More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1159 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  56.41 
 
 
1195 aa  1079    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  52.03 
 
 
1214 aa  926    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  50.33 
 
 
1205 aa  915    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  53.22 
 
 
1194 aa  1023    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  51.19 
 
 
1217 aa  960    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  54.14 
 
 
1183 aa  940    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  55.67 
 
 
1198 aa  1014    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  63.37 
 
 
1191 aa  1241    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  41.21 
 
 
1225 aa  742    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  53.94 
 
 
1227 aa  953    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  64.56 
 
 
1213 aa  1242    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  55.01 
 
 
1198 aa  1020    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  52.75 
 
 
1217 aa  936    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  43.37 
 
 
1172 aa  729    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  54.76 
 
 
1181 aa  941    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  60.07 
 
 
1191 aa  1079    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  51.64 
 
 
1194 aa  933    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  52.37 
 
 
1222 aa  927    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  53.94 
 
 
1191 aa  1033    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  51.68 
 
 
1195 aa  919    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  51.48 
 
 
1195 aa  917    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  55.46 
 
 
1224 aa  1092    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  53.65 
 
 
1218 aa  918    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  53.35 
 
 
1194 aa  1036    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  53.62 
 
 
1199 aa  1013    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  54.54 
 
 
1188 aa  879    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 
1203 aa  2278    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  55.53 
 
 
1222 aa  1089    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  56.89 
 
 
1188 aa  1011    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  67.28 
 
 
1186 aa  1259    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  58.79 
 
 
1188 aa  1161    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  51.48 
 
 
1195 aa  917    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  50.9 
 
 
1194 aa  936    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  30.26 
 
 
1187 aa  491  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  32.78 
 
 
1187 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  32 
 
 
1177 aa  449  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  66.51 
 
 
1234 aa  444  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  32.6 
 
 
1173 aa  444  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  27.41 
 
 
1185 aa  446  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  27.72 
 
 
1185 aa  441  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  27.52 
 
 
1190 aa  435  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  32.96 
 
 
1175 aa  432  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  30.39 
 
 
1186 aa  433  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  30.04 
 
 
1176 aa  429  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  27.7 
 
 
1188 aa  429  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  27.7 
 
 
1188 aa  429  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  48.81 
 
 
1263 aa  426  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  27.18 
 
 
1189 aa  416  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  30.16 
 
 
1198 aa  412  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  29.7 
 
 
1186 aa  409  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  32.15 
 
 
1199 aa  399  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  32.74 
 
 
1199 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  30.61 
 
 
1177 aa  387  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  27.8 
 
 
1178 aa  378  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  26.15 
 
 
1178 aa  374  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  32.97 
 
 
1187 aa  371  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  24.82 
 
 
1177 aa  364  5.0000000000000005e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  26.89 
 
 
1186 aa  357  1e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  28.86 
 
 
1168 aa  350  8e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  29.75 
 
 
1167 aa  345  4e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  29.51 
 
 
1167 aa  331  6e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  22.71 
 
 
1180 aa  329  2.0000000000000001e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  31.4 
 
 
1164 aa  323  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  28.79 
 
 
1171 aa  323  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  29.59 
 
 
1171 aa  320  9e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  30.7 
 
 
1175 aa  317  6e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  29.34 
 
 
1171 aa  315  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  28.11 
 
 
1190 aa  313  9e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  24.46 
 
 
1164 aa  310  1.0000000000000001e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  29.7 
 
 
1403 aa  309  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  28.98 
 
 
1268 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  29.37 
 
 
1198 aa  304  5.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  28.85 
 
 
1198 aa  303  9e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  27.89 
 
 
1172 aa  301  7e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  31.45 
 
 
1190 aa  300  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  29.84 
 
 
1171 aa  300  1e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  29.96 
 
 
1182 aa  295  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  35.85 
 
 
1185 aa  287  7e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  36.57 
 
 
1179 aa  287  1.0000000000000001e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  36.16 
 
 
1184 aa  281  7e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  29.44 
 
 
1196 aa  280  9e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  31.97 
 
 
1189 aa  278  4e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  28.58 
 
 
1308 aa  278  5e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  20.74 
 
 
1174 aa  276  2.0000000000000002e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  32.39 
 
 
1189 aa  275  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  28.88 
 
 
1134 aa  271  5e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  31.68 
 
 
1189 aa  268  4e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  33.85 
 
 
1301 aa  268  5e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  46.48 
 
 
1185 aa  264  8e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  32.15 
 
 
1189 aa  263  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  32.15 
 
 
1189 aa  263  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  28.72 
 
 
1184 aa  261  4e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  46.09 
 
 
1185 aa  261  5.0000000000000005e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  30.97 
 
 
1179 aa  259  3e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  45.48 
 
 
1190 aa  259  3e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  22.55 
 
 
1189 aa  259  3e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  32.05 
 
 
1189 aa  258  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  24.86 
 
 
1171 aa  259  3e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  30.15 
 
 
1148 aa  258  6e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  26.97 
 
 
1149 aa  252  3e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.750966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>