More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0504 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  52.72 
 
 		 1185 aa  1133    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  55.61 
 
 		 1177 aa  1253    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0419  chromosome segregation protein SMC  52.27 
 
 		 1190 aa  1077    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327904  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  53.02 
 
 		 1186 aa  1150    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1179 aa  2378    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  59.27 
 
 		 1178 aa  1335    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  34.3 
 
 		 1178 aa  632  1e-179  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  32.2 
 
 		 1176 aa  541  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  31.54 
 
 		 1176 aa  511  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  32.3 
 
 		 1199 aa  491  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  32.38 
 
 		 1199 aa  492  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  32.43 
 
 		 1199 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  30.57 
 
 		 1175 aa  479  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  30.53 
 
 		 1173 aa  478  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  30.81 
 
 		 1176 aa  474  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  31.44 
 
 		 1176 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  30.82 
 
 		 1176 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  31.9 
 
 		 1198 aa  466  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  30.36 
 
 		 1187 aa  462  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  30.94 
 
 		 1177 aa  462  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  29.27 
 
 		 1204 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  31.39 
 
 		 1189 aa  452  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  30.37 
 
 		 1186 aa  450  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  31.45 
 
 		 1176 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  29.83 
 
 		 1190 aa  444  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  30.37 
 
 		 1198 aa  442  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  28.81 
 
 		 1190 aa  428  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  29.22 
 
 		 1196 aa  423  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  29.34 
 
 		 1191 aa  422  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  29.71 
 
 		 1185 aa  419  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  27.82 
 
 		 1148 aa  397  1e-109  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  29.13 
 
 		 1177 aa  399  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  28.88 
 
 		 1187 aa  395  1e-108  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  35.34 
 
 		 1185 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  28.94 
 
 		 1184 aa  372  1e-101  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  28.22 
 
 		 1186 aa  369  1e-100  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  28.89 
 
 		 1177 aa  366  1e-99  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  28.61 
 
 		 1179 aa  365  2e-99  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  28.33 
 
 		 1179 aa  361  4e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  28.94 
 
 		 1403 aa  351  4e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  27.41 
 
 		 1167 aa  351  4e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  27.07 
 
 		 1167 aa  350  9e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  27.36 
 
 		 1167 aa  345  2.9999999999999997e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  26.95 
 
 		 1191 aa  333  1e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  27.69 
 
 		 1308 aa  315  2.9999999999999996e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  26.95 
 
 		 1164 aa  306  2.0000000000000002e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  27.2 
 
 		 1181 aa  306  2.0000000000000002e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  25.84 
 
 		 1153 aa  269  2.9999999999999995e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  25.29 
 
 		 1134 aa  264  8e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  24.41 
 
 		 1189 aa  258  5e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  48.91 
 
 		 1187 aa  254  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  28.08 
 
 		 1188 aa  253  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  28.08 
 
 		 1188 aa  253  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  42.63 
 
 		 1190 aa  251  6e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  23.61 
 
 		 1171 aa  251  8e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  27.39 
 
 		 1301 aa  249  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  24.6 
 
 		 1174 aa  247  9.999999999999999e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  46.99 
 
 		 1189 aa  244  7e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  46.99 
 
 		 1189 aa  244  7e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  39.14 
 
 		 1255 aa  243  1e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  28.15 
 
 		 1189 aa  242  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  23.75 
 
 		 1189 aa  242  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  28.77 
 
 		 1185 aa  241  6.999999999999999e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  28.24 
 
 		 1205 aa  240  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  47.01 
 
 		 1185 aa  240  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1496  chromosome partition protein SmC, putative  48.21 
 
 		 980 aa  238  4e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  47.39 
 
 		 1189 aa  238  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  47.39 
 
 		 1189 aa  238  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  47.39 
 
 		 1189 aa  238  6e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  46.99 
 
 		 1189 aa  237  8e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  46.99 
 
 		 1189 aa  237  8e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  46.99 
 
 		 1189 aa  237  8e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  46.99 
 
 		 1189 aa  237  8e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  46.99 
 
 		 1189 aa  237  8e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  26.65 
 
 		 1187 aa  235  4.0000000000000004e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  25.81 
 
 		 1172 aa  232  4e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  45.49 
 
 		 1185 aa  229  3e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  28.59 
 
 		 1194 aa  228  6e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  45.06 
 
 		 1185 aa  227  9e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  28.21 
 
 		 1180 aa  227  1e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  29.59 
 
 		 1170 aa  227  1e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  42.04 
 
 		 1184 aa  225  4.9999999999999996e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  29.3 
 
 		 1170 aa  223  1.9999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  44.35 
 
 		 1174 aa  222  3e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  28.95 
 
 		 1198 aa  222  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  43.23 
 
 		 1183 aa  221  6e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  27.83 
 
 		 1175 aa  219  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  37.5 
 
 		 1194 aa  219  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  39.67 
 
 		 1218 aa  218  5.9999999999999996e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  40.15 
 
 		 1234 aa  217  8e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  40.17 
 
 		 1194 aa  217  9e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  40.5 
 
 		 1188 aa  217  9e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  40.91 
 
 		 1186 aa  217  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  24.42 
 
 		 1188 aa  217  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  27.44 
 
 		 1224 aa  215  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  36.09 
 
 		 1162 aa  216  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  42.41 
 
 		 1203 aa  214  7e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  43.23 
 
 		 1181 aa  214  7.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  37.8 
 
 		 1195 aa  214  9e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  37.8 
 
 		 1195 aa  214  9e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>