More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_44165 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001303  ANIA_04597  nuclear condensin complex subunit Smc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02170)  37.55 
 
 		 1476 aa  745    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00970  conserved hypothetical protein  37.23 
 
 		 1540 aa  767    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.895196  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44165  predicted protein  100 
 
 		 1356 aa  2770    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_242  predicted protein  42.42 
 
 		 1224 aa  862    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  24.3 
 
 		 1171 aa  229  4e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  23.15 
 
 		 1185 aa  224  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  24.85 
 
 		 1188 aa  221  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  24.85 
 
 		 1188 aa  221  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  24.31 
 
 		 1196 aa  220  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  23.13 
 
 		 1219 aa  216  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  24.64 
 
 		 1191 aa  208  5e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  25.06 
 
 		 1146 aa  206  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  25.5 
 
 		 1189 aa  205  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  22.76 
 
 		 1170 aa  194  7e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  25.11 
 
 		 1147 aa  193  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  27.42 
 
 		 1146 aa  189  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  24.15 
 
 		 1174 aa  187  8e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  23.99 
 
 		 1181 aa  184  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  24.68 
 
 		 1187 aa  166  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  24.2 
 
 		 1191 aa  166  3e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  22.08 
 
 		 1176 aa  161  9e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  23.99 
 
 		 1189 aa  157  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  24.1 
 
 		 1189 aa  157  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  24.1 
 
 		 1189 aa  157  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  25.24 
 
 		 1172 aa  157  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  23.99 
 
 		 1189 aa  157  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  23.99 
 
 		 1189 aa  157  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  24.1 
 
 		 1189 aa  152  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  24.1 
 
 		 1189 aa  152  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02963  subunit of the multiprotein cohesin complex (Eurofung)  41.27 
 
 		 1261 aa  152  4e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.869659  normal  0.319828 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  23.05 
 
 		 1177 aa  152  4e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64147  Structural maintenance of chromosome protein 1 (sister chromatid cohesion complex Cohesin, subunit SMC1)  44.24 
 
 		 1240 aa  151  8e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.471232 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  23.7 
 
 		 1301 aa  149  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46490  predicted protein  22.88 
 
 		 1209 aa  147  1e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0173437 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  25.59 
 
 		 1184 aa  145  5e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  25.68 
 
 		 1188 aa  144  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  26.02 
 
 		 1189 aa  142  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  23.92 
 
 		 1174 aa  140  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  23.9 
 
 		 1193 aa  140  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  37.5 
 
 		 1148 aa  139  4e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25506  predicted protein  40.99 
 
 		 1237 aa  137  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  38.42 
 
 		 1146 aa  135  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  25.87 
 
 		 1189 aa  135  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  24.75 
 
 		 1189 aa  135  3.9999999999999996e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  23.74 
 
 		 1187 aa  135  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  23.9 
 
 		 1175 aa  134  9e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02640  cohesin complex subunit psm1, putative  35.76 
 
 		 1202 aa  134  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  25.09 
 
 		 1190 aa  131  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  25.34 
 
 		 1198 aa  131  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2045  condensin subunit Smc  31.22 
 
 		 1195 aa  130  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265343  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02930  chromosome associated protein, putative  23.93 
 
 		 1208 aa  128  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.828344  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  33.02 
 
 		 1149 aa  128  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  30.2 
 
 		 1192 aa  127  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  24.09 
 
 		 1171 aa  126  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30705  predicted protein  35.79 
 
 		 1225 aa  126  4e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830885  normal  0.342415 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  25.04 
 
 		 1189 aa  125  6e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  34.48 
 
 		 1174 aa  124  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  24.25 
 
 		 1189 aa  124  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  39.22 
 
 		 1189 aa  124  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  24.48 
 
 		 1184 aa  123  3e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  26.29 
 
 		 1198 aa  122  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  21.83 
 
 		 1174 aa  121  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  33.9 
 
 		 1176 aa  121  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  25.73 
 
 		 1196 aa  120  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  33.9 
 
 		 1176 aa  120  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  34.2 
 
 		 1175 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  23.78 
 
 		 1217 aa  120  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  26.06 
 
 		 1207 aa  119  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  32.63 
 
 		 1175 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  32.8 
 
 		 1226 aa  117  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  24.49 
 
 		 1201 aa  116  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  32.8 
 
 		 1226 aa  116  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  33.9 
 
 		 1173 aa  115  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  23.15 
 
 		 1189 aa  115  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  30.84 
 
 		 1194 aa  114  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  30.88 
 
 		 1204 aa  114  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  36.46 
 
 		 1168 aa  114  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  24.66 
 
 		 1180 aa  113  2.0000000000000002e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2255  condensin subunit Smc  26.41 
 
 		 1202 aa  114  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.204212 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  25.85 
 
 		 1187 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  31.58 
 
 		 1190 aa  113  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  22.9 
 
 		 1189 aa  113  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  33.9 
 
 		 1177 aa  112  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03271  hypothetical protein  31.43 
 
 		 1184 aa  111  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2051  SMC domain protein  26.62 
 
 		 1080 aa  111  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.380302  normal  0.930097 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  35.29 
 
 		 1163 aa  110  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  32.49 
 
 		 1204 aa  111  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  23.18 
 
 		 1172 aa  110  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  36.9 
 
 		 1162 aa  109  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  32.4 
 
 		 1185 aa  109  4e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  31.05 
 
 		 1176 aa  109  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  36.9 
 
 		 1162 aa  109  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  32.14 
 
 		 1150 aa  108  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  36.9 
 
 		 1162 aa  108  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  32.14 
 
 		 1150 aa  108  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  35.23 
 
 		 1186 aa  108  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  32.56 
 
 		 1196 aa  108  6e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  32.56 
 
 		 1196 aa  108  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  37.02 
 
 		 1162 aa  108  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  37.57 
 
 		 1162 aa  108  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>