More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1551 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  55.09 
 
 		 1217 aa  1272    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  54.55 
 
 		 1198 aa  1168    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03271  hypothetical protein  40.99 
 
 		 1184 aa  735    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  36.72 
 
 		 1194 aa  716    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  39.14 
 
 		 1183 aa  741    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  57.63 
 
 		 1208 aa  1308    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  40.93 
 
 		 1204 aa  787    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  38.89 
 
 		 1201 aa  759    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2255  condensin subunit Smc  40.85 
 
 		 1202 aa  750    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.204212 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  36.8 
 
 		 1196 aa  712    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  39.95 
 
 		 1207 aa  775    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  36.97 
 
 		 1196 aa  704    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  53.59 
 
 		 1190 aa  1186    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  51.42 
 
 		 1226 aa  1151    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  100 
 
 		 1219 aa  2472    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  51.74 
 
 		 1226 aa  1159    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  36.49 
 
 		 1196 aa  703    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  32.99 
 
 		 1174 aa  549  1e-154  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  31.79 
 
 		 1175 aa  545  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  32.28 
 
 		 1193 aa  535  1e-150  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  32.94 
 
 		 1171 aa  528  1e-148  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  31.01 
 
 		 1192 aa  525  1e-147  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  31.5 
 
 		 1188 aa  524  1e-147  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  32.09 
 
 		 1189 aa  517  1.0000000000000001e-145  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  31.92 
 
 		 1146 aa  513  1e-144  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  30.93 
 
 		 1146 aa  504  1e-141  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  31.36 
 
 		 1149 aa  501  1e-140  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  30.73 
 
 		 1146 aa  493  9.999999999999999e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  29.29 
 
 		 1184 aa  451  1e-125  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2045  condensin subunit Smc  59.8 
 
 		 1195 aa  394  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  28.34 
 
 		 1172 aa  381  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  27.55 
 
 		 1189 aa  373  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  27.18 
 
 		 1189 aa  363  9e-99  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  33.25 
 
 		 1147 aa  362  3e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  26.5 
 
 		 1191 aa  360  6e-98  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  26.97 
 
 		 1189 aa  358  3.9999999999999996e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  26.83 
 
 		 1189 aa  344  7e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  25.98 
 
 		 1187 aa  331  6e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  25.19 
 
 		 1190 aa  324  5e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  24.65 
 
 		 1185 aa  313  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  26.68 
 
 		 1186 aa  308  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  25.1 
 
 		 1190 aa  307  7e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  25.47 
 
 		 1188 aa  305  4.0000000000000003e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  25.47 
 
 		 1188 aa  305  4.0000000000000003e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  25.37 
 
 		 1189 aa  296  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  26.09 
 
 		 1189 aa  294  7e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  25.43 
 
 		 1189 aa  288  5e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  25.33 
 
 		 1189 aa  287  7e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  25.41 
 
 		 1189 aa  281  6e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  25.37 
 
 		 1189 aa  281  8e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  25.49 
 
 		 1189 aa  280  9e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  25.49 
 
 		 1189 aa  280  9e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  24.62 
 
 		 1185 aa  279  2e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  25.33 
 
 		 1189 aa  278  4e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  25.51 
 
 		 1189 aa  276  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  25.22 
 
 		 1189 aa  276  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  25.22 
 
 		 1189 aa  276  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  25.04 
 
 		 1174 aa  271  5e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  24.65 
 
 		 1191 aa  265  3e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  24.55 
 
 		 1187 aa  261  5.0000000000000005e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  25.12 
 
 		 1176 aa  261  5.0000000000000005e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  30.04 
 
 		 1148 aa  260  9e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  23.8 
 
 		 1174 aa  258  7e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  25.02 
 
 		 1170 aa  253  1e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  25.34 
 
 		 1170 aa  253  1e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  25.4 
 
 		 1179 aa  252  4e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  24.08 
 
 		 1176 aa  248  4e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  23.35 
 
 		 1199 aa  248  8e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  23.97 
 
 		 1199 aa  246  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  23.86 
 
 		 1204 aa  246  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  24.86 
 
 		 1177 aa  244  6e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  23.28 
 
 		 1179 aa  243  2e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  22.67 
 
 		 1174 aa  241  8e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  23.02 
 
 		 1199 aa  240  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  24.83 
 
 		 1177 aa  239  2e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  23.24 
 
 		 1186 aa  236  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  25.58 
 
 		 1403 aa  234  6e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  23.33 
 
 		 1172 aa  234  9e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  23.43 
 
 		 1175 aa  233  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  24.65 
 
 		 1176 aa  232  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  23.89 
 
 		 1176 aa  232  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  24.21 
 
 		 1164 aa  231  6e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  24.22 
 
 		 1180 aa  231  7e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  24.52 
 
 		 1177 aa  230  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  24.69 
 
 		 1184 aa  228  5.0000000000000005e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  25.12 
 
 		 1162 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04597  nuclear condensin complex subunit Smc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02170)  24.77 
 
 		 1476 aa  224  7e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  22.05 
 
 		 1178 aa  223  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  23.35 
 
 		 1148 aa  221  5e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  23.14 
 
 		 1168 aa  221  6e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  43.02 
 
 		 1196 aa  221  7.999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  23.52 
 
 		 1173 aa  219  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  24.17 
 
 		 1175 aa  220  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  24.05 
 
 		 1185 aa  219  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  24.44 
 
 		 1162 aa  218  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  24.71 
 
 		 1186 aa  215  4.9999999999999996e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05899  Condensin subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J150]  24.6 
 
 		 1179 aa  214  9e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.566819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0855  chromosome segregation protein SMC  24.24 
 
 		 1200 aa  213  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00379552  normal  0.0307887 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  23.93 
 
 		 1191 aa  211  7e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  25.53 
 
 		 1179 aa  211  8e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>