More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_01211 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  100 
 
 
1201 aa  2418    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  49.09 
 
 
1196 aa  1046    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  48.52 
 
 
1194 aa  1015    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  39.83 
 
 
1226 aa  747    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  39.37 
 
 
1226 aa  742    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  98.48 
 
 
1183 aa  2340    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  39.19 
 
 
1190 aa  766    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  39.07 
 
 
1208 aa  790    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03271  hypothetical protein  61.06 
 
 
1184 aa  1379    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  59.54 
 
 
1204 aa  1410    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2255  condensin subunit Smc  60.3 
 
 
1202 aa  1377    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.204212 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  39.54 
 
 
1217 aa  807    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  49.43 
 
 
1196 aa  1033    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  61.45 
 
 
1207 aa  1432    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  38.96 
 
 
1198 aa  729    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  38.32 
 
 
1219 aa  754    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  48.68 
 
 
1196 aa  1038    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  32.63 
 
 
1175 aa  511  1e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  32.3 
 
 
1193 aa  489  1e-136  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  32.22 
 
 
1171 aa  486  1e-136  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  31.35 
 
 
1189 aa  462  9.999999999999999e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  30.65 
 
 
1146 aa  452  1e-125  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  30.11 
 
 
1146 aa  452  1e-125  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  31.19 
 
 
1149 aa  446  1e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  30.59 
 
 
1188 aa  434  1e-120  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  29.17 
 
 
1172 aa  381  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  27.46 
 
 
1146 aa  378  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  27.32 
 
 
1189 aa  330  8e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2045  condensin subunit Smc  55.59 
 
 
1195 aa  326  1e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265343  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  26.5 
 
 
1189 aa  324  7e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  26.45 
 
 
1185 aa  299  2e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  32.53 
 
 
1192 aa  284  8.000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  25.16 
 
 
1190 aa  277  8e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  25.57 
 
 
1187 aa  276  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  24.65 
 
 
1188 aa  262  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  24.65 
 
 
1188 aa  262  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  25.7 
 
 
1189 aa  255  4.0000000000000004e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  25 
 
 
1189 aa  246  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  24.38 
 
 
1191 aa  244  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  25.27 
 
 
1196 aa  242  4e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  24.37 
 
 
1187 aa  239  3e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  24.42 
 
 
1190 aa  230  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  24.71 
 
 
1179 aa  223  1.9999999999999999e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  28.64 
 
 
1148 aa  221  6e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  49.28 
 
 
1174 aa  220  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  24.61 
 
 
1164 aa  216  1.9999999999999998e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  24.53 
 
 
1170 aa  211  5e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  24.25 
 
 
1180 aa  211  6e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  49.75 
 
 
1196 aa  208  4e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06364  Chromosome segregation protein sudA (DA-box protein sudA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00737]  24.81 
 
 
1215 aa  203  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  23.72 
 
 
1153 aa  203  1.9999999999999998e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  23.22 
 
 
1177 aa  203  1.9999999999999998e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  23.69 
 
 
1199 aa  202  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  22.33 
 
 
1178 aa  202  3.9999999999999996e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  23.28 
 
 
1170 aa  200  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  24.15 
 
 
1174 aa  199  2.0000000000000003e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  27.58 
 
 
1198 aa  199  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  23.91 
 
 
1174 aa  195  6e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  26.44 
 
 
1189 aa  193  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  24.96 
 
 
1179 aa  192  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04597  nuclear condensin complex subunit Smc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02170)  24.11 
 
 
1476 aa  191  5.999999999999999e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  26.86 
 
 
1189 aa  189  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  26.73 
 
 
1189 aa  189  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  26.73 
 
 
1189 aa  189  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  26.69 
 
 
1189 aa  188  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  26.73 
 
 
1189 aa  188  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  26.86 
 
 
1189 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  26.86 
 
 
1189 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  26.61 
 
 
1189 aa  186  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05899  Condensin subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J150]  24.15 
 
 
1179 aa  183  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.566819 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59451  Chromosome segregation and condensation  24.22 
 
 
1171 aa  177  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.819288  decreased coverage  0.00000261165 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  40.25 
 
 
1191 aa  176  2.9999999999999996e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  25.58 
 
 
1186 aa  174  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  25.22 
 
 
1185 aa  172  4e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46490  predicted protein  23.09 
 
 
1209 aa  171  6e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0173437 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  22.23 
 
 
1175 aa  171  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  40 
 
 
1184 aa  166  2.0000000000000002e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  38.91 
 
 
1189 aa  161  6e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  25.07 
 
 
1174 aa  160  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  25.93 
 
 
1186 aa  160  1e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  38.91 
 
 
1189 aa  160  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  22.56 
 
 
1168 aa  156  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25506  predicted protein  24.83 
 
 
1237 aa  154  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  24.73 
 
 
1199 aa  151  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64147  Structural maintenance of chromosome protein 1 (sister chromatid cohesion complex Cohesin, subunit SMC1)  24.8 
 
 
1240 aa  149  2.0000000000000003e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.471232 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  24.45 
 
 
1199 aa  150  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  24.04 
 
 
1167 aa  150  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_52607  predicted protein  23.2 
 
 
1232 aa  147  9e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  40.18 
 
 
1195 aa  147  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  40.18 
 
 
1195 aa  147  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  40.1 
 
 
1147 aa  146  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  38.14 
 
 
1217 aa  145  6e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  39.29 
 
 
1194 aa  144  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  39.82 
 
 
1194 aa  144  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  27.17 
 
 
1185 aa  142  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  22.83 
 
 
1403 aa  142  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  41.29 
 
 
1194 aa  140  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  37.61 
 
 
1205 aa  139  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02640  cohesin complex subunit psm1, putative  24.5 
 
 
1202 aa  135  6e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  38.46 
 
 
1227 aa  135  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>