More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2550 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  56.78 
 
 		 1198 aa  1061    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  57.79 
 
 		 1195 aa  1060    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1191 aa  2260    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  53.26 
 
 		 1194 aa  1008    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  51.54 
 
 		 1194 aa  945    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  56.22 
 
 		 1183 aa  969    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  55.25 
 
 		 1199 aa  1037    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  44.34 
 
 		 1172 aa  751    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  42.1 
 
 		 1225 aa  736    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  59.3 
 
 		 1191 aa  1059    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  56.54 
 
 		 1198 aa  1053    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  53.4 
 
 		 1218 aa  932    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  53.55 
 
 		 1214 aa  971    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  54.1 
 
 		 1222 aa  963    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  62.13 
 
 		 1213 aa  1169    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  55.02 
 
 		 1191 aa  1074    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  67.68 
 
 		 1186 aa  1232    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  50.88 
 
 		 1195 aa  909    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  56.28 
 
 		 1188 aa  907    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  49.96 
 
 		 1205 aa  912    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  51.21 
 
 		 1195 aa  914    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  55.95 
 
 		 1194 aa  1059    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  55.27 
 
 		 1181 aa  928    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  54.1 
 
 		 1217 aa  970    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  63.79 
 
 		 1203 aa  1179    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  58.19 
 
 		 1222 aa  1118    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  56.71 
 
 		 1224 aa  1140    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  58.77 
 
 		 1188 aa  1014    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  52.94 
 
 		 1217 aa  1013    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  57.11 
 
 		 1188 aa  1135    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  51.21 
 
 		 1195 aa  914    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  51.54 
 
 		 1194 aa  943    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  53.81 
 
 		 1227 aa  539  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  31.33 
 
 		 1187 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  33.57 
 
 		 1179 aa  468  9.999999999999999e-131  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  32.53 
 
 		 1187 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  28.37 
 
 		 1185 aa  457  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  31.87 
 
 		 1173 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  71.47 
 
 		 1234 aa  442  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  50.64 
 
 		 1263 aa  437  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  31.79 
 
 		 1177 aa  430  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  29.01 
 
 		 1185 aa  430  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  32.38 
 
 		 1176 aa  429  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  26.81 
 
 		 1189 aa  405  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  27.24 
 
 		 1191 aa  400  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  27.3 
 
 		 1186 aa  399  1e-109  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  28.16 
 
 		 1189 aa  395  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  28.16 
 
 		 1189 aa  395  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  27.37 
 
 		 1188 aa  391  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  27.37 
 
 		 1188 aa  391  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  30.87 
 
 		 1204 aa  388  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  28.4 
 
 		 1177 aa  377  1e-103  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  27.63 
 
 		 1189 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  27.55 
 
 		 1189 aa  368  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  27.63 
 
 		 1189 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  30.21 
 
 		 1167 aa  357  5e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  25.92 
 
 		 1177 aa  350  9e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  26.73 
 
 		 1195 aa  350  1e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  31.27 
 
 		 1164 aa  320  9e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  25.52 
 
 		 1170 aa  313  7.999999999999999e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  25.86 
 
 		 1170 aa  307  9.000000000000001e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  30.93 
 
 		 1403 aa  305  4.0000000000000003e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  29.8 
 
 		 1190 aa  282  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1367  chromosome segregation protein SMC  53.94 
 
 		 1186 aa  272  2e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.803555 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  55.61 
 
 		 1190 aa  270  8.999999999999999e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  50.2 
 
 		 1174 aa  265  3e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  20.65 
 
 		 1174 aa  263  1e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  35.25 
 
 		 1185 aa  258  4e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  50.22 
 
 		 1185 aa  255  3e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  32.81 
 
 		 1176 aa  255  5.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  32.1 
 
 		 1176 aa  253  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  49.78 
 
 		 1185 aa  253  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  53.37 
 
 		 1196 aa  252  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  29.01 
 
 		 1189 aa  251  7e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  28.67 
 
 		 1189 aa  246  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  22.42 
 
 		 1189 aa  244  9e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  29.29 
 
 		 1189 aa  243  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  21.65 
 
 		 1191 aa  243  1e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  29.29 
 
 		 1189 aa  243  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  46.02 
 
 		 1176 aa  241  5.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  41.94 
 
 		 1301 aa  241  8e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  25.95 
 
 		 1171 aa  240  9e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  49.3 
 
 		 1187 aa  239  2e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  54.41 
 
 		 1187 aa  238  5.0000000000000005e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  22.56 
 
 		 1189 aa  238  7e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  49.54 
 
 		 1186 aa  237  8e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  28.65 
 
 		 1178 aa  237  1.0000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  44.96 
 
 		 1179 aa  236  2.0000000000000002e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  27.39 
 
 		 1178 aa  233  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  49.77 
 
 		 1189 aa  231  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  50.23 
 
 		 1189 aa  230  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  22.37 
 
 		 1189 aa  230  1e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  51.49 
 
 		 1184 aa  226  2e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  28.12 
 
 		 1177 aa  224  9.999999999999999e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  21.61 
 
 		 1189 aa  222  3e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  27.51 
 
 		 1176 aa  222  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  42.36 
 
 		 1255 aa  221  5e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3688  SMC domain protein  49.53 
 
 		 1081 aa  217  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860198 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  24.26 
 
 		 1175 aa  214  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  44.44 
 
 		 1162 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>