More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0651 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  100 
 
 
1174 aa  2360    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  25.02 
 
 
1189 aa  303  9e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  25.81 
 
 
1189 aa  301  6e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  25.82 
 
 
1188 aa  301  7e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  25.77 
 
 
1174 aa  298  3e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  25.12 
 
 
1171 aa  298  4e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  25.76 
 
 
1193 aa  295  3e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  25.77 
 
 
1175 aa  294  6e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  24.72 
 
 
1189 aa  290  1e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  24.94 
 
 
1190 aa  285  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  24.65 
 
 
1226 aa  278  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  24.75 
 
 
1226 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  24.59 
 
 
1189 aa  275  3e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  25.71 
 
 
1184 aa  270  1e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  25.48 
 
 
1146 aa  269  2e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  24.34 
 
 
1172 aa  268  5e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  24.1 
 
 
1146 aa  267  8e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  24.9 
 
 
1217 aa  266  1e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  24.31 
 
 
1185 aa  266  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  24.3 
 
 
1191 aa  266  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  23.8 
 
 
1187 aa  263  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  25.23 
 
 
1146 aa  258  6e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  25.18 
 
 
1196 aa  249  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  24.96 
 
 
1186 aa  248  4e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  22.93 
 
 
1185 aa  244  9e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  24.02 
 
 
1190 aa  243  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  23.84 
 
 
1147 aa  240  1e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  22.88 
 
 
1190 aa  235  3e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  24.54 
 
 
1198 aa  232  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  24.51 
 
 
1184 aa  229  2e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  25.34 
 
 
1194 aa  229  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  23.38 
 
 
1189 aa  226  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  23.22 
 
 
1189 aa  226  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  22.96 
 
 
1164 aa  225  4.9999999999999996e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  24.2 
 
 
1174 aa  224  6e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  22.95 
 
 
1189 aa  223  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  23.67 
 
 
1173 aa  221  7e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  22.17 
 
 
1187 aa  219  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  23.97 
 
 
1196 aa  215  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  24.21 
 
 
1186 aa  214  5.999999999999999e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  23.79 
 
 
1196 aa  214  7e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  21.91 
 
 
1189 aa  214  7.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  24.05 
 
 
1170 aa  214  9e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  24.23 
 
 
1180 aa  214  9e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  24.32 
 
 
1178 aa  213  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  22.68 
 
 
1189 aa  212  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  22.68 
 
 
1189 aa  212  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  23.55 
 
 
1187 aa  212  4e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  23.13 
 
 
1189 aa  211  7e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  23.05 
 
 
1189 aa  211  7e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  23.13 
 
 
1189 aa  211  7e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  23.05 
 
 
1189 aa  211  7e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  23.35 
 
 
1177 aa  211  7e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  23.2 
 
 
1174 aa  210  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  23.05 
 
 
1189 aa  210  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  24.84 
 
 
1196 aa  207  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46490  predicted protein  23.27 
 
 
1209 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0173437 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  24.68 
 
 
1153 aa  196  2e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  22.4 
 
 
1162 aa  195  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  23.91 
 
 
1201 aa  195  5e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  23.15 
 
 
1204 aa  194  7e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  22.91 
 
 
1164 aa  194  7e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  22.77 
 
 
1181 aa  194  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  25.06 
 
 
1179 aa  192  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  22.19 
 
 
1199 aa  190  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  22.19 
 
 
1199 aa  191  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  22.9 
 
 
1172 aa  190  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  23.11 
 
 
1164 aa  188  6e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  21.77 
 
 
1175 aa  187  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  22.73 
 
 
1175 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  22.72 
 
 
1179 aa  183  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  22.6 
 
 
1171 aa  183  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  23.76 
 
 
1208 aa  179  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  22.72 
 
 
1167 aa  178  5e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  22.84 
 
 
1167 aa  178  5e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  23.25 
 
 
1183 aa  175  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  21.81 
 
 
1134 aa  175  5e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  21.48 
 
 
1170 aa  175  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  21.42 
 
 
1171 aa  172  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02930  chromosome associated protein, putative  22.69 
 
 
1208 aa  172  4e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.828344  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  23.89 
 
 
1177 aa  172  5e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  21.48 
 
 
1176 aa  171  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04597  nuclear condensin complex subunit Smc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02170)  22.85 
 
 
1476 aa  168  5e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59451  Chromosome segregation and condensation  22.45 
 
 
1171 aa  167  1.0000000000000001e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.819288  decreased coverage  0.00000261165 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  24.67 
 
 
1175 aa  167  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  21.72 
 
 
1403 aa  165  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  25.26 
 
 
1196 aa  165  6e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  22.86 
 
 
1185 aa  162  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  21.62 
 
 
1175 aa  162  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05899  Condensin subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J150]  21.79 
 
 
1179 aa  161  6e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.566819 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  22.2 
 
 
1187 aa  161  8e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  21.44 
 
 
1171 aa  160  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  26.68 
 
 
1148 aa  159  3e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04180  nuclear condensin complex protein, putative  21.99 
 
 
1215 aa  157  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.360826  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  23.62 
 
 
1189 aa  153  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  25.69 
 
 
1177 aa  152  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf735  chromosome segregation ATPase Smc  26.66 
 
 
978 aa  151  6e-35  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  24.85 
 
 
1207 aa  148  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  22.92 
 
 
1188 aa  147  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  22.92 
 
 
1188 aa  147  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>