More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_23830 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  51.52 
 
 		 1214 aa  899    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  100 
 
 		 1213 aa  2321    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  52.46 
 
 		 1218 aa  922    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  53.56 
 
 		 1199 aa  1011    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  66.2 
 
 		 1186 aa  1258    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  52.75 
 
 		 1181 aa  923    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  49.55 
 
 		 1194 aa  914    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  51.88 
 
 		 1217 aa  947    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  51.36 
 
 		 1194 aa  1007    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  52.7 
 
 		 1183 aa  926    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  54.67 
 
 		 1198 aa  1044    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  50.33 
 
 		 1217 aa  951    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  57.94 
 
 		 1195 aa  1096    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  53.71 
 
 		 1194 aa  1022    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  54.84 
 
 		 1224 aa  1108    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  64.59 
 
 		 1203 aa  1230    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  43.13 
 
 		 1172 aa  732    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  49.76 
 
 		 1195 aa  900    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  58.6 
 
 		 1191 aa  1094    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  53.38 
 
 		 1191 aa  1046    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  53.28 
 
 		 1222 aa  985    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  54.07 
 
 		 1198 aa  1021    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  61.93 
 
 		 1191 aa  1208    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  49.8 
 
 		 1195 aa  903    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  49.18 
 
 		 1194 aa  914    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  48.69 
 
 		 1205 aa  885    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  49.76 
 
 		 1195 aa  900    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  53.65 
 
 		 1188 aa  894    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  56.91 
 
 		 1222 aa  1113    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  40.88 
 
 		 1225 aa  715    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  56.98 
 
 		 1188 aa  992    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  56.49 
 
 		 1188 aa  1115    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  53.54 
 
 		 1227 aa  539  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  59.49 
 
 		 1263 aa  517  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  33.64 
 
 		 1187 aa  488  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  31.69 
 
 		 1187 aa  487  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  28.07 
 
 		 1196 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  30.38 
 
 		 1189 aa  457  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  31.41 
 
 		 1176 aa  456  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  71.56 
 
 		 1234 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  29.62 
 
 		 1189 aa  451  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  29.52 
 
 		 1189 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  29.66 
 
 		 1189 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  28.09 
 
 		 1185 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  28.55 
 
 		 1188 aa  432  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  28.55 
 
 		 1188 aa  432  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  33.02 
 
 		 1199 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  32.74 
 
 		 1199 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  32.74 
 
 		 1199 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  29.47 
 
 		 1177 aa  374  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  31.35 
 
 		 1167 aa  370  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  30.99 
 
 		 1167 aa  346  2e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  29.46 
 
 		 1182 aa  332  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  30.45 
 
 		 1198 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  29.81 
 
 		 1198 aa  311  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  30.76 
 
 		 1190 aa  310  9e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  30.15 
 
 		 1190 aa  301  5e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  32.62 
 
 		 1198 aa  283  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  34.6 
 
 		 1176 aa  281  5e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  21.43 
 
 		 1174 aa  279  3e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  29.42 
 
 		 1186 aa  279  3e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  53.76 
 
 		 1179 aa  278  5e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  30.16 
 
 		 1189 aa  277  8e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  30.94 
 
 		 1191 aa  277  1.0000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  50 
 
 		 1184 aa  275  5.000000000000001e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1367  chromosome segregation protein SMC  55.27 
 
 		 1186 aa  273  1e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.803555 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  29.19 
 
 		 1185 aa  272  2e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  32.67 
 
 		 1179 aa  268  4e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  30.01 
 
 		 1184 aa  268  5.999999999999999e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  32.38 
 
 		 1176 aa  264  8e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  27.57 
 
 		 1189 aa  262  2e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  52.02 
 
 		 1185 aa  263  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  51.57 
 
 		 1185 aa  260  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  32.59 
 
 		 1176 aa  259  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  32.96 
 
 		 1301 aa  256  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  30.28 
 
 		 1174 aa  253  2e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  28.78 
 
 		 1191 aa  248  4e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  30.21 
 
 		 1177 aa  247  9.999999999999999e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  54.41 
 
 		 1187 aa  239  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  27.84 
 
 		 1177 aa  235  4.0000000000000004e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3688  SMC domain protein  46.01 
 
 		 1081 aa  232  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860198 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  46.72 
 
 		 1198 aa  229  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  25.62 
 
 		 1175 aa  228  4e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  47.72 
 
 		 1255 aa  225  4e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  26.12 
 
 		 1181 aa  224  7e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  26.21 
 
 		 1178 aa  223  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  44.2 
 
 		 1162 aa  222  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  33.2 
 
 		 1174 aa  222  3e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  39.38 
 
 		 1162 aa  218  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  43.84 
 
 		 1162 aa  218  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  28.99 
 
 		 1148 aa  218  4e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  43.84 
 
 		 1162 aa  218  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  27.69 
 
 		 1176 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  36.99 
 
 		 1162 aa  215  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0419  chromosome segregation protein SMC  41.94 
 
 		 1190 aa  215  4.9999999999999996e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327904  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  46.15 
 
 		 1162 aa  214  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  45.54 
 
 		 1164 aa  213  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  43.12 
 
 		 1162 aa  213  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  38.6 
 
 		 1162 aa  212  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  39.67 
 
 		 1179 aa  211  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>