More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0851 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1179 aa  2355    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  37.94 
 
 		 1184 aa  659    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  41.21 
 
 		 1174 aa  757    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1367  chromosome segregation protein SMC  39.8 
 
 		 1186 aa  673    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.803555 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  31.48 
 
 		 1187 aa  509  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  30.55 
 
 		 1190 aa  484  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  32.58 
 
 		 1176 aa  477  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  31.67 
 
 		 1189 aa  474  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  30.71 
 
 		 1189 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  31.38 
 
 		 1189 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  30.81 
 
 		 1189 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  31.36 
 
 		 1175 aa  456  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  28.54 
 
 		 1185 aa  448  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  31.14 
 
 		 1176 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  29.19 
 
 		 1185 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  29.6 
 
 		 1187 aa  441  9.999999999999999e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  28.55 
 
 		 1185 aa  439  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  30.56 
 
 		 1186 aa  438  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  31.84 
 
 		 1173 aa  435  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  27.88 
 
 		 1191 aa  436  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  28.41 
 
 		 1196 aa  434  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  27.85 
 
 		 1178 aa  410  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  27.75 
 
 		 1177 aa  405  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  28.79 
 
 		 1184 aa  405  1e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  30.69 
 
 		 1167 aa  402  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  28.51 
 
 		 1169 aa  400  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  29.71 
 
 		 1177 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  29.67 
 
 		 1164 aa  392  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  28.29 
 
 		 1176 aa  392  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  27.49 
 
 		 1186 aa  384  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  29.89 
 
 		 1167 aa  382  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  30.66 
 
 		 1168 aa  378  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  26.81 
 
 		 1180 aa  374  1e-102  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  28.61 
 
 		 1179 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  28.76 
 
 		 1162 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  29.13 
 
 		 1162 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  26.32 
 
 		 1185 aa  372  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  29.09 
 
 		 1171 aa  369  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  30.71 
 
 		 1162 aa  368  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  30.06 
 
 		 1175 aa  365  2e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1401  condensin subunit Smc  28.49 
 
 		 1168 aa  365  2e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.934786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  30.32 
 
 		 1164 aa  359  1.9999999999999998e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  29.19 
 
 		 1198 aa  343  8e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  28.56 
 
 		 1174 aa  343  1e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  29.91 
 
 		 1181 aa  342  2e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  28.93 
 
 		 1182 aa  342  2.9999999999999998e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  29.81 
 
 		 1170 aa  341  5e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  29.14 
 
 		 1171 aa  340  9e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  26.32 
 
 		 1181 aa  339  1.9999999999999998e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  29.77 
 
 		 1171 aa  339  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  28.99 
 
 		 1175 aa  338  5e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  28.24 
 
 		 1174 aa  337  9e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  29.33 
 
 		 1204 aa  334  5e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  29.39 
 
 		 1175 aa  333  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  28.66 
 
 		 1171 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  30.01 
 
 		 1201 aa  329  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  27.13 
 
 		 1170 aa  319  2e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  27.67 
 
 		 1171 aa  318  4e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  34.59 
 
 		 1191 aa  314  6.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  59.34 
 
 		 1194 aa  305  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  28.06 
 
 		 1167 aa  305  4.0000000000000003e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  55.68 
 
 		 1183 aa  304  8.000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  60.26 
 
 		 1195 aa  303  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  60.26 
 
 		 1195 aa  303  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  60.26 
 
 		 1195 aa  303  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  60 
 
 		 1188 aa  303  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  55.94 
 
 		 1217 aa  302  2e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  58.92 
 
 		 1194 aa  301  3e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  59.4 
 
 		 1194 aa  301  4e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  38.27 
 
 		 1224 aa  296  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  28.34 
 
 		 1403 aa  295  5e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  54.48 
 
 		 1181 aa  295  5e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  56.3 
 
 		 1227 aa  293  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  53.41 
 
 		 1234 aa  293  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  26.2 
 
 		 1308 aa  293  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  59.83 
 
 		 1205 aa  292  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  57.26 
 
 		 1194 aa  292  3e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  52.24 
 
 		 1218 aa  292  3e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  56.67 
 
 		 1222 aa  291  4e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  57.26 
 
 		 1199 aa  291  5.0000000000000004e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  37.95 
 
 		 1198 aa  291  5.0000000000000004e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  56.3 
 
 		 1186 aa  289  2.9999999999999996e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  57.26 
 
 		 1188 aa  288  5e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  52.03 
 
 		 1263 aa  286  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  54.62 
 
 		 1188 aa  285  3.0000000000000004e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  55.42 
 
 		 1222 aa  283  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  55 
 
 		 1217 aa  280  9e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  28.46 
 
 		 1190 aa  280  1e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  53.91 
 
 		 1214 aa  278  4e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  54.02 
 
 		 1203 aa  276  1.0000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  40.56 
 
 		 1172 aa  273  1e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  26.94 
 
 		 1171 aa  273  2e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  56.12 
 
 		 1213 aa  272  2.9999999999999997e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  55.02 
 
 		 1195 aa  272  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  54.26 
 
 		 1185 aa  268  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  51.64 
 
 		 1187 aa  264  8e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  23.67 
 
 		 1189 aa  263  1e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3688  SMC domain protein  50.99 
 
 		 1081 aa  263  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860198 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  23.55 
 
 		 1189 aa  261  6e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  25.91 
 
 		 1134 aa  260  1e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>