More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0863 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  33.96 
 
 		 1189 aa  653    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  35.56 
 
 		 1189 aa  655    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  46.07 
 
 		 1179 aa  972    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  35.58 
 
 		 1189 aa  655    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  35.58 
 
 		 1189 aa  654    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  35.5 
 
 		 1189 aa  653    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  34.57 
 
 		 1189 aa  645    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  35.58 
 
 		 1189 aa  655    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  35.1 
 
 		 1187 aa  687    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  36.24 
 
 		 1187 aa  654    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  34.36 
 
 		 1188 aa  654    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  35.53 
 
 		 1189 aa  649    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  35.91 
 
 		 1189 aa  665    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  35.61 
 
 		 1189 aa  657    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  34.36 
 
 		 1188 aa  654    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  100 
 
 		 1174 aa  2364    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  35.95 
 
 		 1185 aa  650    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  46.57 
 
 		 1177 aa  982    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  35.81 
 
 		 1189 aa  655    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  35.56 
 
 		 1189 aa  655    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  34.66 
 
 		 1190 aa  624  1e-177  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  36.08 
 
 		 1184 aa  608  9.999999999999999e-173  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  35.53 
 
 		 1186 aa  607  9.999999999999999e-173  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  34.52 
 
 		 1187 aa  598  1e-169  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  33.41 
 
 		 1185 aa  590  1e-167  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  32.46 
 
 		 1185 aa  570  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  33.52 
 
 		 1186 aa  556  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  32.83 
 
 		 1191 aa  555  1e-156  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  32.56 
 
 		 1187 aa  515  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  31.79 
 
 		 1177 aa  511  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  32.32 
 
 		 1199 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  32.23 
 
 		 1199 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  32.23 
 
 		 1199 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  30.35 
 
 		 1191 aa  470  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  31.62 
 
 		 1175 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  32.31 
 
 		 1176 aa  458  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  30.52 
 
 		 1176 aa  444  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  30.74 
 
 		 1173 aa  436  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  29.33 
 
 		 1172 aa  429  1e-118  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  29.59 
 
 		 1148 aa  424  1e-117  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  29.61 
 
 		 1170 aa  419  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  28.26 
 
 		 1204 aa  414  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  29.64 
 
 		 1185 aa  411  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  29.56 
 
 		 1170 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  29.38 
 
 		 1186 aa  409  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  29.32 
 
 		 1181 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  28.95 
 
 		 1178 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  29.87 
 
 		 1178 aa  404  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  29.27 
 
 		 1164 aa  406  1e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  28.51 
 
 		 1180 aa  399  1e-109  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  35.54 
 
 		 1196 aa  372  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  28.88 
 
 		 1167 aa  369  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  35.03 
 
 		 1198 aa  366  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  28.44 
 
 		 1403 aa  352  3e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  26.12 
 
 		 1184 aa  347  6e-94  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  31.26 
 
 		 1185 aa  342  2e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  31.37 
 
 		 1185 aa  342  2e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  26.73 
 
 		 1171 aa  334  5e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  26.28 
 
 		 1174 aa  333  1e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  26.66 
 
 		 1153 aa  332  2e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  26.34 
 
 		 1172 aa  322  3e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2440  chromosome segregation SMC protein  28.73 
 
 		 1109 aa  317  6e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129774  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  26.79 
 
 		 1189 aa  313  1e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  25.85 
 
 		 1175 aa  312  2.9999999999999997e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  27.07 
 
 		 1189 aa  310  8e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  27.25 
 
 		 1193 aa  308  5.0000000000000004e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  25.55 
 
 		 1191 aa  307  8.000000000000001e-82  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  24.52 
 
 		 1174 aa  306  1.0000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  27.73 
 
 		 1192 aa  302  3e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  26.6 
 
 		 1189 aa  300  1e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  32.17 
 
 		 1175 aa  292  3e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  55.1 
 
 		 1190 aa  284  9e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  26.49 
 
 		 1208 aa  283  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  31.59 
 
 		 1177 aa  282  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  25.63 
 
 		 1189 aa  281  4e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  24.96 
 
 		 1146 aa  281  5e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  25.43 
 
 		 1226 aa  281  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  27.81 
 
 		 1147 aa  278  5e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  25.58 
 
 		 1217 aa  276  1.0000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  32.9 
 
 		 1301 aa  275  4.0000000000000004e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  32.23 
 
 		 1176 aa  275  5.000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  30.24 
 
 		 1185 aa  274  6e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  25 
 
 		 1219 aa  271  5e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  25.43 
 
 		 1082 aa  271  5.9999999999999995e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  25.06 
 
 		 1146 aa  266  2e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  31.97 
 
 		 1194 aa  263  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  24.92 
 
 		 1149 aa  262  3e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  25.22 
 
 		 1146 aa  261  4e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  29.59 
 
 		 1177 aa  257  7e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  50.41 
 
 		 1195 aa  253  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  50.41 
 
 		 1195 aa  253  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  50.41 
 
 		 1195 aa  253  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  51.45 
 
 		 1217 aa  252  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  31.3 
 
 		 1176 aa  252  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  50.41 
 
 		 1194 aa  251  5e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  47.42 
 
 		 1188 aa  251  5e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  31.88 
 
 		 1224 aa  250  9e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  49.8 
 
 		 1194 aa  250  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  50.2 
 
 		 1199 aa  249  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  47.83 
 
 		 1198 aa  249  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>