More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0642 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  79.56 
 
 		 1189 aa  1883    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1189 aa  2345    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  60.85 
 
 		 1191 aa  1350    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  95.46 
 
 		 1189 aa  2223    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  96.13 
 
 		 1189 aa  2244    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  31.77 
 
 		 1174 aa  501  1e-140  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  32.28 
 
 		 1175 aa  484  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  31.3 
 
 		 1188 aa  465  1e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  31.47 
 
 		 1184 aa  464  1e-129  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  29.08 
 
 		 1171 aa  464  1e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  30.07 
 
 		 1193 aa  449  1.0000000000000001e-124  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  30.54 
 
 		 1192 aa  444  1e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  29.66 
 
 		 1189 aa  441  9.999999999999999e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  29.5 
 
 		 1146 aa  411  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  29.96 
 
 		 1172 aa  406  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  27.09 
 
 		 1190 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  29.82 
 
 		 1149 aa  391  1e-107  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  28.46 
 
 		 1146 aa  389  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  27.57 
 
 		 1226 aa  387  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  29.42 
 
 		 1146 aa  385  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  27.63 
 
 		 1226 aa  386  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  28.26 
 
 		 1196 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  28.77 
 
 		 1147 aa  381  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  28.8 
 
 		 1196 aa  383  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  29.76 
 
 		 1196 aa  373  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  27.6 
 
 		 1219 aa  366  1e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  28 
 
 		 1194 aa  365  4e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  26.26 
 
 		 1217 aa  362  3e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  28.02 
 
 		 1185 aa  358  3.9999999999999996e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  28.29 
 
 		 1190 aa  355  2e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  26.28 
 
 		 1187 aa  354  5.9999999999999994e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  27.75 
 
 		 1187 aa  351  4e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  27.02 
 
 		 1189 aa  348  4e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  25.97 
 
 		 1208 aa  348  4e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  27.05 
 
 		 1189 aa  343  1e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  27.53 
 
 		 1189 aa  341  4e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  26.51 
 
 		 1198 aa  342  4e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  26.07 
 
 		 1204 aa  338  3.9999999999999995e-91  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  27.01 
 
 		 1188 aa  338  5e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  27.01 
 
 		 1188 aa  338  5e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  27.53 
 
 		 1189 aa  337  7e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  28.47 
 
 		 1196 aa  335  3e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  26.37 
 
 		 1207 aa  333  9e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  26.8 
 
 		 1189 aa  333  2e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  27.32 
 
 		 1201 aa  330  7e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  27.43 
 
 		 1190 aa  330  8e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  25.57 
 
 		 1185 aa  327  1e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  27.69 
 
 		 1170 aa  324  5e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  27.89 
 
 		 1170 aa  323  9.999999999999999e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  25.89 
 
 		 1187 aa  323  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  28.56 
 
 		 1164 aa  317  7e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  26.79 
 
 		 1174 aa  313  1e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  25.82 
 
 		 1177 aa  308  5.0000000000000004e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  25.12 
 
 		 1186 aa  306  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  26.66 
 
 		 1191 aa  305  5.000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  27.86 
 
 		 1179 aa  303  9e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  25.02 
 
 		 1174 aa  303  9e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  24.43 
 
 		 1199 aa  298  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  23.86 
 
 		 1199 aa  296  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  26.39 
 
 		 1186 aa  296  1e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  23.86 
 
 		 1199 aa  296  1e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  26.82 
 
 		 1177 aa  295  4e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  28.8 
 
 		 1153 aa  294  7e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  25.43 
 
 		 1184 aa  286  1.0000000000000001e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  27.96 
 
 		 1172 aa  279  2e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  25.2 
 
 		 1181 aa  277  9e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  23.55 
 
 		 1176 aa  267  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  23.05 
 
 		 1176 aa  263  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  25.99 
 
 		 1174 aa  262  3e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  24.41 
 
 		 1179 aa  258  5e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  24.58 
 
 		 1191 aa  257  8e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  25.2 
 
 		 1176 aa  256  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  23.67 
 
 		 1179 aa  254  7e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  23.83 
 
 		 1201 aa  254  8.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  23.78 
 
 		 1178 aa  251  5e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  24.05 
 
 		 1204 aa  251  6e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  23.12 
 
 		 1255 aa  251  7e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  24.84 
 
 		 1186 aa  249  2e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  22.81 
 
 		 1134 aa  247  9.999999999999999e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  29.11 
 
 		 1189 aa  245  3e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  29.11 
 
 		 1189 aa  245  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  24.24 
 
 		 1148 aa  245  3e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  28.75 
 
 		 1189 aa  243  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  28.86 
 
 		 1189 aa  242  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  28.44 
 
 		 1189 aa  241  5e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  28.86 
 
 		 1189 aa  241  5e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  28.44 
 
 		 1189 aa  241  5e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  23.1 
 
 		 1168 aa  240  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  31.44 
 
 		 1196 aa  239  3e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  23.7 
 
 		 1177 aa  238  6e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  22.92 
 
 		 1403 aa  236  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  23.82 
 
 		 1162 aa  235  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  23.68 
 
 		 1162 aa  233  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  31.71 
 
 		 1148 aa  229  2e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  23.42 
 
 		 1176 aa  228  4e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  23.28 
 
 		 1173 aa  226  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  22.38 
 
 		 1167 aa  227  1e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  22.33 
 
 		 1167 aa  226  3e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04597  nuclear condensin complex subunit Smc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02170)  25.51 
 
 		 1476 aa  225  4.9999999999999996e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  29.22 
 
 		 1185 aa  221  7e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>