More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1169 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 
1177 aa  2323    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  35.89 
 
 
1196 aa  635  1e-180  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  34.17 
 
 
1187 aa  623  1e-177  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  33.77 
 
 
1187 aa  599  1e-169  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  34.61 
 
 
1190 aa  594  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  33.49 
 
 
1190 aa  587  1e-166  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  33.55 
 
 
1191 aa  586  1e-166  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  33.63 
 
 
1189 aa  580  1e-164  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  33.17 
 
 
1189 aa  579  1.0000000000000001e-163  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  32.91 
 
 
1189 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  33.52 
 
 
1189 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  32.58 
 
 
1198 aa  570  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  33.36 
 
 
1189 aa  566  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  33.28 
 
 
1189 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  33.2 
 
 
1189 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  33.2 
 
 
1189 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  33.07 
 
 
1189 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  33.2 
 
 
1189 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  33.2 
 
 
1189 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  31.52 
 
 
1186 aa  561  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  32.62 
 
 
1188 aa  563  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  32.62 
 
 
1188 aa  563  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  32.74 
 
 
1189 aa  559  1e-157  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  31.49 
 
 
1190 aa  554  1e-156  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  33.83 
 
 
1185 aa  535  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  30.3 
 
 
1187 aa  524  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  29.95 
 
 
1185 aa  524  1e-147  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  32.06 
 
 
1179 aa  520  1e-146  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  31.79 
 
 
1174 aa  511  1e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  30.07 
 
 
1187 aa  492  1e-137  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  31.15 
 
 
1186 aa  491  1e-137  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  30.79 
 
 
1177 aa  479  1e-134  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  29.25 
 
 
1173 aa  479  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  29.81 
 
 
1176 aa  479  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  29.62 
 
 
1175 aa  474  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  29.43 
 
 
1177 aa  476  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  28.84 
 
 
1199 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  28.4 
 
 
1199 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  28.54 
 
 
1199 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  30.12 
 
 
1176 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  29.69 
 
 
1191 aa  462  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  28.58 
 
 
1204 aa  456  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  28.83 
 
 
1176 aa  452  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  28.4 
 
 
1176 aa  446  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  28.11 
 
 
1176 aa  444  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  27.29 
 
 
1185 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  30.21 
 
 
1186 aa  441  9.999999999999999e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  29.94 
 
 
1184 aa  436  1e-120  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  28.69 
 
 
1185 aa  431  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  28.53 
 
 
1201 aa  431  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  28.57 
 
 
1181 aa  427  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  30.35 
 
 
1172 aa  424  1e-117  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  29.19 
 
 
1170 aa  424  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  29.51 
 
 
1178 aa  424  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  27.46 
 
 
1255 aa  422  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  30.39 
 
 
1164 aa  422  1e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  29.72 
 
 
1178 aa  415  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  27.83 
 
 
1170 aa  412  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  29.55 
 
 
1177 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  30.1 
 
 
1180 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  29.13 
 
 
1179 aa  399  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  27.75 
 
 
1179 aa  391  1e-107  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  27.35 
 
 
1176 aa  389  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  33.13 
 
 
1185 aa  385  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  29.52 
 
 
1153 aa  372  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  25.63 
 
 
1164 aa  366  2e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  27.43 
 
 
1403 aa  365  2e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  25.63 
 
 
1134 aa  360  9.999999999999999e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  25.8 
 
 
1167 aa  355  4e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  28.33 
 
 
1174 aa  354  5.9999999999999994e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  25.67 
 
 
1164 aa  351  4e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  26.38 
 
 
1162 aa  348  3e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  25 
 
 
1168 aa  348  5e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  25.93 
 
 
1171 aa  347  6e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  24.71 
 
 
1167 aa  347  1e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  24.84 
 
 
1167 aa  346  2e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  25.85 
 
 
1167 aa  344  7e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  26.13 
 
 
1198 aa  343  9e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  26.28 
 
 
1168 aa  343  1e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  25.65 
 
 
1198 aa  342  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  25.67 
 
 
1175 aa  341  5e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1334  chromosome segregation protein SMC  25.83 
 
 
1171 aa  340  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0218063  normal  0.637516 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  25.9 
 
 
1171 aa  339  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  26.81 
 
 
1162 aa  339  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  25.83 
 
 
1171 aa  338  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  24.22 
 
 
1173 aa  336  2e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  25.35 
 
 
1175 aa  332  2e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  28.07 
 
 
1184 aa  330  9e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  25.77 
 
 
1268 aa  328  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  25.7 
 
 
1190 aa  325  3e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  25.56 
 
 
1170 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  26.89 
 
 
1174 aa  312  2e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  31.97 
 
 
1175 aa  307  1.0000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  24.04 
 
 
1171 aa  304  8.000000000000001e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  26.12 
 
 
1172 aa  300  9e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  26.82 
 
 
1189 aa  295  4e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  26.3 
 
 
1189 aa  291  4e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0855  chromosome segregation protein SMC  28.99 
 
 
1200 aa  291  5.0000000000000004e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00379552  normal  0.0307887 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  26.07 
 
 
1175 aa  289  2e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  25.95 
 
 
1189 aa  288  5.999999999999999e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>