More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1420 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  38.71 
 
 
1190 aa  730    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  39.08 
 
 
1226 aa  707    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  100 
 
 
1183 aa  2378    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  39.24 
 
 
1208 aa  764    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  49.29 
 
 
1196 aa  1015    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  59.18 
 
 
1204 aa  1376    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  48.33 
 
 
1194 aa  980    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2255  condensin subunit Smc  59.87 
 
 
1202 aa  1339    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.204212 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  49.04 
 
 
1196 aa  999    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  39.17 
 
 
1217 aa  776    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  38.44 
 
 
1198 aa  696    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03271  hypothetical protein  60.81 
 
 
1184 aa  1371    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  61.12 
 
 
1207 aa  1395    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  39.37 
 
 
1226 aa  714    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  38.55 
 
 
1219 aa  736    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  98.48 
 
 
1201 aa  2340    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  48.49 
 
 
1196 aa  1005    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  32.12 
 
 
1175 aa  501  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  31.86 
 
 
1193 aa  469  9.999999999999999e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  32.08 
 
 
1171 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  31.3 
 
 
1189 aa  447  1.0000000000000001e-124  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  31.06 
 
 
1146 aa  439  1e-121  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  30.21 
 
 
1146 aa  439  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  30.78 
 
 
1149 aa  420  1e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  29.27 
 
 
1172 aa  375  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  28.76 
 
 
1146 aa  374  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2045  condensin subunit Smc  55.94 
 
 
1195 aa  326  2e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265343  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  26.57 
 
 
1189 aa  319  2e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  27.52 
 
 
1189 aa  315  2.9999999999999996e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  26.01 
 
 
1185 aa  284  7.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  26.27 
 
 
1187 aa  270  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  31.64 
 
 
1192 aa  265  4e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  25.16 
 
 
1190 aa  256  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  24.68 
 
 
1188 aa  250  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  24.68 
 
 
1188 aa  250  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  25.51 
 
 
1189 aa  241  6.999999999999999e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  24.64 
 
 
1189 aa  240  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  24.42 
 
 
1189 aa  236  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  24.25 
 
 
1191 aa  232  3e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  24.14 
 
 
1187 aa  228  5.0000000000000005e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  24.67 
 
 
1196 aa  225  4e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  39.53 
 
 
1174 aa  219  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  28.34 
 
 
1148 aa  218  4e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  24.58 
 
 
1164 aa  213  2e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  43.87 
 
 
1196 aa  209  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  47.83 
 
 
1188 aa  209  3e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  24.28 
 
 
1170 aa  204  8e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  25.26 
 
 
1179 aa  204  9.999999999999999e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  23.58 
 
 
1180 aa  203  1.9999999999999998e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  23.86 
 
 
1199 aa  201  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  27.93 
 
 
1198 aa  198  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  24.43 
 
 
1184 aa  198  6e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06364  Chromosome segregation protein sudA (DA-box protein sudA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00737]  24.41 
 
 
1215 aa  194  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  24 
 
 
1199 aa  193  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  23.84 
 
 
1199 aa  192  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  23.1 
 
 
1177 aa  191  1e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  23.7 
 
 
1170 aa  189  3e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  27.22 
 
 
1189 aa  189  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  26.47 
 
 
1189 aa  188  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  23.85 
 
 
1174 aa  188  6e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  27.38 
 
 
1189 aa  187  9e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  27.38 
 
 
1189 aa  187  9e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  26.48 
 
 
1189 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  27.09 
 
 
1189 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  27.09 
 
 
1189 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  27.1 
 
 
1189 aa  186  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  24.82 
 
 
1179 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  23.8 
 
 
1153 aa  182  2.9999999999999997e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04597  nuclear condensin complex subunit Smc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02170)  24.07 
 
 
1476 aa  178  5e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  24.94 
 
 
1185 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05899  Condensin subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J150]  23.84 
 
 
1179 aa  176  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.566819 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  22.77 
 
 
1177 aa  175  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  23.25 
 
 
1174 aa  175  3.9999999999999995e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  25.21 
 
 
1185 aa  174  7.999999999999999e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  40.25 
 
 
1191 aa  174  9e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  22.82 
 
 
1176 aa  172  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  26.31 
 
 
1186 aa  172  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  40 
 
 
1184 aa  166  2.0000000000000002e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  39.37 
 
 
1189 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  22.3 
 
 
1175 aa  164  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  22.75 
 
 
1167 aa  162  2e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  38.91 
 
 
1189 aa  162  3e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  22.67 
 
 
1167 aa  162  5e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46490  predicted protein  23 
 
 
1209 aa  160  1e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0173437 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  26.07 
 
 
1134 aa  158  5.0000000000000005e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  25.89 
 
 
1174 aa  158  6e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  26.93 
 
 
1187 aa  157  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  25.57 
 
 
1186 aa  155  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25506  predicted protein  24.14 
 
 
1237 aa  152  4e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  22.53 
 
 
1168 aa  147  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  40.18 
 
 
1195 aa  145  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  40.18 
 
 
1195 aa  145  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  40.18 
 
 
1195 aa  145  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  41.92 
 
 
1194 aa  145  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  40.48 
 
 
1217 aa  144  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  42.27 
 
 
1194 aa  143  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  41.79 
 
 
1194 aa  142  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  23.76 
 
 
1167 aa  142  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  25.57 
 
 
1175 aa  141  8.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  40.4 
 
 
1205 aa  139  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>