More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1276 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  96.13 
 
 
1189 aa  2274    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 
1189 aa  2342    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  79.73 
 
 
1189 aa  1886    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  60.85 
 
 
1191 aa  1349    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  95.71 
 
 
1189 aa  2229    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  32.37 
 
 
1174 aa  505  1e-141  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  32.42 
 
 
1175 aa  487  1e-136  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  31.19 
 
 
1188 aa  469  9.999999999999999e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  29.06 
 
 
1171 aa  462  9.999999999999999e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  30.25 
 
 
1193 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  30.89 
 
 
1184 aa  454  1.0000000000000001e-126  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  30.17 
 
 
1192 aa  445  1e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  29.39 
 
 
1189 aa  435  1e-120  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  29.27 
 
 
1146 aa  410  1.0000000000000001e-112  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  30.08 
 
 
1196 aa  403  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  30.1 
 
 
1172 aa  403  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  29.74 
 
 
1149 aa  391  1e-107  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  28.44 
 
 
1190 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  28.79 
 
 
1146 aa  381  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  27.53 
 
 
1226 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  28.62 
 
 
1147 aa  381  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  27.61 
 
 
1226 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  28.19 
 
 
1196 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  27.84 
 
 
1196 aa  375  1e-102  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  28.19 
 
 
1196 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  28.21 
 
 
1194 aa  358  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  26.99 
 
 
1219 aa  358  3.9999999999999996e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  28.22 
 
 
1190 aa  357  5e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  25.96 
 
 
1217 aa  357  7.999999999999999e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  26.98 
 
 
1187 aa  356  1e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  27.86 
 
 
1185 aa  355  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  27.65 
 
 
1189 aa  346  2e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  26.64 
 
 
1187 aa  345  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  26.31 
 
 
1198 aa  344  4e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  26.83 
 
 
1189 aa  344  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  27.55 
 
 
1189 aa  343  8e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  28.07 
 
 
1190 aa  340  9.999999999999999e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  27.27 
 
 
1189 aa  339  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  25.71 
 
 
1208 aa  338  3.9999999999999995e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  27.19 
 
 
1189 aa  338  5e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  27.04 
 
 
1188 aa  336  2e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  27.04 
 
 
1188 aa  336  2e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  28.06 
 
 
1196 aa  334  7.000000000000001e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  28.25 
 
 
1164 aa  331  5.0000000000000004e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  27.76 
 
 
1170 aa  330  1.0000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  27.4 
 
 
1170 aa  328  3e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  25.99 
 
 
1187 aa  326  2e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  25.49 
 
 
1185 aa  326  2e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  26.03 
 
 
1207 aa  324  7e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  26.84 
 
 
1183 aa  321  6e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2255  condensin subunit Smc  25.18 
 
 
1202 aa  311  2.9999999999999997e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.204212 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  24.6 
 
 
1186 aa  309  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  26.68 
 
 
1174 aa  309  3e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  25.74 
 
 
1174 aa  305  4.0000000000000003e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  24.39 
 
 
1199 aa  303  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  24.22 
 
 
1199 aa  300  8e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  24.22 
 
 
1199 aa  300  1e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  27.79 
 
 
1179 aa  299  2e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  26.69 
 
 
1177 aa  300  2e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  25.2 
 
 
1177 aa  298  5e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  27.06 
 
 
1191 aa  295  3e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  28.18 
 
 
1153 aa  292  3e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  25.83 
 
 
1184 aa  292  3e-77  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  31.29 
 
 
1146 aa  285  4.0000000000000003e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  26.31 
 
 
1186 aa  283  1e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  27.49 
 
 
1172 aa  275  4.0000000000000004e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  24.16 
 
 
1181 aa  267  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  25.39 
 
 
1174 aa  260  1e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  23.06 
 
 
1176 aa  259  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  23.55 
 
 
1179 aa  257  8e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  24.94 
 
 
1186 aa  257  1.0000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  24.54 
 
 
1178 aa  256  2.0000000000000002e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  24 
 
 
1179 aa  254  5.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  25.06 
 
 
1191 aa  254  9.000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  22.59 
 
 
1134 aa  251  5e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  25.21 
 
 
1176 aa  250  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  23.12 
 
 
1255 aa  250  1e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  23.52 
 
 
1194 aa  249  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  22.5 
 
 
1204 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  28.9 
 
 
1189 aa  246  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  28.9 
 
 
1189 aa  246  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  23.43 
 
 
1201 aa  245  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  28.77 
 
 
1189 aa  245  5e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  24.54 
 
 
1177 aa  243  1e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  27.98 
 
 
1189 aa  242  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  28.64 
 
 
1189 aa  242  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  27.98 
 
 
1189 aa  242  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03271  hypothetical protein  27.57 
 
 
1184 aa  241  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59451  Chromosome segregation and condensation  25.54 
 
 
1171 aa  241  5e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.819288  decreased coverage  0.00000261165 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  28.39 
 
 
1189 aa  241  5e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  23.1 
 
 
1168 aa  239  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  23.82 
 
 
1162 aa  238  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  24.65 
 
 
1148 aa  237  1.0000000000000001e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  23.53 
 
 
1162 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  22.99 
 
 
1403 aa  234  7.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  22.69 
 
 
1167 aa  233  2e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  22.5 
 
 
1167 aa  231  5e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  22.66 
 
 
1167 aa  231  7e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  31.33 
 
 
1148 aa  230  1e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46490  predicted protein  23.38 
 
 
1209 aa  227  1e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0173437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>