More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1271 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  37.56 
 
 
1189 aa  697    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  36.42 
 
 
1189 aa  711    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  60.95 
 
 
1179 aa  1370    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  36.64 
 
 
1189 aa  716    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  36.51 
 
 
1189 aa  714    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  36.51 
 
 
1189 aa  712    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  36.42 
 
 
1189 aa  714    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  36.51 
 
 
1189 aa  714    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  36.75 
 
 
1187 aa  670    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  37.02 
 
 
1189 aa  717    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  36.15 
 
 
1189 aa  719    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  36.51 
 
 
1189 aa  714    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  37.33 
 
 
1187 aa  695    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  36.58 
 
 
1188 aa  702    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  37.34 
 
 
1187 aa  737    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  36.58 
 
 
1188 aa  702    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  36.42 
 
 
1189 aa  711    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  46.72 
 
 
1174 aa  1009    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  100 
 
 
1177 aa  2367    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  36.1 
 
 
1189 aa  717    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  34.98 
 
 
1196 aa  628  1e-178  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  35.95 
 
 
1185 aa  626  1e-178  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  34.78 
 
 
1186 aa  622  1e-176  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  32.97 
 
 
1190 aa  610  1e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  34.46 
 
 
1184 aa  595  1e-168  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  34.27 
 
 
1198 aa  592  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  32.64 
 
 
1185 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  31.59 
 
 
1191 aa  582  1e-164  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  33.63 
 
 
1186 aa  559  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  30.79 
 
 
1177 aa  501  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  30.88 
 
 
1176 aa  462  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  30.81 
 
 
1187 aa  460  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  29.5 
 
 
1148 aa  444  1e-123  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  31.08 
 
 
1173 aa  437  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  29.89 
 
 
1181 aa  439  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  30.98 
 
 
1176 aa  434  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  29.55 
 
 
1176 aa  436  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  31.02 
 
 
1176 aa  436  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  30.68 
 
 
1176 aa  431  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  29.16 
 
 
1175 aa  427  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  29.33 
 
 
1204 aa  428  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  30.03 
 
 
1170 aa  428  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  29.02 
 
 
1170 aa  421  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  28.52 
 
 
1169 aa  422  1e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  28.61 
 
 
1169 aa  420  1e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  28.21 
 
 
1178 aa  417  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  29.71 
 
 
1179 aa  416  1e-114  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  28.43 
 
 
1180 aa  410  1e-113  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  28.5 
 
 
1185 aa  412  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  29.61 
 
 
1178 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  29.43 
 
 
1168 aa  401  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  28.67 
 
 
1164 aa  400  9.999999999999999e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  28.75 
 
 
1186 aa  402  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  28.48 
 
 
1177 aa  397  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  28.78 
 
 
1167 aa  395  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  28.71 
 
 
1167 aa  393  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  28.89 
 
 
1179 aa  390  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  32.99 
 
 
1190 aa  377  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  28.61 
 
 
1176 aa  379  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  32.48 
 
 
1185 aa  366  2e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  32.57 
 
 
1185 aa  362  2e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  25.77 
 
 
1184 aa  352  3e-95  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  24.78 
 
 
1174 aa  349  2e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  26.9 
 
 
1153 aa  342  2.9999999999999998e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  25.82 
 
 
1189 aa  327  7e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  26.13 
 
 
1193 aa  327  8.000000000000001e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  27.84 
 
 
1403 aa  324  7e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  26.66 
 
 
1308 aa  323  9.999999999999999e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  25.76 
 
 
1189 aa  320  7e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  25.82 
 
 
1172 aa  320  9e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  25.44 
 
 
1174 aa  316  1.9999999999999998e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  30.38 
 
 
1175 aa  313  2e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  25.04 
 
 
1171 aa  296  2e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  29.66 
 
 
1191 aa  295  4e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  25.49 
 
 
1146 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  25.12 
 
 
1175 aa  282  3e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  30.3 
 
 
1172 aa  280  1e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  25.37 
 
 
1217 aa  280  2e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  25.41 
 
 
1226 aa  277  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  32.61 
 
 
1301 aa  275  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  25.18 
 
 
1226 aa  273  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  29.13 
 
 
1255 aa  273  2e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  28.32 
 
 
1199 aa  272  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  28.1 
 
 
1199 aa  271  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  46.13 
 
 
1190 aa  271  7e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  28.19 
 
 
1199 aa  271  8e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  26.19 
 
 
1198 aa  270  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  25 
 
 
1146 aa  270  2e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  29.53 
 
 
1191 aa  269  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  26.04 
 
 
1146 aa  269  2.9999999999999995e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  54.59 
 
 
1185 aa  263  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  26.12 
 
 
1147 aa  261  7e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  29.51 
 
 
1177 aa  258  4e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  24.92 
 
 
1219 aa  258  4e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  29.45 
 
 
1224 aa  257  8e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  30.26 
 
 
1184 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  30.35 
 
 
1201 aa  253  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  46.85 
 
 
1183 aa  250  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  24.57 
 
 
1149 aa  249  2e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  48.21 
 
 
1181 aa  248  4e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>