More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1194 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0745  chromosome segregation protein SMC  50 
 
 		 1150 aa  939    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.525394  normal  0.893736 
 
 
-
 
NC_004310  BR0497  SMC family protein  52.18 
 
 		 1152 aa  1011    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3824  chromosome segregation protein SMC  55.04 
 
 		 1151 aa  1032    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0542546 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4983  chromosome segregation protein SMC  87.95 
 
 		 1154 aa  1883    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127534  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2608  chromosome segregation protein SMC  77.57 
 
 		 1168 aa  1674    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198178  normal  0.335966 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3248  condensin subunit Smc  44.97 
 
 		 1167 aa  736    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0613  chromosome segregation protein SMC  51.17 
 
 		 1152 aa  986    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0163  chromosome segregation protein SMC  45.8 
 
 		 1150 aa  734    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1066  chromosome segregation protein SMC  93.07 
 
 		 1154 aa  2048    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0374  chromosome segregation protein SMC  44.02 
 
 		 1151 aa  790    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4374  chromosome segregation protein SMC  81.54 
 
 		 1154 aa  1781    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95695  normal  0.0465691 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1095  chromosome segregation protein  51.66 
 
 		 1153 aa  1011    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1194  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1154 aa  2270    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3230  chromosome segregation protein SMC  78.08 
 
 		 1170 aa  1658    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2587  chromosome segregation protein SMC  44.33 
 
 		 1151 aa  809    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000427179 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0768  condensin subunit Smc  53.1 
 
 		 1152 aa  946    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1981  chromosome segregation protein SMC  56.35 
 
 		 1150 aa  995    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0500  chromosome segregation protein SMC  52.26 
 
 		 1152 aa  1013    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.169399  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2199  condensin subunit Smc  44.34 
 
 		 1148 aa  720    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.53129 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0716  chromosome segregation protein SMC  51.78 
 
 		 1153 aa  995    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0699  chromosome segregation protein SMC  50.78 
 
 		 1153 aa  983    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0657  chromosome segregation protein SMC  51.09 
 
 		 1153 aa  971    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.915586  normal  0.754344 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0547  chromosome segregation protein SMC  50.83 
 
 		 1153 aa  977    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.725203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2318  condensin subunit Smc  76.26 
 
 		 1154 aa  1630    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4694  chromosome segregation protein SMC  46.81 
 
 		 1140 aa  429  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  32.29 
 
 		 1175 aa  401  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  30.34 
 
 		 1173 aa  395  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  31.96 
 
 		 1182 aa  396  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  30.46 
 
 		 1177 aa  385  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  29.76 
 
 		 1173 aa  379  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  26.51 
 
 		 1191 aa  378  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  30.14 
 
 		 1142 aa  378  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  30.03 
 
 		 1142 aa  378  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  28.36 
 
 		 1189 aa  375  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  31.33 
 
 		 1167 aa  374  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  30.03 
 
 		 1142 aa  375  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  27.81 
 
 		 1169 aa  367  1e-100  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  31.04 
 
 		 1164 aa  370  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  28.81 
 
 		 1189 aa  368  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7655  chromosome segregation protein SMC  62.58 
 
 		 1148 aa  367  1e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00190533  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  29.05 
 
 		 1164 aa  361  4e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  26.7 
 
 		 1185 aa  361  4e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  28.42 
 
 		 1189 aa  360  6e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  28.42 
 
 		 1189 aa  360  6e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  28.56 
 
 		 1189 aa  360  7e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  28.44 
 
 		 1189 aa  360  8e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  28.58 
 
 		 1164 aa  359  1.9999999999999998e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  28.65 
 
 		 1189 aa  358  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  29.85 
 
 		 1168 aa  358  2.9999999999999997e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  27.4 
 
 		 1189 aa  351  4e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  27.65 
 
 		 1189 aa  350  1e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  27.65 
 
 		 1189 aa  350  1e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4373  chromosome segregation protein SMC  53.65 
 
 		 1153 aa  350  1e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.991905 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  29.52 
 
 		 1167 aa  345  4e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0876  chromosome segregation protein SMC2  52.87 
 
 		 1151 aa  344  5e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.601564  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  26.01 
 
 		 1190 aa  344  5.999999999999999e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  27.26 
 
 		 1186 aa  343  1e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  27.57 
 
 		 1185 aa  342  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  29.3 
 
 		 1167 aa  341  4e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  27.91 
 
 		 1189 aa  337  1e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2738  chromosome segregation protein SMC  51.83 
 
 		 1167 aa  334  6e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0144  chromosome segregation protein SMC  64.48 
 
 		 1170 aa  333  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6942  chromosome segregation protein SMC  68.13 
 
 		 1144 aa  332  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0702595 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2536  chromosome segregation protein SMC  63.71 
 
 		 1170 aa  327  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0955  chromosome segregation protein SMC  51.31 
 
 		 1147 aa  325  3e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  25.65 
 
 		 1176 aa  323  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  25.59 
 
 		 1190 aa  320  9e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  28.83 
 
 		 1179 aa  303  1e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2270  chromosome segregation protein SMC  66.19 
 
 		 1147 aa  299  2e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0064  SMC domain protein  40.53 
 
 		 1511 aa  298  3e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0434137 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  26.34 
 
 		 1181 aa  285  4.0000000000000003e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  22.94 
 
 		 1174 aa  280  1e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  24.84 
 
 		 1164 aa  270  8e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0399  chromosome segregation protein SMC  55.02 
 
 		 1165 aa  267  7e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.489923  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  28.46 
 
 		 1308 aa  259  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  54.55 
 
 		 1176 aa  229  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  34.42 
 
 		 1175 aa  226  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  54.04 
 
 		 1176 aa  225  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  35.52 
 
 		 1204 aa  222  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  45.49 
 
 		 1195 aa  219  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  51.69 
 
 		 1176 aa  219  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  47.06 
 
 		 1181 aa  218  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  33.27 
 
 		 1165 aa  217  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  35.67 
 
 		 1171 aa  216  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  49.05 
 
 		 1198 aa  215  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  42.05 
 
 		 1170 aa  214  5.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  49.08 
 
 		 1165 aa  213  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  46.79 
 
 		 1175 aa  214  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  48.54 
 
 		 1167 aa  211  5e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  48.57 
 
 		 1199 aa  211  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  48.57 
 
 		 1199 aa  211  5e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  48.67 
 
 		 1403 aa  210  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  30.88 
 
 		 1170 aa  206  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  44.79 
 
 		 1164 aa  206  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1736  chromosome segregation protein SMC  47.22 
 
 		 814 aa  206  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00195971  unclonable  0.00000000014199 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  48.53 
 
 		 1170 aa  206  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  48.53 
 
 		 1170 aa  206  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  48.53 
 
 		 1170 aa  205  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  48.53 
 
 		 1170 aa  205  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2059  chromosome segregation protein SMC  48.53 
 
 		 1142 aa  204  7e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>