More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1953 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  100 
 
 
1195 aa  2342    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  84.2 
 
 
1194 aa  1795    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  66.22 
 
 
1217 aa  1384    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  51.66 
 
 
1195 aa  969    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  51.96 
 
 
1191 aa  946    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  49.68 
 
 
1227 aa  909    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  56.8 
 
 
1214 aa  1082    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  54.49 
 
 
1183 aa  989    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  60.18 
 
 
1194 aa  1254    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  65.58 
 
 
1194 aa  1379    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  51.59 
 
 
1181 aa  910    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  56.01 
 
 
1198 aa  1095    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  52.16 
 
 
1224 aa  1055    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  56.09 
 
 
1198 aa  1089    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  38.17 
 
 
1225 aa  692    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  50.16 
 
 
1222 aa  913    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  56.24 
 
 
1188 aa  934    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  51.45 
 
 
1203 aa  937    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  99.41 
 
 
1195 aa  2327    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  50.87 
 
 
1191 aa  943    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  59.52 
 
 
1199 aa  1207    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  100 
 
 
1195 aa  2342    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  40.79 
 
 
1172 aa  669    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  49.51 
 
 
1217 aa  907    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  49.3 
 
 
1213 aa  886    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  84.13 
 
 
1194 aa  1781    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  52.33 
 
 
1186 aa  949    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  50.29 
 
 
1222 aa  947    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  75.56 
 
 
1205 aa  1613    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  53.12 
 
 
1188 aa  955    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  54.11 
 
 
1191 aa  1073    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  52.55 
 
 
1188 aa  1050    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  30.27 
 
 
1190 aa  523  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  31.48 
 
 
1187 aa  511  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  32.45 
 
 
1176 aa  478  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  32.56 
 
 
1176 aa  474  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  29.22 
 
 
1185 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  32.58 
 
 
1176 aa  469  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  28.1 
 
 
1185 aa  468  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  28.2 
 
 
1196 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  30.57 
 
 
1176 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  32.28 
 
 
1177 aa  449  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  29.74 
 
 
1174 aa  448  1.0000000000000001e-124  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  31.9 
 
 
1173 aa  440  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  25.44 
 
 
1191 aa  436  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  28.55 
 
 
1188 aa  436  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  28.55 
 
 
1188 aa  436  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  69.03 
 
 
1234 aa  431  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  64.24 
 
 
1218 aa  427  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  27.88 
 
 
1148 aa  422  1e-116  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  31.55 
 
 
1187 aa  419  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  32.66 
 
 
1175 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  27.91 
 
 
1186 aa  403  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  26.08 
 
 
1185 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  28.64 
 
 
1184 aa  405  1e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  26.42 
 
 
1177 aa  391  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  31.49 
 
 
1168 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  29.41 
 
 
1169 aa  371  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  29.17 
 
 
1169 aa  372  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  29.33 
 
 
1168 aa  365  3e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  30.94 
 
 
1167 aa  365  4e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  62.21 
 
 
1263 aa  361  5e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  25.98 
 
 
1170 aa  358  5e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  26.7 
 
 
1181 aa  356  2e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  25.62 
 
 
1170 aa  354  5e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  24.66 
 
 
1180 aa  353  1e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  29.79 
 
 
1171 aa  348  4e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  29.68 
 
 
1167 aa  344  7e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  28.29 
 
 
1142 aa  343  1e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  24.45 
 
 
1164 aa  328  5e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  31.45 
 
 
1187 aa  319  2e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  23.66 
 
 
1153 aa  313  9e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  30.03 
 
 
1403 aa  308  3e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  31.29 
 
 
1186 aa  308  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  37.3 
 
 
1184 aa  306  2.0000000000000002e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  29.4 
 
 
1150 aa  302  3e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  31.15 
 
 
1198 aa  297  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  29.2 
 
 
1134 aa  295  3e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  34.36 
 
 
1187 aa  295  3e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  38.31 
 
 
1179 aa  295  5e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  21.48 
 
 
1174 aa  294  9e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  32.06 
 
 
1189 aa  290  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  38.34 
 
 
1174 aa  289  2e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  32.06 
 
 
1189 aa  287  7e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  30.43 
 
 
1179 aa  283  1e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  34.17 
 
 
1301 aa  279  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  31.02 
 
 
1189 aa  279  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  27.36 
 
 
1171 aa  278  5e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  28.2 
 
 
1308 aa  275  5.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  27.43 
 
 
1189 aa  274  7e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  33 
 
 
1185 aa  273  1e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  28 
 
 
1179 aa  273  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  28.61 
 
 
1177 aa  263  2e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  52.91 
 
 
1185 aa  257  7e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  27.13 
 
 
1178 aa  256  2.0000000000000002e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  41.96 
 
 
1190 aa  255  3e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  52.47 
 
 
1185 aa  255  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  26.53 
 
 
1175 aa  253  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  28.22 
 
 
1186 aa  249  2e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  25.53 
 
 
1219 aa  248  6.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>