More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0219 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  41.42 
 
 
1199 aa  713    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  40.13 
 
 
1224 aa  731    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  39.17 
 
 
1194 aa  691    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  40.29 
 
 
1217 aa  706    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  39.62 
 
 
1194 aa  660    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  40.73 
 
 
1194 aa  713    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  100 
 
 
1225 aa  2453    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  41.62 
 
 
1191 aa  702    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  41.67 
 
 
1214 aa  686    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  40.46 
 
 
1188 aa  718    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  39.02 
 
 
1222 aa  629  1e-179  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  38.26 
 
 
1172 aa  624  1e-177  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  42.3 
 
 
1222 aa  434  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  42.43 
 
 
1195 aa  431  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  27.83 
 
 
1185 aa  424  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  27.47 
 
 
1196 aa  422  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  46.05 
 
 
1191 aa  419  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  42.67 
 
 
1198 aa  414  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  41.68 
 
 
1198 aa  412  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  58.45 
 
 
1227 aa  404  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  44.43 
 
 
1183 aa  406  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  41.53 
 
 
1203 aa  404  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  60.83 
 
 
1186 aa  400  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  30.38 
 
 
1176 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  45.62 
 
 
1213 aa  390  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  26.66 
 
 
1188 aa  390  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  26.66 
 
 
1188 aa  390  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  61.82 
 
 
1234 aa  389  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  58.6 
 
 
1218 aa  390  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  39.26 
 
 
1194 aa  385  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  62.54 
 
 
1188 aa  387  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  36.56 
 
 
1195 aa  382  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  36.68 
 
 
1195 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  42.17 
 
 
1181 aa  381  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  41.81 
 
 
1205 aa  380  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  36.68 
 
 
1195 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  29.25 
 
 
1199 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  57.36 
 
 
1188 aa  374  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  29.43 
 
 
1199 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  29.58 
 
 
1199 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  41.78 
 
 
1217 aa  372  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  27.56 
 
 
1184 aa  372  1e-101  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  25.76 
 
 
1179 aa  324  5e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  26.7 
 
 
1186 aa  313  1e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  25.61 
 
 
1181 aa  313  2e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  28.25 
 
 
1172 aa  307  8.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  25.78 
 
 
1164 aa  303  2e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  28.67 
 
 
1198 aa  303  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  28.07 
 
 
1268 aa  300  8e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  28.88 
 
 
1170 aa  298  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  28.17 
 
 
1170 aa  298  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  28.17 
 
 
1170 aa  298  5e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  28.37 
 
 
1170 aa  297  7e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  28.29 
 
 
1170 aa  295  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  28.41 
 
 
1200 aa  295  4e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  28.41 
 
 
1202 aa  295  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  48.31 
 
 
1191 aa  293  1e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  28.9 
 
 
1190 aa  276  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  35.06 
 
 
1179 aa  276  3e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  28.66 
 
 
1190 aa  275  3e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  64.81 
 
 
1263 aa  274  7e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  30.27 
 
 
1185 aa  267  8e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1367  chromosome segregation protein SMC  55.87 
 
 
1186 aa  263  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.803555 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  34.76 
 
 
1187 aa  262  3e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  55.24 
 
 
1184 aa  260  1e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  27.78 
 
 
1403 aa  259  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  42.59 
 
 
1190 aa  256  3e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  48.44 
 
 
1179 aa  251  7e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  30.34 
 
 
1191 aa  249  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  22.14 
 
 
1174 aa  248  4e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  52.58 
 
 
1187 aa  248  6.999999999999999e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  37.53 
 
 
1198 aa  247  8e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  28.74 
 
 
1186 aa  245  5e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  50.22 
 
 
1301 aa  242  2.9999999999999997e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  54.9 
 
 
1187 aa  241  5e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  51.67 
 
 
1185 aa  241  5.999999999999999e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  42.52 
 
 
1176 aa  238  4e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  36.04 
 
 
1189 aa  236  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  32.31 
 
 
1173 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  27.05 
 
 
1177 aa  236  3e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  29.13 
 
 
1177 aa  236  3e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  38.68 
 
 
1174 aa  233  2e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  27.39 
 
 
1189 aa  232  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  27.06 
 
 
1189 aa  232  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  42.52 
 
 
1189 aa  231  5e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3688  SMC domain protein  52.63 
 
 
1081 aa  231  7e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.860198 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  29.68 
 
 
1176 aa  230  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  26.95 
 
 
1189 aa  230  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  44.53 
 
 
1185 aa  229  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  42.12 
 
 
1176 aa  229  4e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  42.4 
 
 
1175 aa  226  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  29.43 
 
 
1167 aa  223  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  46.55 
 
 
1198 aa  223  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  26.84 
 
 
1175 aa  219  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  29.71 
 
 
1178 aa  218  8e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  47.42 
 
 
1186 aa  217  9.999999999999999e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  24.7 
 
 
1180 aa  216  1.9999999999999998e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  28.43 
 
 
1167 aa  216  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  51.21 
 
 
1255 aa  212  3e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0419  chromosome segregation protein SMC  36.3 
 
 
1190 aa  212  3e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>