More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2255 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  41.51 
 
 		 1190 aa  809    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  62.78 
 
 		 1207 aa  1485    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  46.8 
 
 		 1196 aa  1092    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  59.87 
 
 		 1183 aa  1432    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  43.32 
 
 		 1208 aa  831    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  42.53 
 
 		 1226 aa  817    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  42.34 
 
 		 1226 aa  816    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  86.88 
 
 		 1204 aa  2017    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  46.18 
 
 		 1196 aa  1070    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2255  condensin subunit Smc  100 
 
 		 1202 aa  2360    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.204212 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  45.68 
 
 		 1196 aa  1064    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  60.3 
 
 		 1201 aa  1472    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  43.1 
 
 		 1198 aa  764    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03271  hypothetical protein  75.53 
 
 		 1184 aa  1616    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  41.57 
 
 		 1217 aa  835    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  45.8 
 
 		 1194 aa  1065    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  40.89 
 
 		 1219 aa  821    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  32.57 
 
 		 1175 aa  526  1e-148  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  31.37 
 
 		 1174 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  33.15 
 
 		 1171 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  33.23 
 
 		 1192 aa  490  1e-137  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  32.36 
 
 		 1189 aa  486  1e-135  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  32.17 
 
 		 1193 aa  476  1e-132  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  32.55 
 
 		 1147 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  32.08 
 
 		 1146 aa  464  1e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  32.46 
 
 		 1188 aa  460  9.999999999999999e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  29.57 
 
 		 1146 aa  432  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  26.08 
 
 		 1191 aa  382  1e-104  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  27.19 
 
 		 1172 aa  372  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  26.04 
 
 		 1189 aa  349  2e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2045  condensin subunit Smc  55.19 
 
 		 1195 aa  345  4e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  25.39 
 
 		 1189 aa  340  9.999999999999999e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  25.96 
 
 		 1189 aa  339  1.9999999999999998e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  34.29 
 
 		 1146 aa  317  9.999999999999999e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  27.11 
 
 		 1187 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  25.51 
 
 		 1185 aa  306  2.0000000000000002e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  26.87 
 
 		 1189 aa  284  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  24.65 
 
 		 1188 aa  284  7.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  24.65 
 
 		 1188 aa  284  7.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  26.11 
 
 		 1189 aa  280  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  26.05 
 
 		 1189 aa  277  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  26.05 
 
 		 1189 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  25.9 
 
 		 1189 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  26.05 
 
 		 1189 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  25.97 
 
 		 1189 aa  276  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  26.49 
 
 		 1189 aa  274  7e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  28.32 
 
 		 1198 aa  274  9e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  26.09 
 
 		 1189 aa  273  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  26.09 
 
 		 1189 aa  273  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  25.29 
 
 		 1185 aa  272  2e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  26.07 
 
 		 1189 aa  269  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  27.58 
 
 		 1187 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  26.42 
 
 		 1187 aa  266  2e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  23.59 
 
 		 1190 aa  260  1e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  23.39 
 
 		 1196 aa  255  4.0000000000000004e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  24.13 
 
 		 1191 aa  254  5.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  24.29 
 
 		 1189 aa  253  2e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  25.9 
 
 		 1184 aa  248  4e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  25.08 
 
 		 1186 aa  243  1e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  24.73 
 
 		 1174 aa  241  5e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  26.19 
 
 		 1186 aa  241  6.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  25.18 
 
 		 1177 aa  236  3e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  23.11 
 
 		 1178 aa  233  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  22.95 
 
 		 1164 aa  232  3e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  21.88 
 
 		 1190 aa  231  5e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  26.28 
 
 		 1148 aa  230  1e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  24.07 
 
 		 1148 aa  228  8e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  25.06 
 
 		 1204 aa  221  8.999999999999998e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  25.3 
 
 		 1186 aa  214  5.999999999999999e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  22.45 
 
 		 1177 aa  212  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  21.51 
 
 		 1180 aa  213  3e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59451  Chromosome segregation and condensation  22.67 
 
 		 1171 aa  212  4e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.819288  decreased coverage  0.00000261165 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  24.78 
 
 		 1185 aa  211  6e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  23.04 
 
 		 1174 aa  210  1e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  27.29 
 
 		 1175 aa  209  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  22.25 
 
 		 1172 aa  208  4e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  21.12 
 
 		 1153 aa  206  2e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  24.32 
 
 		 1189 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0765  chromosome segregation protein SMC  27.91 
 
 		 1189 aa  201  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.430738 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  50.28 
 
 		 1149 aa  201  7e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  24.68 
 
 		 1181 aa  201  9e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06364  Chromosome segregation protein sudA (DA-box protein sudA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00737]  24.36 
 
 		 1215 aa  200  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  23.73 
 
 		 1170 aa  200  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  44.68 
 
 		 1196 aa  199  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  21.67 
 
 		 1174 aa  194  6e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  31.03 
 
 		 1187 aa  194  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  26.68 
 
 		 1177 aa  193  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  24.96 
 
 		 1185 aa  189  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  26.83 
 
 		 1173 aa  188  7e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  24.82 
 
 		 1185 aa  186  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  23.01 
 
 		 1176 aa  186  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  24.09 
 
 		 1175 aa  184  7e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  24.4 
 
 		 1168 aa  184  9.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  25.06 
 
 		 1190 aa  182  4.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  40.58 
 
 		 1184 aa  181  9e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  26.21 
 
 		 1403 aa  171  8e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  24.73 
 
 		 1170 aa  166  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  27.43 
 
 		 1134 aa  163  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  24.85 
 
 		 1308 aa  155  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  27.95 
 
 		 1179 aa  152  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>