More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1491 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 
1226 aa  2468    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  40.35 
 
 
1207 aa  738    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  53.98 
 
 
1198 aa  1145    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03271  hypothetical protein  41.49 
 
 
1184 aa  751    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  39.68 
 
 
1183 aa  736    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  63.62 
 
 
1190 aa  1476    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  39.75 
 
 
1201 aa  768    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  56.92 
 
 
1208 aa  1268    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  41.15 
 
 
1204 aa  785    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2255  condensin subunit Smc  42.33 
 
 
1202 aa  774    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.204212 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  37.92 
 
 
1196 aa  720    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2045  condensin subunit Smc  49.88 
 
 
1195 aa  980    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265343  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  98.45 
 
 
1226 aa  2429    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  37.6 
 
 
1196 aa  732    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  37.98 
 
 
1196 aa  739    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  38.84 
 
 
1194 aa  730    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  51.42 
 
 
1219 aa  1172    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  54.2 
 
 
1217 aa  1242    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  31.89 
 
 
1174 aa  579  1.0000000000000001e-163  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  32.58 
 
 
1175 aa  569  1e-160  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  32.96 
 
 
1171 aa  566  1.0000000000000001e-159  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  33 
 
 
1192 aa  551  1e-155  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  34 
 
 
1189 aa  548  1e-154  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  31.97 
 
 
1188 aa  538  1e-151  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  33.07 
 
 
1146 aa  539  1e-151  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  31.49 
 
 
1193 aa  530  1e-149  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  32.7 
 
 
1146 aa  530  1e-149  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  32.86 
 
 
1147 aa  509  9.999999999999999e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  30.76 
 
 
1149 aa  499  1e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  31.52 
 
 
1146 aa  490  1e-137  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  28.55 
 
 
1184 aa  455  1.0000000000000001e-126  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  28.67 
 
 
1191 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  27.65 
 
 
1189 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  27.23 
 
 
1189 aa  382  1e-104  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  27.37 
 
 
1189 aa  371  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  27.08 
 
 
1187 aa  352  4e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  27.27 
 
 
1185 aa  332  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  26.88 
 
 
1188 aa  328  3e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  26.88 
 
 
1188 aa  328  3e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  27.61 
 
 
1190 aa  315  2.9999999999999996e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  26.5 
 
 
1189 aa  314  6.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  26.31 
 
 
1189 aa  308  3e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  26.73 
 
 
1190 aa  308  3e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  26.26 
 
 
1189 aa  308  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  25.98 
 
 
1189 aa  307  7e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  25.52 
 
 
1189 aa  306  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  25.35 
 
 
1196 aa  306  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  26.08 
 
 
1189 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  26.18 
 
 
1189 aa  306  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  26.19 
 
 
1189 aa  306  2.0000000000000002e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  26.18 
 
 
1189 aa  306  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  26.29 
 
 
1189 aa  304  6.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  26.29 
 
 
1189 aa  304  6.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  26.17 
 
 
1189 aa  298  4e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  27.4 
 
 
1198 aa  295  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  25.4 
 
 
1174 aa  295  3e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  25.64 
 
 
1185 aa  295  5e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  27.64 
 
 
1179 aa  294  6e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  24.75 
 
 
1174 aa  292  3e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  29.64 
 
 
1172 aa  287  9e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  25.64 
 
 
1191 aa  281  4e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  24.86 
 
 
1186 aa  280  9e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  25.2 
 
 
1186 aa  276  2.0000000000000002e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  25.49 
 
 
1177 aa  275  3e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  25.75 
 
 
1187 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  30.2 
 
 
1148 aa  266  2e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  25.9 
 
 
1184 aa  265  4e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  26.16 
 
 
1187 aa  261  7e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  24.18 
 
 
1199 aa  259  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  24.18 
 
 
1199 aa  259  3e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  23.95 
 
 
1170 aa  250  1e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  24.09 
 
 
1170 aa  249  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  24.49 
 
 
1176 aa  248  4.9999999999999997e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  25.55 
 
 
1177 aa  247  9e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  24.57 
 
 
1148 aa  243  1e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  25.51 
 
 
1308 aa  242  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  23.36 
 
 
1185 aa  241  8e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  24.29 
 
 
1187 aa  239  2e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  24.96 
 
 
1173 aa  237  8e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  23.35 
 
 
1180 aa  236  2.0000000000000002e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  24.69 
 
 
1174 aa  235  4.0000000000000004e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  23.51 
 
 
1176 aa  234  8.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  24.6 
 
 
1186 aa  232  3e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  25.29 
 
 
1179 aa  232  3e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  22.65 
 
 
1164 aa  231  7e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  25.16 
 
 
1191 aa  227  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  25.1 
 
 
1201 aa  222  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  24.94 
 
 
1179 aa  220  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  24.75 
 
 
1162 aa  219  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  22.22 
 
 
1178 aa  218  5e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64147  Structural maintenance of chromosome protein 1 (sister chromatid cohesion complex Cohesin, subunit SMC1)  24.52 
 
 
1240 aa  216  1.9999999999999998e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.471232 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  23.75 
 
 
1153 aa  216  2.9999999999999995e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  41.58 
 
 
1196 aa  213  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  26.24 
 
 
1185 aa  213  3e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02963  subunit of the multiprotein cohesin complex (Eurofung)  24.29 
 
 
1261 aa  211  6e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.869659  normal  0.319828 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  25.07 
 
 
1185 aa  209  4e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  23.92 
 
 
1177 aa  208  7e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  24.08 
 
 
1178 aa  207  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  23.13 
 
 
1162 aa  205  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  23.73 
 
 
1168 aa  204  8e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>