More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_10080 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  46.55 
 
 		 1184 aa  873    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  41.21 
 
 		 1179 aa  762    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1174 aa  2327    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1367  chromosome segregation protein SMC  49.08 
 
 		 1186 aa  887    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.803555 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  30.94 
 
 		 1190 aa  503  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  30.89 
 
 		 1187 aa  497  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  31.96 
 
 		 1187 aa  477  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  33.76 
 
 		 1191 aa  464  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  29.12 
 
 		 1190 aa  464  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  28.76 
 
 		 1189 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  27.77 
 
 		 1196 aa  456  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  29 
 
 		 1189 aa  438  1e-121  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  29.19 
 
 		 1189 aa  436  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  29.11 
 
 		 1189 aa  436  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  29.19 
 
 		 1189 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  29.11 
 
 		 1189 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  29.23 
 
 		 1189 aa  439  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  28.62 
 
 		 1189 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  29.05 
 
 		 1189 aa  435  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  29.3 
 
 		 1189 aa  435  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  28.62 
 
 		 1189 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  29.16 
 
 		 1189 aa  436  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  28.79 
 
 		 1188 aa  436  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  28.79 
 
 		 1188 aa  436  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  28.4 
 
 		 1186 aa  432  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  30.29 
 
 		 1173 aa  427  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  28.45 
 
 		 1185 aa  428  1e-118  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  29.99 
 
 		 1198 aa  426  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  29.5 
 
 		 1175 aa  416  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  27.44 
 
 		 1191 aa  414  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  27.7 
 
 		 1185 aa  412  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  27.21 
 
 		 1177 aa  412  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  28.81 
 
 		 1204 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  29.17 
 
 		 1187 aa  409  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  30.72 
 
 		 1199 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  29.44 
 
 		 1174 aa  405  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  30.72 
 
 		 1199 aa  403  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  30.68 
 
 		 1199 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  29.9 
 
 		 1176 aa  396  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  27.82 
 
 		 1169 aa  383  1e-105  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  27.74 
 
 		 1169 aa  385  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  29.35 
 
 		 1162 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  28.26 
 
 		 1178 aa  375  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  25.47 
 
 		 1178 aa  376  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  27.63 
 
 		 1179 aa  367  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  30.78 
 
 		 1162 aa  370  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  25.51 
 
 		 1185 aa  363  1e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  27.38 
 
 		 1186 aa  360  7e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  28.54 
 
 		 1164 aa  360  9e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  28.19 
 
 		 1177 aa  358  1.9999999999999998e-97  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  28.35 
 
 		 1164 aa  357  5e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  28.69 
 
 		 1164 aa  345  4e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  29.42 
 
 		 1175 aa  343  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  28.69 
 
 		 1171 aa  334  6e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  27.79 
 
 		 1167 aa  334  7.000000000000001e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  25.04 
 
 		 1180 aa  332  3e-89  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  27.63 
 
 		 1167 aa  331  6e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  29.25 
 
 		 1175 aa  328  4.0000000000000003e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  28.41 
 
 		 1167 aa  327  7e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  27.04 
 
 		 1164 aa  326  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  25.66 
 
 		 1164 aa  325  2e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  29.86 
 
 		 1165 aa  325  3e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  28.08 
 
 		 1171 aa  324  7e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  27.58 
 
 		 1170 aa  323  1.9999999999999998e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  28.63 
 
 		 1167 aa  322  3e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  27.88 
 
 		 1171 aa  322  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  27.14 
 
 		 1170 aa  321  5e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  28.49 
 
 		 1198 aa  318  5e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  49.52 
 
 		 1188 aa  297  7e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  33.79 
 
 		 1194 aa  297  7e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  29.73 
 
 		 1403 aa  294  8e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  48.79 
 
 		 1194 aa  293  1e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  47.15 
 
 		 1198 aa  288  5e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  46.91 
 
 		 1217 aa  287  8e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  27.56 
 
 		 1308 aa  287  9e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  44.18 
 
 		 1194 aa  283  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  40.87 
 
 		 1224 aa  283  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  31.81 
 
 		 1185 aa  283  1e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  51.49 
 
 		 1183 aa  283  2e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  45.96 
 
 		 1198 aa  282  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  47.63 
 
 		 1195 aa  282  3e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  47.63 
 
 		 1195 aa  282  3e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  47.63 
 
 		 1195 aa  282  3e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  56.41 
 
 		 1188 aa  280  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  46.58 
 
 		 1214 aa  279  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  54.03 
 
 		 1222 aa  279  3e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  52.45 
 
 		 1218 aa  278  5e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  48.14 
 
 		 1205 aa  277  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  54.7 
 
 		 1234 aa  276  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  22.7 
 
 		 1174 aa  275  5.000000000000001e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  54.7 
 
 		 1181 aa  275  5.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  30.07 
 
 		 1185 aa  273  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  54.7 
 
 		 1263 aa  273  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  53.36 
 
 		 1217 aa  272  2e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  50.19 
 
 		 1188 aa  271  5.9999999999999995e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  52.94 
 
 		 1186 aa  269  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  51.25 
 
 		 1222 aa  267  8.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  54.02 
 
 		 1185 aa  266  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  50.2 
 
 		 1191 aa  265  4.999999999999999e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  58.33 
 
 		 1172 aa  264  8e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>