More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1571 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  41.65 
 
 		 1153 aa  816    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  94.62 
 
 		 1170 aa  2103    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1170 aa  2281    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  45.05 
 
 		 1164 aa  972    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  33.28 
 
 		 1174 aa  585  1.0000000000000001e-165  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  31.56 
 
 		 1185 aa  490  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  30.29 
 
 		 1190 aa  473  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  31.81 
 
 		 1185 aa  469  9.999999999999999e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  29.99 
 
 		 1190 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  31.22 
 
 		 1196 aa  456  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  29.41 
 
 		 1191 aa  452  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  29.55 
 
 		 1187 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  28.25 
 
 		 1187 aa  444  1e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  28.26 
 
 		 1185 aa  438  1e-121  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  28.15 
 
 		 1188 aa  431  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  28.15 
 
 		 1188 aa  431  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  28.95 
 
 		 1184 aa  430  1e-119  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  29.68 
 
 		 1189 aa  428  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  27.99 
 
 		 1177 aa  424  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  29.5 
 
 		 1174 aa  424  1e-117  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  30.04 
 
 		 1177 aa  424  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  29.09 
 
 		 1186 aa  422  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  29.63 
 
 		 1189 aa  421  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  28.84 
 
 		 1198 aa  422  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  29.76 
 
 		 1189 aa  422  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  28.03 
 
 		 1186 aa  421  1e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  29.78 
 
 		 1187 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  29.68 
 
 		 1189 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  29.6 
 
 		 1189 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  29.6 
 
 		 1189 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  29.91 
 
 		 1189 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  29.68 
 
 		 1189 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  27.93 
 
 		 1189 aa  413  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  29.38 
 
 		 1189 aa  415  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  29.44 
 
 		 1189 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  29.94 
 
 		 1179 aa  413  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  29.52 
 
 		 1189 aa  412  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  28.41 
 
 		 1199 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  28.57 
 
 		 1199 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  28.17 
 
 		 1199 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  29.54 
 
 		 1175 aa  409  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  29.17 
 
 		 1204 aa  404  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  29.8 
 
 		 1190 aa  400  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  29.95 
 
 		 1187 aa  402  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  29.89 
 
 		 1180 aa  402  9.999999999999999e-111  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  28.59 
 
 		 1191 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  29.88 
 
 		 1162 aa  399  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  30.02 
 
 		 1162 aa  395  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  29.8 
 
 		 1176 aa  391  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  28.68 
 
 		 1176 aa  390  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  28.13 
 
 		 1169 aa  389  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  28.59 
 
 		 1169 aa  389  1e-106  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  29.29 
 
 		 1176 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  28.14 
 
 		 1173 aa  386  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  30.03 
 
 		 1177 aa  385  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  28.38 
 
 		 1184 aa  384  1e-105  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  29.33 
 
 		 1164 aa  380  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  27.91 
 
 		 1176 aa  380  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  28.89 
 
 		 1162 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  29.15 
 
 		 1168 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  28.48 
 
 		 1168 aa  371  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  27.62 
 
 		 1163 aa  367  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  26.99 
 
 		 1140 aa  360  6e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  27.21 
 
 		 1167 aa  359  9.999999999999999e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  27.65 
 
 		 1178 aa  358  2.9999999999999997e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  27.58 
 
 		 1181 aa  357  6.999999999999999e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  28.27 
 
 		 1164 aa  355  2.9999999999999997e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  29.55 
 
 		 1172 aa  355  2.9999999999999997e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  26.95 
 
 		 1175 aa  355  4e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  26.56 
 
 		 1255 aa  354  5e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  27.26 
 
 		 1201 aa  354  5.9999999999999994e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  28.26 
 
 		 1403 aa  353  1e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  27.33 
 
 		 1167 aa  347  6e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  26.92 
 
 		 1176 aa  347  1e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2192  chromosome segregation protein SMC  27.93 
 
 		 1234 aa  345  2e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  27.24 
 
 		 1194 aa  344  5.999999999999999e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  27.5 
 
 		 1224 aa  344  5.999999999999999e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  27.33 
 
 		 1167 aa  343  1e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  28.79 
 
 		 1178 aa  342  2.9999999999999998e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  25.38 
 
 		 1148 aa  339  9.999999999999999e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  27.06 
 
 		 1301 aa  337  1e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  26.44 
 
 		 1189 aa  335  2e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  27.81 
 
 		 1189 aa  335  3e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  27.8 
 
 		 1167 aa  332  2e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  27.46 
 
 		 1179 aa  330  8e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  27.68 
 
 		 1185 aa  330  8e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  28.28 
 
 		 1186 aa  327  9e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  26.66 
 
 		 1134 aa  325  3e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  27.77 
 
 		 1177 aa  321  3.9999999999999996e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  26.3 
 
 		 1150 aa  322  3.9999999999999996e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  26.3 
 
 		 1150 aa  321  6e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  27.38 
 
 		 1189 aa  320  9e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  26.44 
 
 		 1189 aa  313  9e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  26.94 
 
 		 1191 aa  311  4e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  26.19 
 
 		 1193 aa  304  5.000000000000001e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  26.76 
 
 		 1171 aa  298  4e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  26.2 
 
 		 1174 aa  296  1e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  26.9 
 
 		 1175 aa  292  3e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  30.53 
 
 		 1175 aa  290  1e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  28.37 
 
 		 1082 aa  280  1e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>