More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1390 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1191 aa  2278    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  51.7 
 
 		 1217 aa  973    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  54.3 
 
 		 1227 aa  994    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  55.54 
 
 		 1198 aa  1063    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  52.34 
 
 		 1194 aa  1014    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  53.29 
 
 		 1214 aa  953    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  55.98 
 
 		 1194 aa  1081    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  58.9 
 
 		 1195 aa  1103    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  59.02 
 
 		 1213 aa  1117    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  57.49 
 
 		 1183 aa  1011    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  62.28 
 
 		 1186 aa  1137    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  55.99 
 
 		 1181 aa  961    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  39.81 
 
 		 1225 aa  701    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  54.74 
 
 		 1199 aa  1044    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  55.02 
 
 		 1191 aa  1094    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  51.62 
 
 		 1194 aa  956    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  53.19 
 
 		 1217 aa  918    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  53.57 
 
 		 1222 aa  974    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  59.17 
 
 		 1191 aa  1112    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  57.56 
 
 		 1224 aa  1160    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  50.21 
 
 		 1205 aa  914    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  55.87 
 
 		 1198 aa  1060    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  41.52 
 
 		 1172 aa  688    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  56.77 
 
 		 1188 aa  940    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  51.83 
 
 		 1194 aa  952    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  51.57 
 
 		 1195 aa  965    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  56.18 
 
 		 1218 aa  966    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  56.78 
 
 		 1222 aa  1110    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  56.31 
 
 		 1188 aa  992    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  60.33 
 
 		 1203 aa  1103    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  51.4 
 
 		 1195 aa  961    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  61.04 
 
 		 1188 aa  1253    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  51.57 
 
 		 1195 aa  965    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  60 
 
 		 1263 aa  518  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  31.39 
 
 		 1187 aa  490  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  29.15 
 
 		 1190 aa  486  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  73.64 
 
 		 1234 aa  475  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  28.7 
 
 		 1185 aa  476  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  33.57 
 
 		 1187 aa  475  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  28.11 
 
 		 1185 aa  462  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  33.07 
 
 		 1176 aa  462  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  28.79 
 
 		 1188 aa  447  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  28.79 
 
 		 1188 aa  447  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  30.22 
 
 		 1176 aa  439  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  29.83 
 
 		 1187 aa  435  1e-120  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  29.12 
 
 		 1186 aa  415  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  26.43 
 
 		 1178 aa  400  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  27.57 
 
 		 1186 aa  354  7e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  30.6 
 
 		 1168 aa  345  2e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  29.26 
 
 		 1167 aa  345  2.9999999999999997e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  32.13 
 
 		 1175 aa  341  5e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  24.61 
 
 		 1164 aa  334  5e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  29.81 
 
 		 1167 aa  331  4e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  26.1 
 
 		 1170 aa  329  2.0000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  30.72 
 
 		 1190 aa  320  2e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  30.54 
 
 		 1175 aa  318  3e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  30.06 
 
 		 1162 aa  313  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  31.49 
 
 		 1164 aa  311  5e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  30.09 
 
 		 1191 aa  307  7e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  27.71 
 
 		 1190 aa  298  5e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  27.48 
 
 		 1189 aa  289  2e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  30.49 
 
 		 1196 aa  286  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  31.52 
 
 		 1189 aa  283  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  31.81 
 
 		 1174 aa  283  2e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  31.75 
 
 		 1189 aa  281  6e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  32.39 
 
 		 1189 aa  280  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  34.27 
 
 		 1177 aa  280  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  34.62 
 
 		 1176 aa  279  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  35.3 
 
 		 1176 aa  279  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  31.85 
 
 		 1189 aa  278  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  21.06 
 
 		 1174 aa  278  5e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  36.05 
 
 		 1185 aa  276  2.0000000000000002e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  29.61 
 
 		 1179 aa  275  3e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  29.47 
 
 		 1184 aa  270  1e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  29.2 
 
 		 1177 aa  266  1e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  25.67 
 
 		 1177 aa  252  3e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  50.88 
 
 		 1185 aa  247  8e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  24.9 
 
 		 1175 aa  247  9e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  51.89 
 
 		 1185 aa  244  5e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  22.42 
 
 		 1189 aa  244  6e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  50.44 
 
 		 1185 aa  244  7e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  25.96 
 
 		 1175 aa  243  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  52.78 
 
 		 1189 aa  242  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  52.31 
 
 		 1189 aa  241  4e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  52.31 
 
 		 1189 aa  241  4e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  29.02 
 
 		 1177 aa  241  4e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  52.31 
 
 		 1189 aa  242  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  52.78 
 
 		 1189 aa  242  4e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  52.31 
 
 		 1189 aa  241  5e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  52.31 
 
 		 1189 aa  241  5e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  45.21 
 
 		 1301 aa  240  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  30.54 
 
 		 1186 aa  238  5.0000000000000005e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  29.9 
 
 		 1181 aa  238  6e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3688  SMC domain protein  42.17 
 
 		 1081 aa  234  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860198 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  48.51 
 
 		 1184 aa  226  1e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  24.29 
 
 		 1180 aa  226  2e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  25.75 
 
 		 1219 aa  224  6e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  28.99 
 
 		 1148 aa  224  6e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  32.93 
 
 		 1255 aa  219  2e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  26.63 
 
 		 1178 aa  219  2e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>