More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1677 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  52.24 
 
 
1185 aa  1139    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  50.55 
 
 
1186 aa  1096    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 
1177 aa  2362    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0419  chromosome segregation protein SMC  52.93 
 
 
1190 aa  1110    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327904  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  55.49 
 
 
1178 aa  1219    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  55.61 
 
 
1179 aa  1253    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  33.25 
 
 
1178 aa  605  1.0000000000000001e-171  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  32.71 
 
 
1175 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  32.63 
 
 
1176 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  31.54 
 
 
1187 aa  488  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  31.4 
 
 
1173 aa  477  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  31.57 
 
 
1176 aa  476  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  32.12 
 
 
1177 aa  478  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  32.72 
 
 
1199 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  33.25 
 
 
1199 aa  473  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  33.17 
 
 
1199 aa  472  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  31.26 
 
 
1189 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  31.39 
 
 
1189 aa  457  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  31.54 
 
 
1189 aa  459  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  30.46 
 
 
1189 aa  450  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  31.44 
 
 
1196 aa  451  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  29.36 
 
 
1190 aa  451  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  30.52 
 
 
1189 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  30.53 
 
 
1189 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  30.43 
 
 
1189 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  30.52 
 
 
1189 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  30.53 
 
 
1189 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  29.81 
 
 
1189 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  32.5 
 
 
1176 aa  446  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  30.09 
 
 
1191 aa  437  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  28.45 
 
 
1185 aa  436  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  30.67 
 
 
1189 aa  436  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  28.95 
 
 
1148 aa  423  1e-116  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  28.54 
 
 
1188 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  28.54 
 
 
1188 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  37.31 
 
 
1185 aa  411  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  29.55 
 
 
1177 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  29.3 
 
 
1187 aa  404  1e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  28.1 
 
 
1186 aa  394  1e-108  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  29.41 
 
 
1162 aa  383  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  28.48 
 
 
1177 aa  378  1e-103  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  29.09 
 
 
1162 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  30.44 
 
 
1162 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  31.21 
 
 
1403 aa  372  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  29.69 
 
 
1184 aa  367  1e-100  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  29.11 
 
 
1175 aa  357  5.999999999999999e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  27.54 
 
 
1191 aa  357  6.999999999999999e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  26.75 
 
 
1169 aa  353  8.999999999999999e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  28.28 
 
 
1168 aa  353  1e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  28.91 
 
 
1171 aa  353  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  27.88 
 
 
1164 aa  352  3e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  28.72 
 
 
1175 aa  351  6e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  28.03 
 
 
1164 aa  349  2e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  29.45 
 
 
1174 aa  348  5e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  28.93 
 
 
1175 aa  345  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  29.11 
 
 
1171 aa  339  1.9999999999999998e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  29.31 
 
 
1174 aa  334  6e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  27.91 
 
 
1171 aa  332  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  31.16 
 
 
1176 aa  328  3e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  26.68 
 
 
1181 aa  324  5e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  27.83 
 
 
1170 aa  322  3e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0318  condensin subunit Smc  26.48 
 
 
1307 aa  314  6.999999999999999e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  30.67 
 
 
1186 aa  303  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  27.9 
 
 
1308 aa  300  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  32.94 
 
 
1187 aa  293  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  25.32 
 
 
1164 aa  290  2e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  31.13 
 
 
1198 aa  280  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  24.46 
 
 
1174 aa  275  3e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  27.93 
 
 
1134 aa  274  7e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  30.11 
 
 
1185 aa  273  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  25.68 
 
 
1153 aa  273  2e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  25.38 
 
 
1174 aa  261  7e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  29.63 
 
 
1204 aa  259  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  30.34 
 
 
1205 aa  259  3e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  29.59 
 
 
1174 aa  257  7e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  29.17 
 
 
1194 aa  255  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  26.29 
 
 
1175 aa  254  7e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  31.57 
 
 
1191 aa  251  6e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  30.6 
 
 
1301 aa  249  3e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  26.8 
 
 
1189 aa  248  4e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  28.31 
 
 
1255 aa  247  8e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  45.15 
 
 
1190 aa  246  9.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  32.08 
 
 
1176 aa  245  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  28.59 
 
 
1194 aa  242  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  29.58 
 
 
1187 aa  239  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  27.05 
 
 
1180 aa  238  4e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  24.64 
 
 
1189 aa  238  4e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  23.7 
 
 
1189 aa  238  6e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  23.99 
 
 
1172 aa  238  6e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  27.57 
 
 
1179 aa  238  7e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  24.64 
 
 
1171 aa  237  1.0000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  24.23 
 
 
1189 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1496  chromosome partition protein SmC, putative  36.83 
 
 
980 aa  234  9e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  24.22 
 
 
1190 aa  230  9e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  30.04 
 
 
1194 aa  230  9e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  47.81 
 
 
1176 aa  229  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  43.53 
 
 
1184 aa  228  4e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  23.7 
 
 
1189 aa  226  2e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  46.19 
 
 
1185 aa  226  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  45.74 
 
 
1185 aa  224  6e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>