More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1831 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 
1147 aa  2293    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  56.89 
 
 
1146 aa  1254    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  45.53 
 
 
1146 aa  958    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  36.74 
 
 
1192 aa  636    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  37.44 
 
 
1188 aa  660    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  35.46 
 
 
1174 aa  647    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  58.59 
 
 
1146 aa  1304    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  45.71 
 
 
1149 aa  969    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  36.18 
 
 
1175 aa  633  1e-180  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  35.91 
 
 
1193 aa  617  1e-175  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  35.23 
 
 
1189 aa  599  1e-170  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  35.3 
 
 
1171 aa  600  1e-170  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  35.74 
 
 
1196 aa  583  1.0000000000000001e-165  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  32.12 
 
 
1190 aa  528  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  31.31 
 
 
1217 aa  504  1e-141  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  31.74 
 
 
1219 aa  498  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  32.49 
 
 
1226 aa  495  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  32.78 
 
 
1226 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  30.4 
 
 
1196 aa  468  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  31.36 
 
 
1184 aa  464  1e-129  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  30.99 
 
 
1196 aa  460  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  30.93 
 
 
1194 aa  460  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  30.44 
 
 
1196 aa  461  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  30.04 
 
 
1201 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  31.47 
 
 
1207 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2255  condensin subunit Smc  31.65 
 
 
1202 aa  443  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.204212 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  29.76 
 
 
1183 aa  436  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  28.77 
 
 
1189 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  28.54 
 
 
1189 aa  394  1e-108  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  28.56 
 
 
1189 aa  385  1e-105  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  34.8 
 
 
1198 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  27.59 
 
 
1189 aa  373  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  28.28 
 
 
1172 aa  372  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  32.93 
 
 
1208 aa  348  4e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  27.16 
 
 
1187 aa  338  5e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  33.42 
 
 
1204 aa  333  9e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  25.12 
 
 
1188 aa  313  9e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  25.12 
 
 
1188 aa  313  9e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  26.91 
 
 
1189 aa  313  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03271  hypothetical protein  33.2 
 
 
1184 aa  311  4e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  26.35 
 
 
1189 aa  303  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  25.14 
 
 
1189 aa  303  2e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  25.44 
 
 
1189 aa  301  4e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  26.38 
 
 
1189 aa  299  3e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  24.88 
 
 
1196 aa  296  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  26.12 
 
 
1190 aa  295  4e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  27.74 
 
 
1187 aa  293  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  25.96 
 
 
1189 aa  292  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  25.96 
 
 
1185 aa  292  2e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  27.81 
 
 
1174 aa  292  3e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  25.99 
 
 
1189 aa  291  4e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  25.99 
 
 
1189 aa  291  4e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  25.95 
 
 
1189 aa  291  7e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  24.79 
 
 
1186 aa  285  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  25.89 
 
 
1186 aa  283  2e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  24.9 
 
 
1185 aa  276  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  24.55 
 
 
1191 aa  266  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  24.83 
 
 
1187 aa  263  2e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  27.69 
 
 
1148 aa  261  5.0000000000000005e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  25.95 
 
 
1177 aa  260  9e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  27.38 
 
 
1199 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  23.82 
 
 
1190 aa  259  3e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  27.18 
 
 
1199 aa  258  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  27.54 
 
 
1199 aa  258  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  27.96 
 
 
1191 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  25.24 
 
 
1184 aa  257  1.0000000000000001e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  25.78 
 
 
1177 aa  252  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  23.93 
 
 
1174 aa  251  5e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  25.68 
 
 
1175 aa  249  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  25.08 
 
 
1179 aa  248  4.9999999999999997e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  24.43 
 
 
1175 aa  246  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  24.19 
 
 
1204 aa  246  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  23.96 
 
 
1177 aa  246  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  26.33 
 
 
1176 aa  244  6e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  26.32 
 
 
1176 aa  242  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  26.1 
 
 
1191 aa  241  5e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  25.25 
 
 
1170 aa  241  5.999999999999999e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  24.78 
 
 
1170 aa  240  9e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0765  chromosome segregation protein SMC  26.6 
 
 
1189 aa  241  9e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.430738 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  25 
 
 
1180 aa  238  7e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  22.6 
 
 
1174 aa  236  2.0000000000000002e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  26.59 
 
 
1176 aa  235  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  24.24 
 
 
1173 aa  229  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  27.65 
 
 
1201 aa  229  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  25.31 
 
 
1172 aa  229  3e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  26.54 
 
 
1177 aa  227  8e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  25.08 
 
 
1181 aa  227  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_52607  predicted protein  25.06 
 
 
1232 aa  224  9e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59451  Chromosome segregation and condensation  23.84 
 
 
1171 aa  224  9.999999999999999e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.819288  decreased coverage  0.00000261165 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  24.4 
 
 
1148 aa  219  2.9999999999999998e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  23.69 
 
 
1164 aa  217  9e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04597  nuclear condensin complex subunit Smc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02170)  24.18 
 
 
1476 aa  217  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  23.24 
 
 
1178 aa  216  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06364  Chromosome segregation protein sudA (DA-box protein sudA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00737]  23.65 
 
 
1215 aa  216  2.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  23.31 
 
 
1169 aa  216  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  23.23 
 
 
1169 aa  213  1e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46490  predicted protein  24.38 
 
 
1209 aa  213  2e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0173437 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  26.04 
 
 
1403 aa  209  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  24.12 
 
 
1195 aa  209  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2045  condensin subunit Smc  51.53 
 
 
1195 aa  208  5e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265343  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>