More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2776 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  50.32 
 
 
1214 aa  928    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  50.08 
 
 
1195 aa  898    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  55.79 
 
 
1188 aa  964    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  57.14 
 
 
1183 aa  1058    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  41.06 
 
 
1225 aa  737    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  48.82 
 
 
1217 aa  926    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  56.25 
 
 
1198 aa  1085    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  50.47 
 
 
1194 aa  919    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  49.69 
 
 
1195 aa  929    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  55.45 
 
 
1224 aa  1154    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  64.13 
 
 
1218 aa  1167    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  52.29 
 
 
1222 aa  984    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  48.39 
 
 
1205 aa  889    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  49.69 
 
 
1194 aa  906    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  50.2 
 
 
1195 aa  900    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  53.52 
 
 
1194 aa  1085    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 
1234 aa  2341    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  70.54 
 
 
1227 aa  1362    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  52.59 
 
 
1191 aa  936    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  54.68 
 
 
1191 aa  1103    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  50.51 
 
 
1213 aa  907    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  51.24 
 
 
1222 aa  973    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  56.74 
 
 
1198 aa  1105    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  50.32 
 
 
1194 aa  955    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  54.96 
 
 
1188 aa  1086    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  50.2 
 
 
1195 aa  900    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  57.3 
 
 
1181 aa  579  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  67.7 
 
 
1199 aa  521  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  73.12 
 
 
1188 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  51.22 
 
 
1186 aa  515  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  32 
 
 
1187 aa  512  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  60.04 
 
 
1263 aa  510  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  34.43 
 
 
1187 aa  509  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  28.82 
 
 
1190 aa  503  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  65.9 
 
 
1203 aa  474  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  28.19 
 
 
1185 aa  473  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  27.47 
 
 
1190 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  28.62 
 
 
1191 aa  461  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  63.4 
 
 
1217 aa  457  1e-127  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  32.35 
 
 
1176 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  30.35 
 
 
1189 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  31.87 
 
 
1176 aa  451  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  30.67 
 
 
1187 aa  449  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  32.06 
 
 
1198 aa  446  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  30.52 
 
 
1176 aa  445  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  28.42 
 
 
1148 aa  440  9.999999999999999e-123  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  27.99 
 
 
1189 aa  438  1e-121  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  32.69 
 
 
1173 aa  437  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  62.22 
 
 
1191 aa  430  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  26.35 
 
 
1188 aa  428  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  29.41 
 
 
1204 aa  429  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  26.35 
 
 
1188 aa  428  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  29.56 
 
 
1186 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  25.62 
 
 
1178 aa  401  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  29.98 
 
 
1177 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  28.49 
 
 
1184 aa  397  1e-109  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  30.64 
 
 
1177 aa  395  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  28.2 
 
 
1179 aa  393  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  66.13 
 
 
1172 aa  387  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  27.79 
 
 
1186 aa  382  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  26.19 
 
 
1175 aa  377  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  28.67 
 
 
1178 aa  366  2e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  25.42 
 
 
1176 aa  359  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  31.57 
 
 
1182 aa  346  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  31.71 
 
 
1175 aa  345  2.9999999999999997e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  30.44 
 
 
1171 aa  344  7e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  30.05 
 
 
1171 aa  344  7e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  24.14 
 
 
1180 aa  343  8e-93  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  28.38 
 
 
1138 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  30.91 
 
 
1204 aa  338  3.9999999999999995e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  31.78 
 
 
1175 aa  337  5.999999999999999e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  28.61 
 
 
1142 aa  335  3e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  28.22 
 
 
1142 aa  335  3e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  30.73 
 
 
1198 aa  332  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  24.63 
 
 
1164 aa  323  9.999999999999999e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2608  chromosome segregation protein SMC  30.74 
 
 
1168 aa  320  1e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198178  normal  0.335966 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1066  chromosome segregation protein SMC  32.27 
 
 
1154 aa  316  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  37.29 
 
 
1185 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  33.85 
 
 
1179 aa  296  2e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  31.02 
 
 
1196 aa  295  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  22 
 
 
1174 aa  294  8e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  23.33 
 
 
1153 aa  290  1e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  27.25 
 
 
1171 aa  283  1e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  27.95 
 
 
1308 aa  283  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  40.76 
 
 
1174 aa  281  6e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1367  chromosome segregation protein SMC  55.88 
 
 
1186 aa  281  7e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.803555 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  31.2 
 
 
1189 aa  281  8e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  31 
 
 
1189 aa  277  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  23.44 
 
 
1189 aa  276  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  45.45 
 
 
1176 aa  275  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  32.13 
 
 
1189 aa  275  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  32.13 
 
 
1189 aa  275  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  30.52 
 
 
1189 aa  273  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  22.73 
 
 
1191 aa  273  1e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  31.16 
 
 
1189 aa  273  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  31.16 
 
 
1189 aa  271  4e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  35.18 
 
 
1187 aa  271  4e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  32.82 
 
 
1174 aa  271  5e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  31.16 
 
 
1189 aa  271  5.9999999999999995e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  31.16 
 
 
1189 aa  271  8e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>