More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0655 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  54.95 
 
 
1214 aa  1017    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  54.33 
 
 
1195 aa  1019    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  43.36 
 
 
1172 aa  747    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  57.18 
 
 
1191 aa  1164    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  51.61 
 
 
1217 aa  929    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  60.7 
 
 
1218 aa  1127    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  100 
 
 
1183 aa  2277    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  58.99 
 
 
1194 aa  1186    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  60.17 
 
 
1224 aa  1283    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  58.91 
 
 
1198 aa  1142    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  54.83 
 
 
1203 aa  983    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  56.11 
 
 
1191 aa  1021    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  52.99 
 
 
1213 aa  959    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  54.6 
 
 
1222 aa  989    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  42.53 
 
 
1225 aa  780    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  52.79 
 
 
1194 aa  985    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  51.32 
 
 
1205 aa  951    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  57.63 
 
 
1191 aa  1023    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  58.89 
 
 
1188 aa  1019    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  58.52 
 
 
1186 aa  1048    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  54.66 
 
 
1195 aa  1012    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  54.14 
 
 
1194 aa  1023    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  59.01 
 
 
1198 aa  1150    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  55.07 
 
 
1217 aa  1034    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  69.76 
 
 
1181 aa  1292    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  54.58 
 
 
1195 aa  1011    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  58.2 
 
 
1227 aa  1096    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  55.09 
 
 
1222 aa  1048    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  58.67 
 
 
1188 aa  1006    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  56.94 
 
 
1188 aa  1147    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  57.73 
 
 
1199 aa  1124    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  54.66 
 
 
1195 aa  1012    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  52.54 
 
 
1194 aa  995    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  32.14 
 
 
1187 aa  521  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  79.2 
 
 
1234 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  29.64 
 
 
1190 aa  501  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  29.04 
 
 
1185 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  31.17 
 
 
1187 aa  485  1e-135  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  29.59 
 
 
1191 aa  482  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  52.48 
 
 
1263 aa  481  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  31.58 
 
 
1186 aa  477  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  32.91 
 
 
1176 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  30.39 
 
 
1189 aa  464  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  29.08 
 
 
1188 aa  461  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  32.9 
 
 
1176 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  29.08 
 
 
1188 aa  461  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  32.5 
 
 
1176 aa  459  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  30.31 
 
 
1186 aa  459  1e-127  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  30.54 
 
 
1189 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  30.54 
 
 
1189 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  31.46 
 
 
1175 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  30.24 
 
 
1189 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  32.06 
 
 
1173 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  30.24 
 
 
1189 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  29.92 
 
 
1189 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  33.76 
 
 
1199 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  33.47 
 
 
1199 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  33.47 
 
 
1199 aa  442  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  30.06 
 
 
1176 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  31.28 
 
 
1204 aa  434  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  30.34 
 
 
1174 aa  431  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  29.07 
 
 
1177 aa  430  1e-119  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  28.53 
 
 
1177 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  28.71 
 
 
1179 aa  403  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  26.28 
 
 
1178 aa  384  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  29.61 
 
 
1168 aa  363  8e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  31.18 
 
 
1182 aa  362  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  30.26 
 
 
1174 aa  358  3.9999999999999996e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  27.01 
 
 
1191 aa  357  5.999999999999999e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  29.63 
 
 
1168 aa  357  7.999999999999999e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  27.15 
 
 
1170 aa  352  2e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  30.67 
 
 
1175 aa  347  1e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  30.88 
 
 
1181 aa  341  4e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  30.43 
 
 
1198 aa  341  5.9999999999999996e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  30.66 
 
 
1268 aa  340  8e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  30 
 
 
1171 aa  340  9e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  30.75 
 
 
1198 aa  340  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  30.31 
 
 
1172 aa  340  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  30.67 
 
 
1170 aa  338  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  30.67 
 
 
1170 aa  338  5e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  29.19 
 
 
1171 aa  337  7e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  30.67 
 
 
1170 aa  337  9e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  30.82 
 
 
1170 aa  337  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  30.66 
 
 
1200 aa  336  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  30.64 
 
 
1202 aa  336  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  30.59 
 
 
1170 aa  335  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  25.72 
 
 
1164 aa  333  9e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  30.42 
 
 
1175 aa  333  2e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  29.69 
 
 
1170 aa  329  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  29.61 
 
 
1170 aa  327  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  29.61 
 
 
1170 aa  326  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  31.25 
 
 
1190 aa  315  3.9999999999999997e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1194  chromosome segregation protein SMC  31.11 
 
 
1154 aa  315  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  37.82 
 
 
1185 aa  314  6.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  35.98 
 
 
1187 aa  310  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  28.4 
 
 
1190 aa  308  4.0000000000000004e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  30.04 
 
 
1196 aa  307  9.000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  35.06 
 
 
1198 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  39.05 
 
 
1179 aa  302  2e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  22.2 
 
 
1174 aa  301  3e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>