More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1381 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 
1184 aa  2328    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  35.89 
 
 
1174 aa  643    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  34.62 
 
 
1171 aa  626  1e-178  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  34.75 
 
 
1175 aa  596  1e-169  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  31.91 
 
 
1188 aa  544  1e-153  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  32.52 
 
 
1189 aa  540  9.999999999999999e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  30.94 
 
 
1193 aa  531  1e-149  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  30.09 
 
 
1192 aa  512  1e-143  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  31.38 
 
 
1196 aa  491  1e-137  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  29.55 
 
 
1190 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  30.38 
 
 
1146 aa  485  1e-135  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  31.88 
 
 
1189 aa  484  1e-135  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  30.62 
 
 
1147 aa  481  1e-134  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  32.03 
 
 
1146 aa  479  1e-133  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  29.13 
 
 
1198 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  29.5 
 
 
1219 aa  471  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  31.71 
 
 
1189 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  28.78 
 
 
1226 aa  463  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  28.78 
 
 
1226 aa  462  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  30.41 
 
 
1149 aa  456  1e-127  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  31.47 
 
 
1189 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  31.15 
 
 
1146 aa  450  1e-125  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  28.3 
 
 
1208 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  31.08 
 
 
1172 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  30.13 
 
 
1191 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  28.85 
 
 
1217 aa  446  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  28.64 
 
 
1190 aa  424  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  28.32 
 
 
1187 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  27.92 
 
 
1188 aa  416  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  27.92 
 
 
1188 aa  416  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  30.33 
 
 
1196 aa  412  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  29.34 
 
 
1190 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  27.45 
 
 
1204 aa  412  1e-113  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  29.61 
 
 
1207 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  27.71 
 
 
1198 aa  405  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  28.26 
 
 
1201 aa  403  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  29.95 
 
 
1196 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  29.3 
 
 
1196 aa  400  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  30.41 
 
 
1194 aa  399  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  26.9 
 
 
1189 aa  388  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  28.42 
 
 
1187 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  30.36 
 
 
1196 aa  389  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  29.27 
 
 
1148 aa  387  1e-106  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  28.16 
 
 
1185 aa  388  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  27.28 
 
 
1191 aa  387  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  27.52 
 
 
1190 aa  386  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  28.85 
 
 
1183 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  25.34 
 
 
1187 aa  384  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  28.09 
 
 
1170 aa  377  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  27.61 
 
 
1189 aa  375  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  27.39 
 
 
1189 aa  372  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  26.79 
 
 
1189 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  27.43 
 
 
1189 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  26.73 
 
 
1174 aa  369  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  28 
 
 
1184 aa  367  1e-100  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  27.24 
 
 
1189 aa  366  1e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  27.24 
 
 
1189 aa  366  1e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  28.42 
 
 
1170 aa  366  2e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  26.49 
 
 
1186 aa  365  2e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  27.16 
 
 
1189 aa  364  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  27.16 
 
 
1189 aa  363  8e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  27.08 
 
 
1189 aa  363  9e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  27.91 
 
 
1179 aa  363  1e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  27.25 
 
 
1189 aa  362  3e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  27.25 
 
 
1189 aa  362  3e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  26.26 
 
 
1177 aa  360  9.999999999999999e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  27.99 
 
 
1177 aa  346  1e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  28.25 
 
 
1175 aa  346  2e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  25.32 
 
 
1185 aa  344  7e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  27.96 
 
 
1164 aa  340  9e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  25.81 
 
 
1187 aa  337  5.999999999999999e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  25.32 
 
 
1191 aa  335  4e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  26.57 
 
 
1185 aa  333  1e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  29.23 
 
 
1153 aa  321  5e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  26.64 
 
 
1176 aa  321  6e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  28.76 
 
 
1180 aa  318  4e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  24.52 
 
 
1204 aa  315  2.9999999999999996e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0765  chromosome segregation protein SMC  24.74 
 
 
1189 aa  312  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.430738 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  27.45 
 
 
1172 aa  313  2e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  25.12 
 
 
1148 aa  311  2.9999999999999997e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  31.33 
 
 
1189 aa  308  5.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  25.95 
 
 
1181 aa  306  1.0000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  24.96 
 
 
1176 aa  306  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  24.94 
 
 
1201 aa  301  4e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  24.36 
 
 
1177 aa  300  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  24.76 
 
 
1176 aa  300  1e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  24.48 
 
 
1255 aa  297  7e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46490  predicted protein  24.19 
 
 
1209 aa  296  1e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0173437 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  25.39 
 
 
1174 aa  296  2e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  25.43 
 
 
1175 aa  295  4e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  23.59 
 
 
1185 aa  295  5e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  26.5 
 
 
1174 aa  294  8e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05899  Condensin subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J150]  26.24 
 
 
1179 aa  292  2e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.566819 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  23.78 
 
 
1178 aa  287  7e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  23.84 
 
 
1186 aa  287  9e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59451  Chromosome segregation and condensation  24.74 
 
 
1171 aa  285  3.0000000000000004e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.819288  decreased coverage  0.00000261165 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03271  hypothetical protein  29.54 
 
 
1184 aa  283  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  24.72 
 
 
1176 aa  283  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  23.51 
 
 
1134 aa  279  3e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  24.6 
 
 
1179 aa  277  7e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>