More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_10940 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  52.97 
 
 
1191 aa  902    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  51.81 
 
 
1224 aa  1005    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  50.41 
 
 
1194 aa  967    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  48.75 
 
 
1194 aa  912    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  49.96 
 
 
1191 aa  972    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  52.25 
 
 
1195 aa  947    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  50.69 
 
 
1214 aa  926    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  41.56 
 
 
1225 aa  740    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  49.1 
 
 
1205 aa  901    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  51.23 
 
 
1183 aa  891    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  50.12 
 
 
1199 aa  951    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  51.35 
 
 
1198 aa  929    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  41.07 
 
 
1172 aa  700    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  49.11 
 
 
1195 aa  921    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  53.54 
 
 
1186 aa  962    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  48.38 
 
 
1194 aa  915    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  50.45 
 
 
1198 aa  917    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  50.68 
 
 
1222 aa  868    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  48.87 
 
 
1195 aa  915    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  49.59 
 
 
1217 aa  921    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  50.48 
 
 
1218 aa  867    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  52.89 
 
 
1191 aa  1019    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  49.11 
 
 
1195 aa  921    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  52.24 
 
 
1213 aa  957    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  53.62 
 
 
1222 aa  1011    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  49.88 
 
 
1194 aa  952    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  50.93 
 
 
1188 aa  853    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  100 
 
 
1217 aa  2329    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  52.63 
 
 
1188 aa  923    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  53.03 
 
 
1203 aa  942    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  53.05 
 
 
1188 aa  1023    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  50.64 
 
 
1181 aa  499  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  32.15 
 
 
1187 aa  485  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  49.37 
 
 
1227 aa  486  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  27.82 
 
 
1190 aa  458  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  27.34 
 
 
1185 aa  449  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  26.48 
 
 
1191 aa  447  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  29.13 
 
 
1189 aa  444  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  31.15 
 
 
1176 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  31.33 
 
 
1176 aa  439  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  30.63 
 
 
1176 aa  434  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  32.29 
 
 
1177 aa  434  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  29.29 
 
 
1189 aa  433  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  29.29 
 
 
1189 aa  433  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  67.37 
 
 
1234 aa  431  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  32.27 
 
 
1175 aa  428  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  29.2 
 
 
1187 aa  427  1e-118  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  27.27 
 
 
1188 aa  426  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  32.73 
 
 
1173 aa  424  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  27.27 
 
 
1188 aa  426  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  29.11 
 
 
1186 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  28.84 
 
 
1179 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  29.64 
 
 
1204 aa  411  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  32.94 
 
 
1176 aa  411  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  26.97 
 
 
1148 aa  400  9.999999999999999e-111  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  29.11 
 
 
1177 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  28.22 
 
 
1186 aa  397  1e-109  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  32.06 
 
 
1199 aa  382  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  31.9 
 
 
1199 aa  383  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  25.49 
 
 
1177 aa  375  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  26.3 
 
 
1185 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  26.56 
 
 
1181 aa  347  6e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  28.77 
 
 
1168 aa  347  1e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  30.09 
 
 
1182 aa  343  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  64.79 
 
 
1263 aa  337  7.999999999999999e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  30.74 
 
 
1175 aa  334  6e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  30.47 
 
 
1174 aa  327  1e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  29.74 
 
 
1175 aa  322  3.9999999999999996e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  29.2 
 
 
1170 aa  321  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  28.93 
 
 
1171 aa  315  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  28.08 
 
 
1171 aa  314  5.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  30.47 
 
 
1198 aa  314  7.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  26.25 
 
 
1170 aa  312  2.9999999999999997e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  30.41 
 
 
1181 aa  310  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  30.31 
 
 
1198 aa  308  4.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  25.1 
 
 
1170 aa  308  4.0000000000000004e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  28.52 
 
 
1190 aa  300  1e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  30.54 
 
 
1185 aa  292  3e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  31.24 
 
 
1190 aa  291  5.0000000000000004e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  37.64 
 
 
1179 aa  288  5e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  30.77 
 
 
1196 aa  285  5.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  23.87 
 
 
1184 aa  280  8e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  22.8 
 
 
1153 aa  280  1e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  29.44 
 
 
1308 aa  280  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  39.05 
 
 
1174 aa  279  2e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1367  chromosome segregation protein SMC  56.41 
 
 
1186 aa  278  5e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.803555 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  21.53 
 
 
1174 aa  278  6e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  27.31 
 
 
1134 aa  273  2e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  53.72 
 
 
1184 aa  272  2.9999999999999997e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  35.86 
 
 
1187 aa  270  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  32.71 
 
 
1187 aa  268  2.9999999999999995e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  33.49 
 
 
1185 aa  267  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  52.8 
 
 
1185 aa  260  1e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  52.34 
 
 
1185 aa  258  4e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  33.81 
 
 
1190 aa  258  6e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  30.96 
 
 
1189 aa  251  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  30.37 
 
 
1174 aa  250  1e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  31.18 
 
 
1189 aa  249  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  28.76 
 
 
1189 aa  248  4e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  31.48 
 
 
1176 aa  247  8e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>