More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1012 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  100 
 
 
1149 aa  2328    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  46.89 
 
 
1146 aa  1003    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  40.81 
 
 
1146 aa  825    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  45.68 
 
 
1147 aa  945    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  46.13 
 
 
1146 aa  981    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  35.54 
 
 
1175 aa  595  1e-168  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  34 
 
 
1192 aa  587  1e-166  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  35.45 
 
 
1174 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  33.11 
 
 
1193 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  33.42 
 
 
1171 aa  558  1e-157  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  33.58 
 
 
1189 aa  558  1e-157  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  31.6 
 
 
1219 aa  499  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  30.45 
 
 
1217 aa  488  1e-136  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  29.98 
 
 
1226 aa  475  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  30.02 
 
 
1226 aa  472  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  31.29 
 
 
1208 aa  463  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  31.19 
 
 
1201 aa  446  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  30.2 
 
 
1196 aa  442  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  30.73 
 
 
1196 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  30.65 
 
 
1194 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  30.97 
 
 
1196 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  30.78 
 
 
1183 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  29.19 
 
 
1172 aa  409  1.0000000000000001e-112  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  29.82 
 
 
1189 aa  391  1e-107  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  29.54 
 
 
1189 aa  385  1e-105  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  36.44 
 
 
1188 aa  377  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  28.99 
 
 
1189 aa  378  1e-103  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  37.12 
 
 
1196 aa  349  1e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  33.38 
 
 
1190 aa  342  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  34.15 
 
 
1198 aa  335  4e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  27.74 
 
 
1190 aa  318  3e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03271  hypothetical protein  33.1 
 
 
1184 aa  310  6.999999999999999e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  32.5 
 
 
1204 aa  308  4.0000000000000004e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  32.49 
 
 
1207 aa  304  7.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  25.53 
 
 
1185 aa  297  7e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  29.33 
 
 
1184 aa  295  3e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  25.14 
 
 
1185 aa  289  2e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  24.88 
 
 
1177 aa  284  6.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  24.26 
 
 
1189 aa  281  4e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  25.14 
 
 
1191 aa  279  2e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  23.95 
 
 
1189 aa  277  9e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  24.03 
 
 
1189 aa  277  9e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  23.95 
 
 
1189 aa  277  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  23.95 
 
 
1189 aa  277  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  25.04 
 
 
1198 aa  275  4.0000000000000004e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  24.01 
 
 
1189 aa  274  6e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  24.37 
 
 
1189 aa  273  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  25.65 
 
 
1190 aa  272  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  23.87 
 
 
1189 aa  272  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  30.09 
 
 
1191 aa  268  5e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  24.12 
 
 
1188 aa  265  4e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  24.12 
 
 
1188 aa  265  4e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  24.67 
 
 
1180 aa  263  2e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  24.92 
 
 
1174 aa  262  2e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  25.32 
 
 
1175 aa  262  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  27.47 
 
 
1148 aa  261  5.0000000000000005e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  25.35 
 
 
1184 aa  257  1.0000000000000001e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  22.75 
 
 
1174 aa  253  1e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  24.16 
 
 
1178 aa  253  2e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  24.59 
 
 
1176 aa  251  7e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  24.21 
 
 
1179 aa  251  8e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  24.67 
 
 
1170 aa  249  2e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  23.48 
 
 
1191 aa  247  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  24.63 
 
 
1176 aa  244  7.999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  24.79 
 
 
1164 aa  241  5.999999999999999e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  24.53 
 
 
1176 aa  238  4e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_006686  CND02930  chromosome associated protein, putative  25.02 
 
 
1208 aa  237  9e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.828344  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  24.57 
 
 
1177 aa  233  2e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  31.5 
 
 
1189 aa  228  7e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05899  Condensin subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J150]  24.88 
 
 
1179 aa  224  9.999999999999999e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.566819 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  25.88 
 
 
1167 aa  223  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_52607  predicted protein  24.4 
 
 
1232 aa  219  2.9999999999999998e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  25.3 
 
 
1181 aa  218  8e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  23.82 
 
 
1177 aa  217  9.999999999999999e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  23.98 
 
 
1186 aa  214  5.999999999999999e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  23.32 
 
 
1169 aa  211  5e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  22.55 
 
 
1168 aa  210  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  24.12 
 
 
1134 aa  210  1e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04597  nuclear condensin complex subunit Smc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02170)  24.26 
 
 
1476 aa  208  4e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2045  condensin subunit Smc  52.17 
 
 
1195 aa  209  4e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265343  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  25 
 
 
1162 aa  206  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46490  predicted protein  23.68 
 
 
1209 aa  206  2e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0173437 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59451  Chromosome segregation and condensation  23.01 
 
 
1171 aa  206  3e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.819288  decreased coverage  0.00000261165 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  24.92 
 
 
1185 aa  205  4e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  25.23 
 
 
1185 aa  204  6e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  22.81 
 
 
1164 aa  203  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  22.52 
 
 
1175 aa  201  7.999999999999999e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  25.89 
 
 
1403 aa  201  7.999999999999999e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2255  condensin subunit Smc  50.28 
 
 
1202 aa  191  8e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.204212 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  26.27 
 
 
1199 aa  180  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  25.53 
 
 
1199 aa  178  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  26.15 
 
 
1199 aa  178  7e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  25.67 
 
 
1170 aa  177  8e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  26.82 
 
 
1187 aa  175  3.9999999999999995e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  25.77 
 
 
1176 aa  172  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_242  predicted protein  26.4 
 
 
1224 aa  168  6.9999999999999995e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06364  Chromosome segregation protein sudA (DA-box protein sudA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00737]  24.43 
 
 
1215 aa  167  9e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  27.58 
 
 
1201 aa  159  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25506  predicted protein  24.33 
 
 
1237 aa  154  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  25.37 
 
 
1186 aa  153  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>