More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_64147 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001306  ANIA_02963  subunit of the multiprotein cohesin complex (Eurofung)  38.36 
 
 		 1261 aa  774    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.869659  normal  0.319828 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64147  Structural maintenance of chromosome protein 1 (sister chromatid cohesion complex Cohesin, subunit SMC1)  100 
 
 		 1240 aa  2509    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.471232 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02640  cohesin complex subunit psm1, putative  33.73 
 
 		 1202 aa  606  1.0000000000000001e-171  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30705  predicted protein  32.11 
 
 		 1225 aa  525  1e-147  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830885  normal  0.342415 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25506  predicted protein  31.2 
 
 		 1237 aa  500  1e-140  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  24.18 
 
 		 1171 aa  242  2.9999999999999997e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  24.31 
 
 		 1193 aa  239  3e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  24.9 
 
 		 1184 aa  233  2e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  24.5 
 
 		 1185 aa  230  1e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  24.01 
 
 		 1190 aa  223  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04597  nuclear condensin complex subunit Smc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02170)  25.49 
 
 		 1476 aa  219  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  23.66 
 
 		 1187 aa  213  2e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  23.97 
 
 		 1217 aa  206  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  24.24 
 
 		 1190 aa  202  5e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  23.93 
 
 		 1226 aa  200  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  24.56 
 
 		 1189 aa  198  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  23.94 
 
 		 1181 aa  196  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  28.17 
 
 		 1172 aa  193  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  25.08 
 
 		 1191 aa  189  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  24.09 
 
 		 1170 aa  179  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  23.64 
 
 		 1164 aa  177  9e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  21.91 
 
 		 1169 aa  177  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  21.91 
 
 		 1169 aa  175  5e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  26.75 
 
 		 1189 aa  172  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  25.54 
 
 		 1186 aa  164  1e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  25.96 
 
 		 1185 aa  161  7e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  26 
 
 		 1196 aa  160  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  24.39 
 
 		 1185 aa  159  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  26.13 
 
 		 1185 aa  158  7e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  24.86 
 
 		 1190 aa  156  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_242  predicted protein  43.68 
 
 		 1224 aa  153  3e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44165  predicted protein  44.24 
 
 		 1356 aa  151  7e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  24.8 
 
 		 1201 aa  149  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  25.11 
 
 		 1189 aa  148  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  24.39 
 
 		 1178 aa  147  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  24.79 
 
 		 1188 aa  145  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  24.79 
 
 		 1188 aa  145  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00970  conserved hypothetical protein  39.65 
 
 		 1540 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.895196  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  23.05 
 
 		 1179 aa  142  3.9999999999999997e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  29.46 
 
 		 1188 aa  137  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  25.21 
 
 		 1174 aa  135  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  24.47 
 
 		 1175 aa  127  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  24.97 
 
 		 1192 aa  125  4e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  36.63 
 
 		 1189 aa  124  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  31.1 
 
 		 1189 aa  123  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  27.09 
 
 		 1168 aa  122  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  27.17 
 
 		 1168 aa  122  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  21.5 
 
 		 1403 aa  122  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  35.61 
 
 		 1189 aa  121  7e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  24.46 
 
 		 1208 aa  120  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  31.53 
 
 		 1219 aa  120  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  25.3 
 
 		 1189 aa  120  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  37.65 
 
 		 1198 aa  120  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  32 
 
 		 1175 aa  119  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  30.3 
 
 		 1149 aa  119  3e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  25.11 
 
 		 1082 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  23.9 
 
 		 1179 aa  116  2.0000000000000002e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  24.16 
 
 		 1187 aa  117  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  38.18 
 
 		 1185 aa  117  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  32.11 
 
 		 1148 aa  116  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1496  chromosome partition protein SmC, putative  27.45 
 
 		 980 aa  116  3e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  33.16 
 
 		 1191 aa  116  3e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  40.82 
 
 		 1189 aa  115  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  23.64 
 
 		 1196 aa  115  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  31.07 
 
 		 1146 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  25.03 
 
 		 1189 aa  114  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  35.62 
 
 		 1174 aa  113  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  31.22 
 
 		 1187 aa  112  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  30.95 
 
 		 1194 aa  112  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  36.88 
 
 		 1148 aa  113  3e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06364  Chromosome segregation protein sudA (DA-box protein sudA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00737]  23.02 
 
 		 1215 aa  112  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2045  condensin subunit Smc  31.19 
 
 		 1195 aa  112  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  30.73 
 
 		 1196 aa  112  5e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  33.77 
 
 		 1167 aa  112  5e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  33.77 
 
 		 1167 aa  112  6e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  31.19 
 
 		 1204 aa  111  9.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  31.82 
 
 		 1167 aa  110  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  30.8 
 
 		 1165 aa  109  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  30.51 
 
 		 1162 aa  109  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  36.48 
 
 		 1224 aa  109  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1485  SMC domain protein  33.33 
 
 		 952 aa  109  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  34.51 
 
 		 1146 aa  108  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  31.71 
 
 		 1162 aa  108  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  40 
 
 		 1168 aa  108  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  32.66 
 
 		 1162 aa  107  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  35.85 
 
 		 1191 aa  107  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  38.46 
 
 		 1138 aa  107  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  30.49 
 
 		 1204 aa  107  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  29.82 
 
 		 1196 aa  107  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  32.51 
 
 		 1139 aa  107  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  38.46 
 
 		 1138 aa  107  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  38.46 
 
 		 1138 aa  107  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  38.46 
 
 		 1145 aa  107  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  40.94 
 
 		 1196 aa  106  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  38.46 
 
 		 1138 aa  107  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  33.48 
 
 		 1164 aa  106  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  31.93 
 
 		 1147 aa  107  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1334  chromosome segregation protein SMC  26.15 
 
 		 1171 aa  107  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0218063  normal  0.637516 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  26.34 
 
 		 1171 aa  106  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  38.41 
 
 		 1141 aa  105  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>