  47.98 
 
 
1190 aa  247  9.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  24.26 
 
 
1189 aa  244  1e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  29.31 
 
 
1194 aa  241  5e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  30.13 
 
 
1175 aa  238  6e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  25.7 
 
 
1082 aa  229  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  46.64 
 
 
1185 aa  229  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  28.57 
 
 
1188 aa  229  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  46.19 
 
 
1185 aa  228  6e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  29.81 
 
 
1222 aa  228  6e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  31.09 
 
 
1174 aa  225  3e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  25.9 
 
 
1208 aa  225  4.9999999999999996e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  25.33 
 
 
1226 aa  224  7e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  42.68 
 
 
1218 aa  223  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  44.54 
 
 
1183 aa  222  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  24.45 
 
 
1226 aa  220  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  24.72 
 
 
1146 aa  220  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  24.42 
 
 
1217 aa  220  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>