More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12936 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  52.08 
 
 
1186 aa  914    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  48.9 
 
 
1213 aa  850    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  50.37 
 
 
1203 aa  912    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  75.56 
 
 
1195 aa  1572    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  51.24 
 
 
1183 aa  905    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  75.93 
 
 
1194 aa  1600    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  62.78 
 
 
1194 aa  1318    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  100 
 
 
1205 aa  2356    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  75.86 
 
 
1194 aa  1607    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  49.59 
 
 
1181 aa  869    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  40.15 
 
 
1172 aa  670    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  47.67 
 
 
1222 aa  873    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  75.36 
 
 
1195 aa  1565    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  49.58 
 
 
1195 aa  900    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  55.43 
 
 
1198 aa  1046    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  53.51 
 
 
1191 aa  1031    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  61.65 
 
 
1217 aa  1276    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  54.95 
 
 
1198 aa  1036    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  55.33 
 
 
1214 aa  1036    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  57.11 
 
 
1194 aa  1158    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  75.56 
 
 
1195 aa  1572    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  56.97 
 
 
1199 aa  1160    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  50.94 
 
 
1224 aa  1002    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  48.74 
 
 
1217 aa  877    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  39.28 
 
 
1225 aa  686    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  49.55 
 
 
1191 aa  936    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  48.92 
 
 
1222 aa  885    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  50.12 
 
 
1191 aa  870    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  55.07 
 
 
1188 aa  900    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  52.32 
 
 
1188 aa  918    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  51.75 
 
 
1188 aa  1002    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  50.57 
 
 
1227 aa  509  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  31.07 
 
 
1187 aa  501  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  32.59 
 
 
1187 aa  481  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  28.43 
 
 
1196 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  27.51 
 
 
1185 aa  457  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  31.72 
 
 
1176 aa  456  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  31.54 
 
 
1177 aa  446  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  29.56 
 
 
1186 aa  437  1e-121  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  31.55 
 
 
1175 aa  424  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  69.01 
 
 
1234 aa  424  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  32.25 
 
 
1173 aa  424  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  64.16 
 
 
1218 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  29.33 
 
 
1176 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  45.12 
 
 
1263 aa  415  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  28.95 
 
 
1186 aa  413  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  29.63 
 
 
1204 aa  405  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  31.62 
 
 
1199 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  28.97 
 
 
1174 aa  401  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  31.26 
 
 
1199 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  31.55 
 
 
1199 aa  399  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  24.28 
 
 
1175 aa  365  3e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  23.85 
 
 
1180 aa  354  5e-96  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  29.82 
 
 
1167 aa  351  5e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  31.53 
 
 
1174 aa  343  1e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  32.31 
 
 
1190 aa  342  2.9999999999999998e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  24.82 
 
 
1170 aa  341  5e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  27.16 
 
 
1181 aa  337  7.999999999999999e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  31.17 
 
 
1190 aa  337  1e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  28.32 
 
 
1134 aa  310  9e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  22.22 
 
 
1174 aa  302  3e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  32.75 
 
 
1189 aa  299  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  30.67 
 
 
1186 aa  299  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  29.73 
 
 
1185 aa  298  4e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  32.75 
 
 
1189 aa  296  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  22.93 
 
 
1153 aa  295  3e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  29.27 
 
 
1191 aa  290  1e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  32.7 
 
 
1189 aa  289  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  32.7 
 
 
1189 aa  289  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  32.7 
 
 
1189 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  32.7 
 
 
1189 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  59.83 
 
 
1179 aa  288  2.9999999999999996e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  31.28 
 
 
1177 aa  288  4e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  32.7 
 
 
1189 aa  288  4e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  32.16 
 
 
1189 aa  288  5.999999999999999e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  32.7 
 
 
1189 aa  287  7e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  51.39 
 
 
1184 aa  287  7e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  32.7 
 
 
1189 aa  287  7e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  36.78 
 
 
1174 aa  287  7e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  27.33 
 
 
1188 aa  286  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  27.33 
 
 
1188 aa  286  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  32.03 
 
 
1189 aa  286  2.0000000000000002e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  28.31 
 
 
1189 aa  280  8e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  29.09 
 
 
1184 aa  273  1e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  28.24 
 
 
1179 aa  271  8e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  33.38 
 
 
1301 aa  270  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  44.73 
 
 
1190 aa  270  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  30 
 
 
1177 aa  269  2e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  52.91 
 
 
1185 aa  263  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  52.47 
 
 
1185 aa  260  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  30.74 
 
 
1185 aa  258  7e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  32.35 
 
 
1185 aa  251  6e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  54.9 
 
 
1187 aa  248  6.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  26.27 
 
 
1177 aa  247  8e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  26.89 
 
 
1185 aa  247  9e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  27.7 
 
 
1178 aa  246  1.9999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  24.76 
 
 
1149 aa  244  5e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  28.49 
 
 
1178 aa  243  1e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1367  chromosome segregation protein SMC  49.54 
 
 
1186 aa  231  5e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.803555 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  27.86 
 
 
1148 aa  230  1e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>