More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2076 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  39.85 
 
 		 1172 aa  682    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  50.25 
 
 		 1213 aa  888    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  55.42 
 
 		 1214 aa  1055    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  51.39 
 
 		 1181 aa  875    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  49.47 
 
 		 1217 aa  886    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  67.42 
 
 		 1194 aa  1406    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  56.26 
 
 		 1198 aa  1062    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1217 aa  2383    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  52.91 
 
 		 1191 aa  1008    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  54.67 
 
 		 1183 aa  949    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  66.22 
 
 		 1195 aa  1348    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  49.88 
 
 		 1218 aa  879    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  51.86 
 
 		 1191 aa  912    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  55.7 
 
 		 1198 aa  1048    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  54.79 
 
 		 1191 aa  1094    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  66.06 
 
 		 1195 aa  1345    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  59.93 
 
 		 1199 aa  1208    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  50.68 
 
 		 1222 aa  944    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  66.53 
 
 		 1194 aa  1362    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  66.19 
 
 		 1194 aa  1355    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  52.8 
 
 		 1186 aa  924    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  39.78 
 
 		 1225 aa  724    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  66.22 
 
 		 1195 aa  1348    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  52.75 
 
 		 1195 aa  969    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  55.11 
 
 		 1188 aa  918    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  53.35 
 
 		 1224 aa  1085    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  51.28 
 
 		 1203 aa  926    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  52.23 
 
 		 1222 aa  974    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  61.57 
 
 		 1205 aa  1244    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  52.72 
 
 		 1188 aa  924    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  59.4 
 
 		 1194 aa  1219    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  52.77 
 
 		 1188 aa  1029    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  51.1 
 
 		 1227 aa  517  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  28.96 
 
 		 1190 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  32.81 
 
 		 1179 aa  480  1e-134  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  55.99 
 
 		 1263 aa  477  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  27.1 
 
 		 1190 aa  477  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  29.47 
 
 		 1187 aa  475  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  28.34 
 
 		 1196 aa  464  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  26.62 
 
 		 1191 aa  462  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  31.99 
 
 		 1187 aa  462  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  30.03 
 
 		 1187 aa  450  1e-125  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  31.5 
 
 		 1176 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  28.66 
 
 		 1188 aa  441  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  28.66 
 
 		 1188 aa  441  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  31.06 
 
 		 1177 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  67.89 
 
 		 1234 aa  438  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  30.95 
 
 		 1173 aa  438  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  30.56 
 
 		 1176 aa  435  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  29.08 
 
 		 1186 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  30.4 
 
 		 1175 aa  429  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  26.55 
 
 		 1185 aa  425  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  29.22 
 
 		 1174 aa  419  9.999999999999999e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  28.46 
 
 		 1186 aa  419  9.999999999999999e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  29.53 
 
 		 1204 aa  413  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  27.24 
 
 		 1189 aa  412  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  29.15 
 
 		 1184 aa  400  9.999999999999999e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  28.48 
 
 		 1179 aa  397  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  28.07 
 
 		 1189 aa  399  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  31.52 
 
 		 1199 aa  400  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  26.02 
 
 		 1177 aa  395  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  31.33 
 
 		 1199 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  31.33 
 
 		 1199 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  25.04 
 
 		 1178 aa  386  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  26.45 
 
 		 1185 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  28.11 
 
 		 1181 aa  369  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  26.87 
 
 		 1179 aa  365  3e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  29.99 
 
 		 1168 aa  365  4e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  30.73 
 
 		 1164 aa  354  7e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  29.25 
 
 		 1167 aa  349  2e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  30.16 
 
 		 1164 aa  342  2e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  28.47 
 
 		 1167 aa  342  2e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  29.59 
 
 		 1198 aa  342  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  28.17 
 
 		 1171 aa  337  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  29.59 
 
 		 1181 aa  332  3e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  24.96 
 
 		 1164 aa  329  2.0000000000000001e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  25.1 
 
 		 1170 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  31.05 
 
 		 1185 aa  308  3e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  24.74 
 
 		 1170 aa  308  6e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4983  chromosome segregation protein SMC  30.25 
 
 		 1154 aa  296  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127534  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  29.39 
 
 		 1403 aa  295  3e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  39.61 
 
 		 1174 aa  291  4e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1367  chromosome segregation protein SMC  59.24 
 
 		 1186 aa  290  2e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.803555 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  33.48 
 
 		 1198 aa  283  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  28.08 
 
 		 1134 aa  280  2e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  22.41 
 
 		 1153 aa  278  4e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  29.41 
 
 		 1177 aa  274  6e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  20.97 
 
 		 1174 aa  274  7e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  32.93 
 
 		 1187 aa  274  7e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  23 
 
 		 1172 aa  270  1e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  32.08 
 
 		 1190 aa  269  2.9999999999999995e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  34.25 
 
 		 1185 aa  266  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  32.15 
 
 		 1301 aa  266  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  30.12 
 
 		 1189 aa  263  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  29.82 
 
 		 1189 aa  259  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  51.57 
 
 		 1185 aa  257  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3688  SMC domain protein  49.28 
 
 		 1081 aa  254  8.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860198 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  22.62 
 
 		 1189 aa  248  6.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  50.92 
 
 		 1184 aa  246  9.999999999999999e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  53.52 
 
 		 1189 aa  246  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>