More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2736 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  63.03 
 
 
1193 aa  1364    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  72.23 
 
 
1192 aa  1600    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  37.63 
 
 
1147 aa  668    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  42.56 
 
 
1175 aa  868    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 
1188 aa  2314    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  66.86 
 
 
1189 aa  1483    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  67.56 
 
 
1196 aa  1418    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  35.28 
 
 
1146 aa  661    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  41.82 
 
 
1174 aa  871    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  39.5 
 
 
1171 aa  726    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  36.25 
 
 
1146 aa  660    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  35.49 
 
 
1146 aa  619  1e-175  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  33.89 
 
 
1149 aa  599  1e-170  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  33.93 
 
 
1198 aa  572  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  33.2 
 
 
1190 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  32.48 
 
 
1226 aa  562  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  32.46 
 
 
1226 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  32.02 
 
 
1219 aa  556  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  31.69 
 
 
1184 aa  545  1e-153  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  32.45 
 
 
1217 aa  540  9.999999999999999e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  33.04 
 
 
1208 aa  538  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  30.79 
 
 
1196 aa  501  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  33.01 
 
 
1207 aa  500  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  31.03 
 
 
1196 aa  500  1e-140  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  32.7 
 
 
1204 aa  494  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  30.79 
 
 
1196 aa  492  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  30.03 
 
 
1194 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  31.61 
 
 
1189 aa  489  1e-136  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  30.88 
 
 
1189 aa  484  1e-135  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  31.2 
 
 
1189 aa  480  1e-134  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  30.15 
 
 
1191 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  30.56 
 
 
1201 aa  467  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  30.69 
 
 
1189 aa  457  1e-127  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2255  condensin subunit Smc  31.25 
 
 
1202 aa  452  1e-125  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.204212 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  30.19 
 
 
1183 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  29.32 
 
 
1172 aa  439  1e-121  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  27.09 
 
 
1148 aa  398  1e-109  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  26.76 
 
 
1185 aa  389  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  26.78 
 
 
1187 aa  383  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  27.32 
 
 
1191 aa  365  3e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  27.34 
 
 
1189 aa  361  4e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  26.49 
 
 
1190 aa  352  2e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03271  hypothetical protein  34.91 
 
 
1184 aa  350  6e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  26.2 
 
 
1188 aa  350  1e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  26.2 
 
 
1188 aa  350  1e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  27.9 
 
 
1174 aa  350  1e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  26.24 
 
 
1190 aa  340  9.999999999999999e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  25.63 
 
 
1185 aa  339  1.9999999999999998e-91  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04597  nuclear condensin complex subunit Smc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02170)  26.56 
 
 
1476 aa  335  2e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  25.62 
 
 
1185 aa  328  5e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  26.02 
 
 
1187 aa  326  1e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  27.53 
 
 
1187 aa  326  2e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  26.82 
 
 
1191 aa  324  5e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  26.32 
 
 
1196 aa  324  6e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  27.78 
 
 
1177 aa  324  7e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  26.49 
 
 
1184 aa  321  5e-86  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  25.72 
 
 
1186 aa  318  6e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  26.59 
 
 
1186 aa  317  7e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  26.06 
 
 
1189 aa  317  8e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  26.2 
 
 
1174 aa  317  9.999999999999999e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  26.1 
 
 
1189 aa  315  3.9999999999999997e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  25.91 
 
 
1189 aa  314  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  25.24 
 
 
1181 aa  307  7e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  25.97 
 
 
1189 aa  307  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  24.84 
 
 
1164 aa  306  1.0000000000000001e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  25.77 
 
 
1189 aa  305  4.0000000000000003e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  27.42 
 
 
1179 aa  304  8.000000000000001e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  26.83 
 
 
1170 aa  299  2e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  27.08 
 
 
1198 aa  299  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  25.04 
 
 
1177 aa  299  3e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  26.73 
 
 
1170 aa  297  8e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  26.87 
 
 
1199 aa  296  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  26.91 
 
 
1199 aa  292  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  26.91 
 
 
1199 aa  293  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  25.36 
 
 
1148 aa  292  3e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  28.37 
 
 
1187 aa  290  9e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  25.7 
 
 
1204 aa  290  1e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05899  Condensin subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J150]  26.87 
 
 
1179 aa  289  2e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.566819 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  25.48 
 
 
1180 aa  288  5e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  23.6 
 
 
1174 aa  284  6.000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  25.5 
 
 
1172 aa  283  2e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  26.28 
 
 
1167 aa  281  7e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59451  Chromosome segregation and condensation  25.04 
 
 
1171 aa  281  7e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.819288  decreased coverage  0.00000261165 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  26.05 
 
 
1176 aa  280  9e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46490  predicted protein  26.09 
 
 
1209 aa  279  2e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0173437 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  26.07 
 
 
1167 aa  279  2e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  26.07 
 
 
1167 aa  279  2e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  25.33 
 
 
1082 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  26.1 
 
 
1167 aa  274  7e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  25.34 
 
 
1176 aa  271  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  24.59 
 
 
1178 aa  270  1e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64147  Structural maintenance of chromosome protein 1 (sister chromatid cohesion complex Cohesin, subunit SMC1)  25.38 
 
 
1240 aa  268  5e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.471232 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  23.86 
 
 
1153 aa  266  1e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  25.71 
 
 
1173 aa  258  5e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  25.65 
 
 
1176 aa  256  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  26.41 
 
 
1185 aa  255  4.0000000000000004e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06364  Chromosome segregation protein sudA (DA-box protein sudA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00737]  23.81 
 
 
1215 aa  254  8.000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  25.36 
 
 
1185 aa  253  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  25.84 
 
 
1176 aa  253  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  25.74 
 
 
1134 aa  251  6e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>