More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3812 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  36.6 
 
 
1189 aa  696    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  36.22 
 
 
1189 aa  644    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  37.54 
 
 
1189 aa  696    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 
1198 aa  2395    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  37.11 
 
 
1189 aa  694    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  37.11 
 
 
1189 aa  694    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  36.88 
 
 
1189 aa  694    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  36.42 
 
 
1188 aa  667    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  35.57 
 
 
1191 aa  652    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  36.42 
 
 
1188 aa  667    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  39.14 
 
 
1187 aa  719    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  38.81 
 
 
1186 aa  685    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  38.36 
 
 
1190 aa  757    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  36.85 
 
 
1189 aa  705    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  37.93 
 
 
1190 aa  679    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  37.11 
 
 
1189 aa  694    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  38.1 
 
 
1187 aa  746    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  35.87 
 
 
1190 aa  710    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  36.08 
 
 
1196 aa  683    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  37.38 
 
 
1189 aa  703    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  37.54 
 
 
1189 aa  696    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  35.02 
 
 
1185 aa  649    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  37.24 
 
 
1189 aa  700    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  37.03 
 
 
1189 aa  692    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  35.53 
 
 
1187 aa  605  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  35.19 
 
 
1174 aa  591  1e-167  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  33.95 
 
 
1185 aa  589  1e-166  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  32.8 
 
 
1177 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  34.75 
 
 
1176 aa  580  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  32.39 
 
 
1187 aa  578  1.0000000000000001e-163  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  34.17 
 
 
1177 aa  575  1.0000000000000001e-162  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  34.94 
 
 
1176 aa  569  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  34.74 
 
 
1175 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  34.21 
 
 
1177 aa  562  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  34.15 
 
 
1176 aa  558  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  34.26 
 
 
1176 aa  555  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  34.53 
 
 
1184 aa  551  1e-155  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  32.18 
 
 
1179 aa  540  9.999999999999999e-153  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  33.95 
 
 
1199 aa  535  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  33.95 
 
 
1199 aa  536  1e-150  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  34.71 
 
 
1176 aa  535  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  33.82 
 
 
1199 aa  531  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  32.8 
 
 
1191 aa  526  1e-148  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  31.06 
 
 
1204 aa  492  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  29.74 
 
 
1178 aa  485  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  30.95 
 
 
1185 aa  481  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  29.9 
 
 
1186 aa  468  9.999999999999999e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  33.47 
 
 
1201 aa  463  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  31.94 
 
 
1177 aa  462  9.999999999999999e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  30.33 
 
 
1176 aa  463  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  30.96 
 
 
1181 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  30.65 
 
 
1178 aa  456  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  30.92 
 
 
1179 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  30.11 
 
 
1199 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  30.54 
 
 
1148 aa  444  1e-123  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0419  chromosome segregation protein SMC  32.19 
 
 
1190 aa  445  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327904  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  31.77 
 
 
1403 aa  444  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  31.48 
 
 
1179 aa  444  1e-123  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  28.5 
 
 
1164 aa  428  1e-118  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  27.78 
 
 
1175 aa  420  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  30.7 
 
 
1162 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  30.36 
 
 
1174 aa  418  9.999999999999999e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  30.57 
 
 
1162 aa  416  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  30.4 
 
 
1167 aa  411  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  29.72 
 
 
1162 aa  412  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  28.84 
 
 
1170 aa  411  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  28.38 
 
 
1169 aa  412  1e-113  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  27.91 
 
 
1180 aa  410  1e-113  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  29.64 
 
 
1170 aa  412  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  28.46 
 
 
1169 aa  408  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  30.25 
 
 
1167 aa  408  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  27.71 
 
 
1184 aa  405  1e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  29.31 
 
 
1167 aa  403  1e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  29.16 
 
 
1167 aa  403  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  29.37 
 
 
1162 aa  403  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  30.03 
 
 
1162 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  26.88 
 
 
1174 aa  383  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  29.49 
 
 
1171 aa  376  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  28.32 
 
 
1198 aa  376  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1334  chromosome segregation protein SMC  29.67 
 
 
1171 aa  373  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0218063  normal  0.637516 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  29.48 
 
 
1134 aa  369  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  30.26 
 
 
1190 aa  367  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  34.84 
 
 
1186 aa  364  7.0000000000000005e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  26.81 
 
 
1189 aa  353  8.999999999999999e-96  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  27.12 
 
 
1189 aa  353  8.999999999999999e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  27.67 
 
 
1171 aa  348  3e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  26.47 
 
 
1189 aa  347  5e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  28.52 
 
 
1308 aa  331  5.0000000000000004e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  25.6 
 
 
1189 aa  327  9e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  31.11 
 
 
1172 aa  326  2e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  25.24 
 
 
1191 aa  315  2.9999999999999996e-84  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  31 
 
 
1185 aa  304  6.000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  25.7 
 
 
1172 aa  303  1e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  33.91 
 
 
1191 aa  296  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  29.47 
 
 
1301 aa  295  5e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  35.22 
 
 
1194 aa  293  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  27.21 
 
 
1146 aa  291  3e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  46.45 
 
 
1185 aa  291  6e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  30.76 
 
 
1255 aa  291  7e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  55.7 
 
 
1185 aa  288  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>