More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_59451 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_05899  Condensin subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J150]  49.4 
 
 
1179 aa  1132    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.566819 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59451  Chromosome segregation and condensation  100 
 
 
1171 aa  2372    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.819288  decreased coverage  0.00000261165 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04180  nuclear condensin complex protein, putative  43.88 
 
 
1215 aa  928    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.360826  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_19472  predicted protein  36.6 
 
 
1186 aa  716    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.222049  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30352  predicted protein  37.42 
 
 
1213 aa  678    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  24.02 
 
 
1193 aa  270  1e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  24.5 
 
 
1184 aa  259  2e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  23.81 
 
 
1171 aa  258  4e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  25.02 
 
 
1188 aa  256  1.0000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  23.59 
 
 
1192 aa  255  3e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  26 
 
 
1172 aa  251  6e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  23.65 
 
 
1189 aa  249  3e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  25.84 
 
 
1191 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  23.45 
 
 
1187 aa  239  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  23.68 
 
 
1185 aa  236  2.0000000000000002e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  24.14 
 
 
1185 aa  234  6e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06364  Chromosome segregation protein sudA (DA-box protein sudA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00737]  23.07 
 
 
1215 aa  231  5e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  25.6 
 
 
1186 aa  231  8e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  25.14 
 
 
1189 aa  229  3e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  23.43 
 
 
1189 aa  227  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  22.75 
 
 
1174 aa  227  1e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  22.83 
 
 
1187 aa  226  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  23.23 
 
 
1189 aa  224  6e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  22.86 
 
 
1189 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  23.19 
 
 
1189 aa  222  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  24.1 
 
 
1217 aa  218  5e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46490  predicted protein  23.34 
 
 
1209 aa  217  9e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0173437 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  24.08 
 
 
1174 aa  217  9e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02930  chromosome associated protein, putative  24.29 
 
 
1208 aa  216  1.9999999999999998e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.828344  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  25.14 
 
 
1184 aa  216  1.9999999999999998e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_52607  predicted protein  22.78 
 
 
1232 aa  216  2.9999999999999995e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  23.79 
 
 
1147 aa  215  3.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  23.11 
 
 
1189 aa  214  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  23.11 
 
 
1189 aa  213  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  23.11 
 
 
1189 aa  213  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  24.25 
 
 
1208 aa  212  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  23.64 
 
 
1146 aa  210  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  23.03 
 
 
1189 aa  210  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  23.02 
 
 
1198 aa  208  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  22.95 
 
 
1189 aa  208  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  23.63 
 
 
1186 aa  208  5e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  23.64 
 
 
1190 aa  207  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  23.08 
 
 
1189 aa  206  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  23.08 
 
 
1189 aa  206  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  23.01 
 
 
1149 aa  206  3e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  23.58 
 
 
1187 aa  204  6e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  23 
 
 
1170 aa  203  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  23.24 
 
 
1196 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  24.96 
 
 
1177 aa  202  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  24.29 
 
 
1188 aa  201  7e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  24.29 
 
 
1188 aa  201  7e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  25.12 
 
 
1207 aa  199  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  23 
 
 
1170 aa  198  5.000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  23.89 
 
 
1190 aa  198  6e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  22.87 
 
 
1204 aa  197  1e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  23.4 
 
 
1191 aa  196  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  23.53 
 
 
1177 aa  195  4e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  23.64 
 
 
1181 aa  195  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  22.61 
 
 
1189 aa  195  5e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  23.75 
 
 
1180 aa  194  6e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  24.59 
 
 
1164 aa  192  2.9999999999999997e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  22.95 
 
 
1226 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  22.61 
 
 
1226 aa  185  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  22.51 
 
 
1219 aa  182  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  21.31 
 
 
1173 aa  178  5e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  24.22 
 
 
1201 aa  177  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  23.47 
 
 
1191 aa  176  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  24.28 
 
 
1196 aa  174  1e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  22.8 
 
 
1179 aa  173  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  24.06 
 
 
1153 aa  170  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  22.45 
 
 
1174 aa  167  1.0000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  22.6 
 
 
1176 aa  165  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  22.88 
 
 
1176 aa  163  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_641  chromosome condensation and segregation protein  26.36 
 
 
1011 aa  159  3e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15922  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25506  predicted protein  21.83 
 
 
1237 aa  159  4e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  21.47 
 
 
1201 aa  156  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02640  cohesin complex subunit psm1, putative  22.35 
 
 
1202 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  26.3 
 
 
1190 aa  148  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  23.66 
 
 
1179 aa  148  7.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  21.39 
 
 
1175 aa  147  9e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  20.87 
 
 
1186 aa  147  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  21.59 
 
 
1177 aa  147  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  25.43 
 
 
1148 aa  145  3e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  19.92 
 
 
1134 aa  138  6.0000000000000005e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2255  condensin subunit Smc  23.69 
 
 
1202 aa  138  7.000000000000001e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.204212 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  21.12 
 
 
1176 aa  138  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  23.24 
 
 
1082 aa  132  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  23.77 
 
 
1196 aa  132  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  24.55 
 
 
1146 aa  130  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf735  chromosome segregation ATPase Smc  25.03 
 
 
978 aa  128  8.000000000000001e-28  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03271  hypothetical protein  22.64 
 
 
1184 aa  127  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02963  subunit of the multiprotein cohesin complex (Eurofung)  23.55 
 
 
1261 aa  127  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.869659  normal  0.319828 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  26.69 
 
 
1174 aa  126  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  28.07 
 
 
1162 aa  126  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  24.72 
 
 
1162 aa  125  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  24.55 
 
 
1169 aa  125  5e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  24.17 
 
 
1185 aa  124  7e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  24.61 
 
 
1169 aa  124  7e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  24.71 
 
 
1194 aa  124  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1367  chromosome segregation protein SMC  32.4 
 
 
1186 aa  123  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.803555 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>