More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8008 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  50.61 
 
 		 1205 aa  961    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  59.95 
 
 		 1183 aa  1117    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  53.86 
 
 		 1195 aa  1031    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  52.52 
 
 		 1194 aa  1022    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  51.56 
 
 		 1217 aa  966    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  56.94 
 
 		 1188 aa  1009    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1224 aa  2395    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  51.11 
 
 		 1195 aa  976    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  57.62 
 
 		 1198 aa  1143    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  55.56 
 
 		 1203 aa  1028    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  54.24 
 
 		 1214 aa  1045    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  53.1 
 
 		 1222 aa  1027    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  57.67 
 
 		 1199 aa  1154    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  54.69 
 
 		 1213 aa  1031    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  57.71 
 
 		 1198 aa  1149    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  51.28 
 
 		 1195 aa  979    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  58.42 
 
 		 1186 aa  1082    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  52.45 
 
 		 1194 aa  1048    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  53.35 
 
 		 1217 aa  1053    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  56.61 
 
 		 1191 aa  1101    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  57.15 
 
 		 1191 aa  1036    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  58.58 
 
 		 1227 aa  1134    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  57.53 
 
 		 1191 aa  1207    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  55.28 
 
 		 1222 aa  1076    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  39.39 
 
 		 1225 aa  743    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  58.19 
 
 		 1188 aa  1080    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  57.26 
 
 		 1194 aa  1196    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  59.27 
 
 		 1181 aa  1079    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  61.51 
 
 		 1188 aa  1280    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  51.28 
 
 		 1195 aa  979    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  52.56 
 
 		 1194 aa  1024    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  71.98 
 
 		 1218 aa  538  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  31.53 
 
 		 1187 aa  495  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  50.52 
 
 		 1263 aa  496  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  70.98 
 
 		 1234 aa  495  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  31.19 
 
 		 1190 aa  492  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  32.88 
 
 		 1179 aa  486  1e-136  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  31.59 
 
 		 1189 aa  483  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  31.57 
 
 		 1189 aa  479  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  31.3 
 
 		 1189 aa  472  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  31.16 
 
 		 1189 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  31.3 
 
 		 1189 aa  472  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  31.52 
 
 		 1189 aa  473  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  31.54 
 
 		 1189 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  31.19 
 
 		 1189 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  31.03 
 
 		 1189 aa  465  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  28.61 
 
 		 1191 aa  463  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  31.03 
 
 		 1189 aa  465  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  31.19 
 
 		 1189 aa  466  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  34.96 
 
 		 1190 aa  464  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  30.03 
 
 		 1188 aa  462  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  30.03 
 
 		 1188 aa  462  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  32.06 
 
 		 1176 aa  458  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  29.23 
 
 		 1185 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  31.06 
 
 		 1186 aa  453  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  29.68 
 
 		 1189 aa  437  1e-121  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  30.78 
 
 		 1176 aa  437  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  31.31 
 
 		 1176 aa  437  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  29.96 
 
 		 1187 aa  430  1e-119  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  29.35 
 
 		 1185 aa  421  1e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  29.44 
 
 		 1177 aa  411  1e-113  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  29.64 
 
 		 1177 aa  382  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  29.2 
 
 		 1174 aa  381  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  25.43 
 
 		 1178 aa  376  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  28.54 
 
 		 1191 aa  370  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  29.94 
 
 		 1168 aa  369  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  27.19 
 
 		 1185 aa  365  3e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  30.32 
 
 		 1163 aa  363  9e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  62.08 
 
 		 1172 aa  363  1e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  27.65 
 
 		 1181 aa  355  4e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  27.49 
 
 		 1170 aa  353  2e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  27.7 
 
 		 1170 aa  347  5e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  29.33 
 
 		 1167 aa  347  1e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  28.33 
 
 		 1169 aa  346  2e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  28.17 
 
 		 1169 aa  345  2.9999999999999997e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  29.63 
 
 		 1167 aa  343  8e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  30.66 
 
 		 1171 aa  342  2.9999999999999998e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  29.55 
 
 		 1167 aa  342  2.9999999999999998e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  30.52 
 
 		 1198 aa  341  5.9999999999999996e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  30.36 
 
 		 1198 aa  340  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  29.62 
 
 		 1167 aa  338  2.9999999999999997e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  31.1 
 
 		 1175 aa  334  5e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  29.68 
 
 		 1171 aa  326  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  25.43 
 
 		 1164 aa  318  5e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1194  chromosome segregation protein SMC  31.19 
 
 		 1154 aa  312  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1066  chromosome segregation protein SMC  31.06 
 
 		 1154 aa  312  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  31.51 
 
 		 1196 aa  307  8.000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  31.56 
 
 		 1190 aa  305  5.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  29.55 
 
 		 1403 aa  300  2e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  34.01 
 
 		 1187 aa  296  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  28.93 
 
 		 1185 aa  297  1e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  33.52 
 
 		 1198 aa  291  8e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  27.92 
 
 		 1171 aa  290  9e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  33.63 
 
 		 1185 aa  290  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  27.63 
 
 		 1308 aa  289  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  40.87 
 
 		 1174 aa  284  8.000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1367  chromosome segregation protein SMC  54.96 
 
 		 1186 aa  278  6e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.803555 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  22.26 
 
 		 1174 aa  275  4.0000000000000004e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  23.71 
 
 		 1153 aa  274  8.000000000000001e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  48.56 
 
 		 1184 aa  271  5e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>